More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0976 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0976  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  100 
 
 
278 aa  528  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.643187 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00240  biotin--protein ligase  36.57 
 
 
321 aa  122  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0132  biotin--protein ligase  34.14 
 
 
320 aa  120  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000234608  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2082  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.26 
 
 
329 aa  112  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4072  biotin--protein ligase  32.5 
 
 
319 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0184  biotin--protein ligase  32.08 
 
 
319 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.570128  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4334  biotin--protein ligase  29.39 
 
 
320 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.152634  hitchhiker  0.00000000217796 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002163  biotin-protein ligase/biotin operon repressor  33.21 
 
 
321 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4174  biotin--protein ligase  32.08 
 
 
319 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000228488  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2717  biotin--protein ligase  32.71 
 
 
320 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000120108  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0180  biotin--protein ligase  32.08 
 
 
319 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0210584  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0188  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.07 
 
 
269 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2876  biotin--protein ligase  31.73 
 
 
319 aa  106  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3652  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  41.15 
 
 
277 aa  106  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0948912  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0142  biotin--protein ligase  31.27 
 
 
319 aa  105  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.330287  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4706  biotin--protein ligase  28.41 
 
 
320 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.144079  hitchhiker  0.00201782 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3998  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.82 
 
 
328 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00153965  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0219  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.46 
 
 
322 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.440436  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3871  biotin--protein ligase  34.02 
 
 
319 aa  99.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000364778  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3396  biotin--protein ligase  34.02 
 
 
319 aa  99.8  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.199101  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0327  biotin--protein ligase  34.02 
 
 
319 aa  99.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0364706  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0154  biotin--protein ligase  31.28 
 
 
323 aa  99  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00266236  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0197  biotin--protein ligase  34.82 
 
 
317 aa  99  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00143406  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0214  biotin--protein ligase  29.75 
 
 
319 aa  98.2  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1781  birA bifunctional protein  43.12 
 
 
331 aa  97.4  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3775  biotin--protein ligase  29.58 
 
 
319 aa  97.8  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00231404  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0168  biotin--protein ligase  29.22 
 
 
320 aa  97.4  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00063361  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0822  biotin-[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  25.78 
 
 
333 aa  96.3  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0847  biotin-[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  25.98 
 
 
331 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0875  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.06 
 
 
325 aa  95.1  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107744  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08620  biotin--protein ligase  35.77 
 
 
312 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000664696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0467  biotin--protein ligase  34.77 
 
 
319 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800228  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1229  biotin--protein ligase  35.59 
 
 
317 aa  94  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1136  biotin--protein ligase  35.08 
 
 
317 aa  93.6  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3926  biotin--protein ligase  34.31 
 
 
321 aa  94  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541608  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0182  biotin--protein ligase  28.33 
 
 
319 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000279859  normal  0.096767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0183  biotin--protein ligase  28.33 
 
 
319 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00618712  normal  0.258521 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3740  biotin--protein ligase  29.41 
 
 
319 aa  93.2  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00032759  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3895  biotin--protein ligase  34.71 
 
 
319 aa  92.8  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.282712  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0268  biotin--protein ligase  34.02 
 
 
320 aa  92.4  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0393829  hitchhiker  0.0050705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0437  biotin--protein ligase  33.33 
 
 
319 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193351  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0470  biotin--protein ligase  33.33 
 
 
319 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0969933  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2403  bifunctional protein BirA  41.06 
 
 
313 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1967  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.92 
 
 
262 aa  90.9  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4766  biotin--protein ligase  33.06 
 
 
321 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0199355  normal  0.789599 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3943  biotin--protein ligase  32.71 
 
 
320 aa  90.5  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.596693  decreased coverage  0.000472258 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5200  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.46 
 
 
275 aa  90.5  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.105506  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0419  biotin--protein ligase  28.91 
 
 
310 aa  89.7  5e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0610  birA bifunctional protein  34.16 
 
 
319 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0227  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.15 
 
 
262 aa  89  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00038256 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0086  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.06 
 
 
332 aa  88.6  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03573  putative BirA bifunctional protein  32.87 
 
 
328 aa  88.6  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.184427  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0702  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.92 
 
 
319 aa  87.8  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0362526  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4564  biotin--protein ligase  34.16 
 
 
335 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3757  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  41.61 
 
 
267 aa  87  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.450721 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0201  biotin--protein ligase  44.19 
 
 
319 aa  86.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286867  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4017  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.15 
 
 
321 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0118949  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03854  biotin-protein ligase  34.15 
 
 
321 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0188201  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4207  biotin--protein ligase  34.15 
 
 
321 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000658318  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4421  biotin--protein ligase  34.15 
 
 
321 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000434302  hitchhiker  0.00072275 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4512  biotin--protein ligase  34.15 
 
 
321 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295045  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4047  biotin--protein ligase  34.15 
 
 
321 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0641292  hitchhiker  0.00297103 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4461  biotin--protein ligase  34.15 
 
 
321 aa  85.9  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000740491  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5438  biotin--protein ligase  34.15 
 
 
321 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000183056  hitchhiker  0.00134266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03807  hypothetical protein  34.15 
 
 
321 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0195  biotin--protein ligase  43.41 
 
 
319 aa  85.9  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2081  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.43 
 
 
325 aa  85.5  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0614  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.17 
 
 
313 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.695389  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0453  birA bifunctional protein  36.17 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0204  biotin--protein ligase  32.97 
 
 
319 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4349  biotin--protein ligase  33.74 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000983671  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4471  biotin--protein ligase  33.74 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000340796  hitchhiker  0.00000000000240151 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4468  biotin--protein ligase  33.74 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0221784  hitchhiker  0.00169649 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4546  biotin--protein ligase  33.74 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000449604  hitchhiker  0.00000000138084 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4381  biotin--protein ligase  33.74 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4292  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.22 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.422429  hitchhiker  0.0000115964 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0406  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.89 
 
 
326 aa  83.2  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.617579  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0816  biotin--protein ligase  30.33 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4745  biotin--protein ligase  34.42 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.167382  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4226  biotin--protein ligase  31.46 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3253  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.2 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.147547 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5096  biotin--protein ligase  40.12 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000301513  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4629  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.73 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.96 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.614952 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0915  biotin--(acetyl-CoA-carboxylase) ligase  41.35 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.277179  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0490  biotin--protein ligase  32.71 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0887139 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1722  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.23 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.513147  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4741  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.6 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1674  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.68 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3315  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  42.19 
 
 
256 aa  79  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1887  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  26.14 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.595914  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06050  biotin--protein ligase  41.59 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07941  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.17 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.580054  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0102  biotin--protein ligase  33.11 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1304  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  40.13 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.563861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1321  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  40.13 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.195467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1340  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.47 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.352329 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1295  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.5 
 
 
237 aa  77  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.486706  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0984  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.08 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.381797 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0505  biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  32.88 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>