More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0453 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0453  birA bifunctional protein  100 
 
 
301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0614  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  99.67 
 
 
313 aa  601  1.0000000000000001e-171  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.695389  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1044  biotin operon repressor  29.54 
 
 
323 aa  132  6e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0937  bifunctional protein birA  29.54 
 
 
323 aa  132  6e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0183  biotin--protein ligase  30.47 
 
 
319 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00618712  normal  0.258521 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0182  biotin--protein ligase  30.47 
 
 
319 aa  125  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000279859  normal  0.096767 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4017  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.37 
 
 
321 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0118949  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5438  biotin--protein ligase  32.37 
 
 
321 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000183056  hitchhiker  0.00134266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4421  biotin--protein ligase  32.37 
 
 
321 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000434302  hitchhiker  0.00072275 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4334  biotin--protein ligase  29.03 
 
 
320 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.152634  hitchhiker  0.00000000217796 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03854  biotin-protein ligase  32.37 
 
 
321 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0188201  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4047  biotin--protein ligase  32.37 
 
 
321 aa  124  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0641292  hitchhiker  0.00297103 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03807  hypothetical protein  32.37 
 
 
321 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0180  biotin--protein ligase  29.96 
 
 
319 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0210584  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4461  biotin--protein ligase  32.37 
 
 
321 aa  124  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000740491  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4207  biotin--protein ligase  32.37 
 
 
321 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000658318  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4512  biotin--protein ligase  32.37 
 
 
321 aa  124  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295045  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4174  biotin--protein ligase  29.6 
 
 
319 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000228488  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4072  biotin--protein ligase  29.6 
 
 
319 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002163  biotin-protein ligase/biotin operon repressor  30.71 
 
 
321 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0419  biotin--protein ligase  28.53 
 
 
310 aa  121  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0184  biotin--protein ligase  29.24 
 
 
319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.570128  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3775  biotin--protein ligase  29.24 
 
 
319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00231404  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4706  biotin--protein ligase  33.19 
 
 
320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.144079  hitchhiker  0.00201782 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3740  biotin--protein ligase  31.41 
 
 
319 aa  119  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00032759  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0847  biotin-[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  29.1 
 
 
331 aa  119  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0197  biotin--protein ligase  31.27 
 
 
317 aa  119  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00143406  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0822  biotin-[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  29.15 
 
 
333 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0214  biotin--protein ligase  28.88 
 
 
319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00240  biotin--protein ligase  29.47 
 
 
321 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0195  biotin--protein ligase  33.76 
 
 
319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0154  biotin--protein ligase  29.72 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00266236  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0142  biotin--protein ligase  28.42 
 
 
319 aa  114  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.330287  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3895  biotin--protein ligase  32.2 
 
 
319 aa  113  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.282712  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0327  biotin--protein ligase  28.67 
 
 
319 aa  112  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0364706  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3396  biotin--protein ligase  28.67 
 
 
319 aa  112  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.199101  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3871  biotin--protein ligase  28.67 
 
 
319 aa  112  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000364778  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4381  biotin--protein ligase  30.22 
 
 
320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4349  biotin--protein ligase  30.22 
 
 
320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000983671  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4471  biotin--protein ligase  30.22 
 
 
320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000340796  hitchhiker  0.00000000000240151 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4468  biotin--protein ligase  30.22 
 
 
320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0221784  hitchhiker  0.00169649 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4546  biotin--protein ligase  30.22 
 
 
320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000449604  hitchhiker  0.00000000138084 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.92 
 
 
276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.614952 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3943  biotin--protein ligase  31.18 
 
 
320 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.596693  decreased coverage  0.000472258 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0177  biotin--protein ligase  30.47 
 
 
319 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131379  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0201  biotin--protein ligase  30.32 
 
 
319 aa  109  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286867  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0268  biotin--protein ligase  31.32 
 
 
320 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0393829  hitchhiker  0.0050705 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0132  biotin--protein ligase  28.67 
 
 
320 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000234608  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0219  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.24 
 
 
322 aa  107  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.440436  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1781  birA bifunctional protein  28.88 
 
 
331 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2717  biotin--protein ligase  29.75 
 
 
320 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000120108  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0168  biotin--protein ligase  33.33 
 
 
320 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00063361  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0505  biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  30.26 
 
 
282 aa  104  2e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4745  biotin--protein ligase  31.65 
 
 
333 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.167382  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0915  biotin--(acetyl-CoA-carboxylase) ligase  33.47 
 
 
332 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.277179  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0788  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  23.43 
 
 
318 aa  99  8e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03573  putative BirA bifunctional protein  28.39 
 
 
328 aa  99  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.184427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08620  biotin--protein ligase  34.23 
 
 
312 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000664696 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3926  biotin--protein ligase  29.06 
 
 
321 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541608  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0406  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.8 
 
 
326 aa  96.7  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.617579  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1971  biotin-(acetyl-CoA carboxylase) holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  35.48 
 
 
327 aa  96.7  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0467  biotin--protein ligase  30.11 
 
 
319 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800228  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0702  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.19 
 
 
319 aa  94.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0362526  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_753  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase/ BirA family transcriptional regulator  30.19 
 
 
262 aa  94  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2071  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.51 
 
 
326 aa  93.6  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0227  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.15 
 
 
262 aa  94  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00038256 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0875  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.8 
 
 
325 aa  93.6  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107744  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3998  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.37 
 
 
328 aa  92.4  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00153965  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1229  biotin--protein ligase  32.28 
 
 
317 aa  91.7  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2876  biotin--protein ligase  26.71 
 
 
319 aa  90.9  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1317  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.38 
 
 
328 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.61009  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0768  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.99 
 
 
262 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0233  biotin--protein ligase  36.71 
 
 
322 aa  90.5  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0077  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.95 
 
 
327 aa  90.5  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1136  biotin--protein ligase  31.93 
 
 
317 aa  90.5  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2610  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.82 
 
 
335 aa  90.1  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.808481 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1418  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.08 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00660  biotin (acetyl-CoA carboxylase) synthetase  28.57 
 
 
326 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06050  biotin--protein ligase  31.77 
 
 
330 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0168  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.95 
 
 
333 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153675  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02842  biotin--protein ligase  34.75 
 
 
338 aa  86.7  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2081  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.42 
 
 
325 aa  86.7  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1588  biotin--(acetyl-COA-carboxylase) synthetase  28.32 
 
 
326 aa  86.7  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1058  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.17 
 
 
326 aa  86.3  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.101759  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3652  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  31 
 
 
277 aa  85.9  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0948912  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4766  biotin--protein ligase  29.92 
 
 
321 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0199355  normal  0.789599 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2446  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.86 
 
 
307 aa  85.9  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000206107  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6032  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.83 
 
 
244 aa  85.9  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3992  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.28 
 
 
285 aa  85.5  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.182521 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1935  birA biofunctional protein, putative  30.88 
 
 
323 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.976784  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3341  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.28 
 
 
285 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4629  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.41 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0437  biotin--protein ligase  30.86 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193351  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0976  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.17 
 
 
278 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.643187 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2602  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.97 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.858732  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0816  biotin--protein ligase  31.94 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0470  biotin--protein ligase  30.86 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0969933  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4292  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  26.63 
 
 
317 aa  84  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.422429  hitchhiker  0.0000115964 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2140  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.64 
 
 
324 aa  84  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3352  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.02 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.0000000222923  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>