28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4340 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4340  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  754    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4921  hypothetical protein  52.88 
 
 		 376 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.640656  normal  0.943138 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6002  hypothetical protein  53.31 
 
 		 377 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5504  hypothetical protein  35.75 
 
 		 377 aa  176  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3189  hypothetical protein  38.98 
 
 		 287 aa  150  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2791  hypothetical protein  38.98 
 
 		 287 aa  150  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4294  hypothetical protein  30.4 
 
 		 387 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1750  hypothetical protein  30.03 
 
 		 391 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4114  hypothetical protein  30.29 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.96247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5228  hypothetical protein  30.33 
 
 		 390 aa  102  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34403  normal  0.033231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3387  hypothetical protein  30.33 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4941  hypothetical protein  28.11 
 
 		 390 aa  95.1  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352373  normal  0.303567 
 
 
-
 
NC_003296  RS05318  hypothetical protein  29.92 
 
 		 393 aa  90.9  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0339389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4246  hypothetical protein  30.53 
 
 		 393 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4134  hypothetical protein  30.53 
 
 		 393 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4981  hypothetical protein  29.12 
 
 		 395 aa  86.7  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000297045 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3149  hypothetical protein  31.09 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4032  hypothetical protein  25.07 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0132439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2768  hypothetical protein  31.84 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0645  hypothetical protein  27.98 
 
 		 377 aa  72  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2362  hypothetical protein  29.84 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1779  hypothetical protein  28.41 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00148709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4401  hypothetical protein  24.55 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.366288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4090  hypothetical protein  24.01 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509512  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2078  hypothetical protein  23.93 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4284  hypothetical protein  29.77 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2228  hypothetical protein  31.63 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207313  normal  0.171513 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0746  hypothetical protein  30.73 
 
 		 396 aa  43.5  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>