31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6002 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6002  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  758    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4340  hypothetical protein  53.31 
 
 		 371 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4921  hypothetical protein  51.37 
 
 		 376 aa  360  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.640656  normal  0.943138 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5504  hypothetical protein  35.33 
 
 		 377 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3189  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  146  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2791  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  146  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4294  hypothetical protein  28.61 
 
 		 387 aa  136  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4941  hypothetical protein  30.75 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352373  normal  0.303567 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4114  hypothetical protein  28.83 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.96247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1750  hypothetical protein  28.57 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130488 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5228  hypothetical protein  29.35 
 
 		 390 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34403  normal  0.033231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3387  hypothetical protein  27.53 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05318  hypothetical protein  28.05 
 
 		 393 aa  92.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0339389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4401  hypothetical protein  29.04 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.366288 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4246  hypothetical protein  28.65 
 
 		 393 aa  82.8  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4134  hypothetical protein  28.65 
 
 		 393 aa  82.8  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2768  hypothetical protein  26.49 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4981  hypothetical protein  27.3 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000297045 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2362  hypothetical protein  26.34 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4032  hypothetical protein  25.85 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0132439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2228  hypothetical protein  23.99 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207313  normal  0.171513 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3149  hypothetical protein  30.94 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4284  hypothetical protein  33.82 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1779  hypothetical protein  26.42 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00148709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0645  hypothetical protein  24.87 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2078  hypothetical protein  22.03 
 
 		 390 aa  55.8  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  22.87 
 
 		 1868 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4090  hypothetical protein  28.22 
 
 		 386 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0746  hypothetical protein  30.84 
 
 		 396 aa  49.7  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1746  hypothetical protein  22.86 
 
 		 373 aa  46.6  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000207576  normal  0.634791 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2746  ATPase  28.71 
 
 		 387 aa  43.5  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0705142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>