28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4114 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4114  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  790    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.96247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3387  hypothetical protein  85.64 
 
 		 384 aa  676    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1750  hypothetical protein  98.72 
 
 		 391 aa  781    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130488 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5228  hypothetical protein  57.59 
 
 		 390 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34403  normal  0.033231 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4246  hypothetical protein  52 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4134  hypothetical protein  52 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_003296  RS05318  hypothetical protein  50.8 
 
 		 393 aa  371  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0339389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0645  hypothetical protein  41.69 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4032  hypothetical protein  40.85 
 
 		 395 aa  219  8.999999999999998e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0132439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4284  hypothetical protein  39.94 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4090  hypothetical protein  35.71 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2228  hypothetical protein  35.55 
 
 		 403 aa  196  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207313  normal  0.171513 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4401  hypothetical protein  35.34 
 
 		 393 aa  182  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.366288 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2768  hypothetical protein  37.5 
 
 		 390 aa  147  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4981  hypothetical protein  30.57 
 
 		 395 aa  143  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000297045 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2362  hypothetical protein  37.5 
 
 		 388 aa  140  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3149  hypothetical protein  33.16 
 
 		 396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1779  hypothetical protein  35.94 
 
 		 387 aa  139  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00148709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6002  hypothetical protein  28.83 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4340  hypothetical protein  30.29 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4941  hypothetical protein  28.73 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352373  normal  0.303567 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4921  hypothetical protein  27.66 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.640656  normal  0.943138 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5504  hypothetical protein  27.13 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4294  hypothetical protein  26.08 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4149  hypothetical protein  34.83 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.359659  normal  0.548977 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2791  hypothetical protein  30.59 
 
 		 287 aa  55.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3189  hypothetical protein  30.59 
 
 		 287 aa  55.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1746  hypothetical protein  23.6 
 
 		 373 aa  43.5  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000207576  normal  0.634791 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>