27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2362 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2362  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  788    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4981  hypothetical protein  52.7 
 
 		 395 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000297045 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2768  hypothetical protein  53.12 
 
 		 390 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1779  hypothetical protein  50.52 
 
 		 387 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00148709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3149  hypothetical protein  52.13 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4246  hypothetical protein  34.14 
 
 		 393 aa  166  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4134  hypothetical protein  34.14 
 
 		 393 aa  166  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_003296  RS05318  hypothetical protein  33.33 
 
 		 393 aa  159  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0339389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2228  hypothetical protein  31.79 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207313  normal  0.171513 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0645  hypothetical protein  31.32 
 
 		 377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4401  hypothetical protein  29.06 
 
 		 393 aa  146  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.366288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5228  hypothetical protein  36.78 
 
 		 390 aa  143  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34403  normal  0.033231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3387  hypothetical protein  37.45 
 
 		 384 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4114  hypothetical protein  37.5 
 
 		 391 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.96247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1750  hypothetical protein  37.5 
 
 		 391 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130488 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4284  hypothetical protein  32.36 
 
 		 389 aa  139  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4090  hypothetical protein  30.15 
 
 		 386 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4032  hypothetical protein  34.82 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0132439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6002  hypothetical protein  26.34 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4340  hypothetical protein  29.84 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4941  hypothetical protein  28.76 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352373  normal  0.303567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4149  hypothetical protein  29.41 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.359659  normal  0.548977 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4921  hypothetical protein  25.6 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.640656  normal  0.943138 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2791  hypothetical protein  27.75 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3189  hypothetical protein  27.75 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5504  hypothetical protein  28 
 
 		 377 aa  53.9  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4294  hypothetical protein  26.49 
 
 		 387 aa  52.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>