30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4941 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008759  Pnap_4941  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  781    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352373  normal  0.303567 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6002  hypothetical protein  30.4 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5504  hypothetical protein  30.98 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3189  hypothetical protein  31.95 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2791  hypothetical protein  31.95 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4340  hypothetical protein  28.11 
 
 		 371 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3387  hypothetical protein  29.2 
 
 		 384 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4114  hypothetical protein  28.73 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.96247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4294  hypothetical protein  25.21 
 
 		 387 aa  101  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1750  hypothetical protein  27.98 
 
 		 391 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130488 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4921  hypothetical protein  28.03 
 
 		 376 aa  95.5  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.640656  normal  0.943138 
 
 
-
 
NC_003296  RS05318  hypothetical protein  26.82 
 
 		 393 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0339389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5228  hypothetical protein  27.69 
 
 		 390 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34403  normal  0.033231 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4246  hypothetical protein  24.51 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4134  hypothetical protein  24.51 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3149  hypothetical protein  29.32 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2768  hypothetical protein  25.87 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4401  hypothetical protein  23.7 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.366288 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4032  hypothetical protein  32.49 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0132439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0645  hypothetical protein  24.47 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2228  hypothetical protein  25.48 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207313  normal  0.171513 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2362  hypothetical protein  28.76 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4090  hypothetical protein  26.29 
 
 		 386 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4981  hypothetical protein  24.7 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000297045 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1779  hypothetical protein  26.63 
 
 		 387 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00148709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4284  hypothetical protein  28.14 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0276  hypothetical protein  27.01 
 
 		 264 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0307  hypothetical protein  28.91 
 
 		 264 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0262  hypothetical protein  27.01 
 
 		 264 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2078  hypothetical protein  20.99 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>