27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3387 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4114  hypothetical protein  85.64 
 
 
391 aa  676    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.96247  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3387  hypothetical protein  100 
 
 
384 aa  779    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1750  hypothetical protein  85.12 
 
 
391 aa  672    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.130488 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5228  hypothetical protein  56.35 
 
 
390 aa  431  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34403  normal  0.033231 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4246  hypothetical protein  50.13 
 
 
393 aa  362  6e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4134  hypothetical protein  50.13 
 
 
393 aa  362  6e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_003296  RS05318  hypothetical protein  49.73 
 
 
393 aa  359  5e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0339389  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4032  hypothetical protein  40.58 
 
 
395 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0132439  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0645  hypothetical protein  40.9 
 
 
377 aa  223  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4284  hypothetical protein  41.06 
 
 
389 aa  215  8e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2228  hypothetical protein  34.87 
 
 
403 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207313  normal  0.171513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4090  hypothetical protein  35.56 
 
 
386 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509512  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4401  hypothetical protein  34.03 
 
 
393 aa  179  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.366288 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3149  hypothetical protein  39.02 
 
 
396 aa  150  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1779  hypothetical protein  32.82 
 
 
387 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00148709  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2768  hypothetical protein  37.26 
 
 
390 aa  146  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2362  hypothetical protein  37.45 
 
 
388 aa  142  9e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4981  hypothetical protein  29.87 
 
 
395 aa  139  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000297045 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4941  hypothetical protein  29.36 
 
 
390 aa  103  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352373  normal  0.303567 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4340  hypothetical protein  30.33 
 
 
371 aa  101  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6002  hypothetical protein  27.53 
 
 
377 aa  95.9  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4921  hypothetical protein  26.36 
 
 
376 aa  86.3  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.640656  normal  0.943138 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5504  hypothetical protein  28.93 
 
 
377 aa  81.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4294  hypothetical protein  26.74 
 
 
387 aa  76.3  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4149  hypothetical protein  26.09 
 
 
208 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.359659  normal  0.548977 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2791  hypothetical protein  28.76 
 
 
287 aa  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3189  hypothetical protein  28.76 
 
 
287 aa  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>