More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4741 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4741  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  100 
 
 
266 aa  525  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1722  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  77.17 
 
 
257 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.513147  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1304  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  59.7 
 
 
270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.563861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1321  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  59.7 
 
 
270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.195467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1340  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  59.33 
 
 
270 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.352329 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13308  bifunctional protein birA: biotin operon repressor + biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] synthetase  51.33 
 
 
266 aa  224  9e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1326  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  46.21 
 
 
274 aa  192  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.194167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4128  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  44.13 
 
 
289 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.588698  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2553  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  44.07 
 
 
299 aa  189  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1841  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  46.46 
 
 
271 aa  178  7e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511588  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0819  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  41.98 
 
 
308 aa  178  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0425182  normal  0.289102 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4229  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  41.44 
 
 
299 aa  177  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.45335 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3494  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  47.77 
 
 
263 aa  177  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0702  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  47.35 
 
 
272 aa  175  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3938  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  45.59 
 
 
286 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409582  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0793  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  40.91 
 
 
263 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25430  birA, biotin-(acetyl-CoA-carboxylase) ligase  44.92 
 
 
282 aa  167  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.180915  normal  0.633613 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1042  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  41.99 
 
 
289 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0803  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  42.05 
 
 
291 aa  165  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000492464 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3908  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  44.03 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0857  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  41.34 
 
 
291 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.198933  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1044  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  41.51 
 
 
269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1327  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  44.27 
 
 
302 aa  163  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000046596 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05900  birA, biotin-(acetyl-CoA-carboxylase) ligase  40.14 
 
 
275 aa  148  8e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.402573 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1283  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  43.68 
 
 
347 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0701  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  42.63 
 
 
310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.476983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4363  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  41.85 
 
 
279 aa  136  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6389  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  40.56 
 
 
253 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00441767  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0851  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.44 
 
 
278 aa  130  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000131196  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5913  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.68 
 
 
309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.831229 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1153  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.23 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.424418 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1022  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.28 
 
 
291 aa  125  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279036  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0142  biotin--protein ligase  32.95 
 
 
319 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.330287  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0398  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.11 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0778142  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0268  biotin--protein ligase  32.36 
 
 
320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0393829  hitchhiker  0.0050705 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4334  biotin--protein ligase  32.95 
 
 
320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.152634  hitchhiker  0.00000000217796 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0915  biotin--(acetyl-CoA-carboxylase) ligase  34.16 
 
 
332 aa  109  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.277179  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0793  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.79 
 
 
336 aa  107  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2388  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.68 
 
 
330 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0131534  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1479  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.67 
 
 
329 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0876973  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03573  putative BirA bifunctional protein  33.86 
 
 
328 aa  106  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.184427  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1058  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.52 
 
 
326 aa  105  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.101759  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0132  biotin--protein ligase  34.76 
 
 
320 aa  105  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000234608  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3926  biotin--protein ligase  35.25 
 
 
321 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541608  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0182  biotin--protein ligase  31.73 
 
 
319 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000279859  normal  0.096767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0183  biotin--protein ligase  31.73 
 
 
319 aa  105  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00618712  normal  0.258521 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03854  biotin-protein ligase  32.72 
 
 
321 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0188201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4017  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.99 
 
 
321 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0118949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03807  hypothetical protein  32.72 
 
 
321 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4207  biotin--protein ligase  32.72 
 
 
321 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000658318  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4421  biotin--protein ligase  32.72 
 
 
321 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000434302  hitchhiker  0.00072275 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4512  biotin--protein ligase  32.72 
 
 
321 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295045  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4461  biotin--protein ligase  32.72 
 
 
321 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000740491  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4047  biotin--protein ligase  32.72 
 
 
321 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0641292  hitchhiker  0.00297103 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3775  biotin--protein ligase  33.73 
 
 
319 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00231404  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5438  biotin--protein ligase  32.72 
 
 
321 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000183056  hitchhiker  0.00134266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0437  biotin--protein ligase  33.87 
 
 
319 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193351  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4706  biotin--protein ligase  31.06 
 
 
320 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.144079  hitchhiker  0.00201782 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0467  biotin--protein ligase  33.61 
 
 
319 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800228  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2427  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.34 
 
 
321 aa  104  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0470  biotin--protein ligase  33.87 
 
 
319 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0969933  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2576  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.04 
 
 
310 aa  102  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0197  biotin--protein ligase  33.07 
 
 
317 aa  102  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00143406  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4349  biotin--protein ligase  31.62 
 
 
320 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000983671  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4381  biotin--protein ligase  31.62 
 
 
320 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4468  biotin--protein ligase  31.62 
 
 
320 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0221784  hitchhiker  0.00169649 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4546  biotin--protein ligase  31.62 
 
 
320 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000449604  hitchhiker  0.00000000138084 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002163  biotin-protein ligase/biotin operon repressor  33.87 
 
 
321 aa  102  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4471  biotin--protein ligase  31.62 
 
 
320 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000340796  hitchhiker  0.00000000000240151 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0154  biotin--protein ligase  30.87 
 
 
323 aa  101  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00266236  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3396  biotin--protein ligase  31.56 
 
 
319 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.199101  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0168  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.36 
 
 
333 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153675  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3871  biotin--protein ligase  31.56 
 
 
319 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000364778  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0073  biotin--protein ligase  35.18 
 
 
285 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.702906 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0327  biotin--protein ligase  31.56 
 
 
319 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0364706  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2119  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.41 
 
 
329 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4072  biotin--protein ligase  32.77 
 
 
319 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1468  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.17 
 
 
329 aa  100  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0984  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.08 
 
 
335 aa  101  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.381797 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4766  biotin--protein ligase  35.19 
 
 
321 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0199355  normal  0.789599 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0702  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.09 
 
 
319 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0362526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1571  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.35 
 
 
330 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.929422  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4745  biotin--protein ligase  31.69 
 
 
333 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.167382  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3943  biotin--protein ligase  31.62 
 
 
320 aa  100  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.596693  decreased coverage  0.000472258 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0219  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.24 
 
 
322 aa  99.4  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.440436  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1476  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.9 
 
 
330 aa  99  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.699124  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3757  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.74 
 
 
267 aa  99  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.450721 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3184  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.1 
 
 
326 aa  99  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4174  biotin--protein ligase  32.34 
 
 
319 aa  99.4  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000228488  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0180  biotin--protein ligase  32.34 
 
 
319 aa  99  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0210584  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0102  biotin--protein ligase  33.33 
 
 
305 aa  98.6  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00240  biotin--protein ligase  31.84 
 
 
321 aa  98.2  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1044  biotin operon repressor  28.83 
 
 
323 aa  97.8  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0937  bifunctional protein birA  28.83 
 
 
323 aa  97.8  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3740  biotin--protein ligase  30.08 
 
 
319 aa  98.2  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00032759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1903  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  30 
 
 
327 aa  98.2  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.37759 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2817  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.27 
 
 
336 aa  98.6  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000210207  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3351  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.47 
 
 
272 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417142  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1081  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.7 
 
 
315 aa  98.6  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.560256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0184  biotin--protein ligase  31.91 
 
 
319 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.570128  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>