More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1136 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1136  biotin--protein ligase  100 
 
 		 317 aa  628  1e-179  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1229  biotin--protein ligase  98.11 
 
 		 317 aa  618  1e-176  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02842  biotin--protein ligase  59.38 
 
 		 338 aa  297  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0233  biotin--protein ligase  54.06 
 
 		 322 aa  286  4e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3998  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.09 
 
 		 328 aa  209  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00153965  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0268  biotin--protein ligase  39.74 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0393829  hitchhiker  0.0050705 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03854  biotin-protein ligase  39.41 
 
 		 321 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0188201  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0195  biotin--protein ligase  39.74 
 
 		 319 aa  206  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4047  biotin--protein ligase  39.41 
 
 		 321 aa  206  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0641292  hitchhiker  0.00297103 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4461  biotin--protein ligase  39.41 
 
 		 321 aa  206  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000740491  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4512  biotin--protein ligase  39.41 
 
 		 321 aa  206  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295045  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4207  biotin--protein ligase  39.41 
 
 		 321 aa  206  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000658318  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03807  hypothetical protein  39.41 
 
 		 321 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4349  biotin--protein ligase  39.74 
 
 		 320 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000983671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4381  biotin--protein ligase  39.74 
 
 		 320 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4468  biotin--protein ligase  39.74 
 
 		 320 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0221784  hitchhiker  0.00169649 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4546  biotin--protein ligase  39.74 
 
 		 320 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000449604  hitchhiker  0.00000000138084 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4471  biotin--protein ligase  39.74 
 
 		 320 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000340796  hitchhiker  0.00000000000240151 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3943  biotin--protein ligase  38.51 
 
 		 320 aa  205  7e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.596693  decreased coverage  0.000472258 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4017  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.09 
 
 		 321 aa  205  8e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0118949  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4421  biotin--protein ligase  39.09 
 
 		 321 aa  205  8e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000434302  hitchhiker  0.00072275 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5438  biotin--protein ligase  39.09 
 
 		 321 aa  205  8e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000183056  hitchhiker  0.00134266 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3895  biotin--protein ligase  36.93 
 
 		 319 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.282712  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0219  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.16 
 
 		 322 aa  202  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.440436  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1781  birA bifunctional protein  40.06 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4745  biotin--protein ligase  35.49 
 
 		 333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.167382  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0201  biotin--protein ligase  38.11 
 
 		 319 aa  196  5.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286867  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3396  biotin--protein ligase  38.31 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0327  biotin--protein ligase  38.31 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0364706  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0197  biotin--protein ligase  37.79 
 
 		 317 aa  194  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00143406  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3871  biotin--protein ligase  38.31 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000364778  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2876  biotin--protein ligase  35.71 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3740  biotin--protein ligase  36.69 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00032759  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2717  biotin--protein ligase  37.86 
 
 		 320 aa  186  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000120108  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00240  biotin--protein ligase  35.65 
 
 		 321 aa  186  6e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3775  biotin--protein ligase  35.74 
 
 		 319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00231404  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03573  putative BirA bifunctional protein  36.33 
 
 		 328 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.184427  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4292  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.74 
 
 		 317 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.422429  hitchhiker  0.0000115964 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4174  biotin--protein ligase  35.5 
 
 		 319 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000228488  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0180  biotin--protein ligase  35.5 
 
 		 319 aa  178  9e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0210584  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002163  biotin-protein ligase/biotin operon repressor  36.16 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4072  biotin--protein ligase  35.18 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0184  biotin--protein ligase  36.04 
 
 		 319 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.570128  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0182  biotin--protein ligase  34.48 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000279859  normal  0.096767 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4334  biotin--protein ligase  34.2 
 
 		 320 aa  176  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.152634  hitchhiker  0.00000000217796 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0183  biotin--protein ligase  34.53 
 
 		 319 aa  176  5e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00618712  normal  0.258521 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0142  biotin--protein ligase  34.2 
 
 		 319 aa  172  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.330287  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0214  biotin--protein ligase  33.77 
 
 		 319 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0132  biotin--protein ligase  35.31 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000234608  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3926  biotin--protein ligase  35.03 
 
 		 321 aa  166  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0915  biotin--(acetyl-CoA-carboxylase) ligase  37.3 
 
 		 332 aa  163  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.277179  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0154  biotin--protein ligase  34.17 
 
 		 323 aa  161  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00266236  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0702  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.19 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0362526  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0406  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.03 
 
 		 326 aa  159  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.617579  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0467  biotin--protein ligase  35.06 
 
 		 319 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4706  biotin--protein ligase  32.57 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.144079  hitchhiker  0.00201782 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0168  biotin--protein ligase  35.06 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00063361  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0419  biotin--protein ligase  35.16 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0937  bifunctional protein birA  29.87 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1044  biotin operon repressor  29.87 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0177  biotin--protein ligase  34.48 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131379  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08620  biotin--protein ligase  34.52 
 
 		 312 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664696 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0816  biotin--protein ligase  35.79 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4564  biotin--protein ligase  33.76 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0437  biotin--protein ligase  38.03 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193351  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0470  biotin--protein ligase  35.71 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0969933  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0822  biotin-[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  32.99 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2082  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.33 
 
 		 329 aa  147  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4766  biotin--protein ligase  35.06 
 
 		 321 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0199355  normal  0.789599 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0847  biotin-[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  32.53 
 
 		 331 aa  142  7e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2081  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.46 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0440  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.08 
 
 		 336 aa  139  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.028543  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0610  birA bifunctional protein  32.36 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0188  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.93 
 
 		 269 aa  136  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0505  biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  34.24 
 
 		 282 aa  132  7.999999999999999e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2403  bifunctional protein BirA  41.35 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06050  biotin--protein ligase  31.49 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0875  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.24 
 
 		 325 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107744  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0134  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.97 
 
 		 326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00373648  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5096  biotin--protein ligase  32.17 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000301513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3720  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.97 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.071565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0460  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.76 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0168  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.97 
 
 		 333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153675  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0227  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  40.42 
 
 		 262 aa  113  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00038256 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1971  biotin-(acetyl-CoA carboxylase) holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  31.09 
 
 		 327 aa  112  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0054  hypothetical protein  30.6 
 
 		 319 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0287578 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1317  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.01 
 
 		 328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.61009  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0159  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.82 
 
 		 326 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000241219  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3757  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.78 
 
 		 267 aa  109  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.450721 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0263  biotin acetyl-CoA-carboxylase synthetase  40 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147869 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4629  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.01 
 
 		 283 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1871  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.78 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000312804  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0174  biotin--protein ligase  38.84 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0086  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.17 
 
 		 332 aa  106  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5200  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.1 
 
 		 275 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.105506  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0167  biotin--protein ligase  36.73 
 
 		 293 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0663  BirA bifunctional protein  26.79 
 
 		 328 aa  105  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0814484  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6247  biotin--protein ligase  34.21 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.791629 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2779  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.6 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0162859  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0664  BirA bifunctional protein  27.41 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.06678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>