28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4981 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_4981  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  796    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000297045 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2768  hypothetical protein  80.88 
 
 		 390 aa  617  1e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1779  hypothetical protein  61.42 
 
 		 387 aa  461  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00148709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3149  hypothetical protein  55.2 
 
 		 396 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2362  hypothetical protein  52.7 
 
 		 388 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0645  hypothetical protein  35.4 
 
 		 377 aa  182  9.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05318  hypothetical protein  32.63 
 
 		 393 aa  163  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0339389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4246  hypothetical protein  32.45 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4134  hypothetical protein  32.45 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4090  hypothetical protein  30.97 
 
 		 386 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4401  hypothetical protein  31.61 
 
 		 393 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.366288 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4284  hypothetical protein  32.29 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5228  hypothetical protein  31.76 
 
 		 390 aa  143  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34403  normal  0.033231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4114  hypothetical protein  30.57 
 
 		 391 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.96247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1750  hypothetical protein  30.43 
 
 		 391 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3387  hypothetical protein  29.87 
 
 		 384 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2228  hypothetical protein  31.27 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207313  normal  0.171513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4032  hypothetical protein  30.83 
 
 		 395 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0132439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4340  hypothetical protein  29.12 
 
 		 371 aa  86.7  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6002  hypothetical protein  27.3 
 
 		 377 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2791  hypothetical protein  26.12 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3189  hypothetical protein  26.12 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5504  hypothetical protein  31.17 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4294  hypothetical protein  21.98 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4941  hypothetical protein  24.7 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352373  normal  0.303567 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4921  hypothetical protein  24.03 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.640656  normal  0.943138 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  22.01 
 
 		 1868 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4149  hypothetical protein  25.94 
 
 		 208 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.359659  normal  0.548977 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>