29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4284 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4284  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  776    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4090  hypothetical protein  59.27 
 
 		 386 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2228  hypothetical protein  47.62 
 
 		 403 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207313  normal  0.171513 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0645  hypothetical protein  47.8 
 
 		 377 aa  314  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4401  hypothetical protein  38.62 
 
 		 393 aa  257  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.366288 
 
 
-
 
NC_003296  RS05318  hypothetical protein  42.67 
 
 		 393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0339389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4246  hypothetical protein  42.09 
 
 		 393 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4134  hypothetical protein  42.09 
 
 		 393 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1750  hypothetical protein  40.5 
 
 		 391 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3387  hypothetical protein  41.06 
 
 		 384 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4114  hypothetical protein  39.94 
 
 		 391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.96247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5228  hypothetical protein  38.74 
 
 		 390 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34403  normal  0.033231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4032  hypothetical protein  35.51 
 
 		 395 aa  186  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0132439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1779  hypothetical protein  33.42 
 
 		 387 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00148709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4981  hypothetical protein  32.29 
 
 		 395 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000297045 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2768  hypothetical protein  33.59 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2362  hypothetical protein  32.36 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3149  hypothetical protein  32.46 
 
 		 396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4149  hypothetical protein  40 
 
 		 208 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.359659  normal  0.548977 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6002  hypothetical protein  32.18 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5504  hypothetical protein  27.25 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4340  hypothetical protein  32.73 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2791  hypothetical protein  30.9 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3189  hypothetical protein  30.9 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4921  hypothetical protein  30.28 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.640656  normal  0.943138 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4294  hypothetical protein  31.41 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4941  hypothetical protein  26.52 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352373  normal  0.303567 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  21.45 
 
 		 1868 aa  50.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0746  hypothetical protein  24.75 
 
 		 396 aa  43.1  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>