More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1340 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1304  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  99.63 
 
 
270 aa  517  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.563861  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1340  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  100 
 
 
270 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.352329 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1321  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  99.63 
 
 
270 aa  517  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.195467 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4741  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  59.33 
 
 
266 aa  291  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1722  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  61.48 
 
 
257 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.513147  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13308  bifunctional protein birA: biotin operon repressor + biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] synthetase  55.47 
 
 
266 aa  236  4e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0857  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  45.39 
 
 
291 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.198933  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2553  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  44.85 
 
 
299 aa  179  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4128  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  43.11 
 
 
289 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.588698  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1044  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  45.21 
 
 
269 aa  175  6e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0803  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  44.17 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000492464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1326  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  44.98 
 
 
274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.194167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0793  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  42.96 
 
 
263 aa  169  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4229  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  43.61 
 
 
299 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.45335 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0702  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  46.79 
 
 
272 aa  165  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0819  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  40.75 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0425182  normal  0.289102 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1841  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  48.37 
 
 
271 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511588  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3908  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  45.42 
 
 
270 aa  157  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3938  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  42.47 
 
 
286 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409582  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1327  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  40.82 
 
 
302 aa  155  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000046596 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05900  birA, biotin-(acetyl-CoA-carboxylase) ligase  43.32 
 
 
275 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.402573 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3494  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  42.74 
 
 
263 aa  149  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4363  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  44.81 
 
 
279 aa  139  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6389  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  43.65 
 
 
253 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00441767  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1042  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  41.84 
 
 
289 aa  136  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1283  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  42.25 
 
 
347 aa  136  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5913  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  40.57 
 
 
309 aa  135  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.831229 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0701  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  42.13 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.476983 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25430  birA, biotin-(acetyl-CoA-carboxylase) ligase  41.05 
 
 
282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.180915  normal  0.633613 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0851  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.38 
 
 
278 aa  118  7.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000131196  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1022  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.97 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279036  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2427  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.76 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1479  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  40.94 
 
 
329 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0876973  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1153  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.74 
 
 
270 aa  108  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.424418 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0134  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.94 
 
 
326 aa  105  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00373648  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0398  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.88 
 
 
341 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0778142  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1058  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.51 
 
 
326 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.101759  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4745  biotin--protein ligase  33.19 
 
 
333 aa  102  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.167382  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0437  biotin--protein ligase  33.47 
 
 
319 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193351  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0467  biotin--protein ligase  35.34 
 
 
319 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800228  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0470  biotin--protein ligase  33.47 
 
 
319 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0969933  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0654  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.29 
 
 
324 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00660  biotin (acetyl-CoA carboxylase) synthetase  28.81 
 
 
326 aa  99.8  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00240  biotin--protein ligase  32.82 
 
 
321 aa  99.4  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03573  putative BirA bifunctional protein  32.59 
 
 
328 aa  99  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.184427  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0132  biotin--protein ligase  30.42 
 
 
320 aa  99  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000234608  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4051  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.97 
 
 
272 aa  99  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.141913  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2388  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.23 
 
 
330 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0131534  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4766  biotin--protein ligase  34.48 
 
 
321 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0199355  normal  0.789599 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1971  biotin-(acetyl-CoA carboxylase) holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  35.37 
 
 
327 aa  97.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4226  biotin--protein ligase  35.11 
 
 
305 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_004310  BR0816  biotin--protein ligase  35.83 
 
 
265 aa  97.1  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.870117  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0154  biotin--protein ligase  30.23 
 
 
323 aa  97.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00266236  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0937  bifunctional protein birA  29.15 
 
 
323 aa  96.7  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1044  biotin operon repressor  29.15 
 
 
323 aa  96.7  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3351  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.06 
 
 
272 aa  95.9  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417142  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0490  biotin--protein ligase  34.01 
 
 
297 aa  95.9  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0887139 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3227  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.88 
 
 
267 aa  95.9  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0811  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.25 
 
 
265 aa  95.5  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0077  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.48 
 
 
327 aa  95.5  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4564  biotin--protein ligase  31.27 
 
 
335 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2071  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.59 
 
 
326 aa  94  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1987  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.33 
 
 
338 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.417612  normal  0.841631 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1317  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.58 
 
 
328 aa  94.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.61009  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0702  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.47 
 
 
319 aa  94.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0362526  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0142  biotin--protein ligase  30.8 
 
 
319 aa  93.2  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.330287  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5096  biotin--protein ligase  34.84 
 
 
317 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000301513  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0915  biotin--(acetyl-CoA-carboxylase) ligase  39.46 
 
 
332 aa  93.2  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.277179  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0168  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.07 
 
 
333 aa  93.2  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153675  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1321  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.7 
 
 
277 aa  93.2  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.308381  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1124  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  25.32 
 
 
231 aa  92.8  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2409  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.57 
 
 
265 aa  92.8  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002163  biotin-protein ligase/biotin operon repressor  31.84 
 
 
321 aa  92.4  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1571  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.22 
 
 
330 aa  92  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.929422  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2431  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.65 
 
 
330 aa  92  9e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552331  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0610  birA bifunctional protein  31.43 
 
 
319 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3184  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.54 
 
 
326 aa  91.7  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1476  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.84 
 
 
330 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.699124  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2840  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.87 
 
 
328 aa  92  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0188  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.59 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2817  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.75 
 
 
336 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000210207  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0518  biotin operon repressor  26.24 
 
 
325 aa  90.9  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0966787  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0793  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.51 
 
 
336 aa  90.9  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2459  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.5 
 
 
329 aa  90.5  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.472126  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2320  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.02 
 
 
327 aa  90.5  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0571544  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0244  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.5 
 
 
329 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  0.860661 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3926  biotin--protein ligase  44.24 
 
 
321 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541608  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1056  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.85 
 
 
287 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08620  biotin--protein ligase  37.02 
 
 
312 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000664696 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0197  biotin--protein ligase  30.42 
 
 
317 aa  89.7  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00143406  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1122  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.35 
 
 
248 aa  89.7  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.186995  normal  0.531418 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4706  biotin--protein ligase  28.17 
 
 
320 aa  89.4  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.144079  hitchhiker  0.00201782 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0180  biotin--protein ligase  29.46 
 
 
319 aa  89.4  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0210584  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0182  biotin--protein ligase  30.36 
 
 
319 aa  89.4  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000279859  normal  0.096767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0183  biotin--protein ligase  30.36 
 
 
319 aa  89.4  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00618712  normal  0.258521 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4072  biotin--protein ligase  28.68 
 
 
319 aa  89  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0214  biotin--protein ligase  29.72 
 
 
319 aa  88.6  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2717  biotin--protein ligase  33.05 
 
 
320 aa  88.2  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000120108  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4174  biotin--protein ligase  28.68 
 
 
319 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000228488  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3299  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.28 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.382633  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>