28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_4294 on replicon NC_008738
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008738  Maqu_4294  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  793    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3189  hypothetical protein  38.06 
 
 
287 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2791  hypothetical protein  38.06 
 
 
287 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4340  hypothetical protein  30.4 
 
 
371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4921  hypothetical protein  31.27 
 
 
376 aa  146  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.640656  normal  0.943138 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5504  hypothetical protein  28.46 
 
 
377 aa  139  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6002  hypothetical protein  28.61 
 
 
377 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4941  hypothetical protein  25.21 
 
 
390 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352373  normal  0.303567 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4401  hypothetical protein  24.04 
 
 
393 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.366288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1750  hypothetical protein  25.67 
 
 
391 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.130488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4114  hypothetical protein  26.08 
 
 
391 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.96247  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3387  hypothetical protein  26.74 
 
 
384 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5228  hypothetical protein  26.62 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34403  normal  0.033231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4032  hypothetical protein  28.64 
 
 
395 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0132439  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4246  hypothetical protein  24.69 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4134  hypothetical protein  24.69 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_003296  RS05318  hypothetical protein  24.43 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0339389  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0645  hypothetical protein  25.34 
 
 
377 aa  64.3  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4090  hypothetical protein  30.18 
 
 
386 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509512  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4981  hypothetical protein  21.98 
 
 
395 aa  60.1  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000297045 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1779  hypothetical protein  25.2 
 
 
387 aa  53.1  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00148709  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2768  hypothetical protein  23.12 
 
 
390 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2362  hypothetical protein  26.49 
 
 
388 aa  52.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3149  hypothetical protein  26.85 
 
 
396 aa  50.8  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2228  hypothetical protein  28.5 
 
 
403 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207313  normal  0.171513 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4284  hypothetical protein  30.73 
 
 
389 aa  47.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.51 
 
 
1868 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2078  hypothetical protein  20.95 
 
 
390 aa  45.8  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>