28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2791 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_3189  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  589  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2791  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  589  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4294  hypothetical protein  38.06 
 
 		 387 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4921  hypothetical protein  35.07 
 
 		 376 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.640656  normal  0.943138 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4340  hypothetical protein  38.98 
 
 		 371 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6002  hypothetical protein  33.33 
 
 		 377 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5504  hypothetical protein  34.11 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4941  hypothetical protein  32.13 
 
 		 390 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352373  normal  0.303567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5228  hypothetical protein  30.4 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34403  normal  0.033231 
 
 
-
 
NC_003296  RS05318  hypothetical protein  30.23 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0339389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4981  hypothetical protein  26.12 
 
 		 395 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000297045 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2768  hypothetical protein  28.57 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4246  hypothetical protein  29.35 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4134  hypothetical protein  29.35 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2228  hypothetical protein  30.14 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207313  normal  0.171513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4032  hypothetical protein  27.63 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0132439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2362  hypothetical protein  27.75 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1779  hypothetical protein  26.75 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00148709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4401  hypothetical protein  26.01 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.366288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1750  hypothetical protein  30.49 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130488 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3149  hypothetical protein  26.61 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4114  hypothetical protein  30.59 
 
 		 391 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.96247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4090  hypothetical protein  25.67 
 
 		 386 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.87 
 
 		 1868 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3387  hypothetical protein  28.76 
 
 		 384 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4284  hypothetical protein  30.57 
 
 		 389 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0945  ATPase  24.07 
 
 		 364 aa  46.2  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0645  hypothetical protein  24.14 
 
 		 377 aa  42.7  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>