More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02842 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02842  biotin--protein ligase  100 
 
 
338 aa  650    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0233  biotin--protein ligase  65.22 
 
 
322 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1136  biotin--protein ligase  59.38 
 
 
317 aa  322  7e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1229  biotin--protein ligase  58.75 
 
 
317 aa  318  7e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1781  birA bifunctional protein  44.58 
 
 
331 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3998  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.45 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00153965  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0142  biotin--protein ligase  36.99 
 
 
319 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.330287  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0219  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.91 
 
 
322 aa  202  8e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.440436  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2876  biotin--protein ligase  36.59 
 
 
319 aa  199  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0197  biotin--protein ligase  37.3 
 
 
317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00143406  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0268  biotin--protein ligase  38.49 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0393829  hitchhiker  0.0050705 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1044  biotin operon repressor  34.75 
 
 
323 aa  195  8.000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0937  bifunctional protein birA  34.75 
 
 
323 aa  195  8.000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3775  biotin--protein ligase  36.14 
 
 
319 aa  194  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00231404  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4334  biotin--protein ligase  34.48 
 
 
320 aa  192  6e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.152634  hitchhiker  0.00000000217796 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4072  biotin--protein ligase  35.96 
 
 
319 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4292  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.08 
 
 
317 aa  192  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.422429  hitchhiker  0.0000115964 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4017  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.85 
 
 
321 aa  191  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0118949  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4174  biotin--protein ligase  36.28 
 
 
319 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000228488  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0180  biotin--protein ligase  36.28 
 
 
319 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0210584  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03854  biotin-protein ligase  37.85 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0188201  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0214  biotin--protein ligase  35.2 
 
 
319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4512  biotin--protein ligase  37.85 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295045  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0154  biotin--protein ligase  35.74 
 
 
323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00266236  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4461  biotin--protein ligase  37.85 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000740491  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03807  hypothetical protein  37.85 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3943  biotin--protein ligase  38.05 
 
 
320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.596693  decreased coverage  0.000472258 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4207  biotin--protein ligase  37.85 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000658318  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4047  biotin--protein ligase  37.85 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0641292  hitchhiker  0.00297103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0184  biotin--protein ligase  36.28 
 
 
319 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.570128  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4471  biotin--protein ligase  38.05 
 
 
320 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000340796  hitchhiker  0.00000000000240151 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4381  biotin--protein ligase  38.05 
 
 
320 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4546  biotin--protein ligase  38.05 
 
 
320 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000449604  hitchhiker  0.00000000138084 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4468  biotin--protein ligase  38.05 
 
 
320 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0221784  hitchhiker  0.00169649 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5438  biotin--protein ligase  37.54 
 
 
321 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000183056  hitchhiker  0.00134266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4421  biotin--protein ligase  37.54 
 
 
321 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000434302  hitchhiker  0.00072275 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4349  biotin--protein ligase  38.05 
 
 
320 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000983671  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3895  biotin--protein ligase  36.51 
 
 
319 aa  189  8e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.282712  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00240  biotin--protein ligase  36.48 
 
 
321 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002163  biotin-protein ligase/biotin operon repressor  35.85 
 
 
321 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0201  biotin--protein ligase  36.91 
 
 
319 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286867  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0182  biotin--protein ligase  35.2 
 
 
319 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000279859  normal  0.096767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0183  biotin--protein ligase  35.2 
 
 
319 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00618712  normal  0.258521 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0467  biotin--protein ligase  38.94 
 
 
319 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800228  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3926  biotin--protein ligase  37.04 
 
 
321 aa  186  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541608  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2717  biotin--protein ligase  36.48 
 
 
320 aa  185  9e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000120108  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0915  biotin--(acetyl-CoA-carboxylase) ligase  39.01 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.277179  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3871  biotin--protein ligase  36.19 
 
 
319 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000364778  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3396  biotin--protein ligase  36.19 
 
 
319 aa  183  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.199101  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0327  biotin--protein ligase  36.19 
 
 
319 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0364706  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3740  biotin--protein ligase  36.51 
 
 
319 aa  182  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00032759  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4706  biotin--protein ligase  34.17 
 
 
320 aa  182  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.144079  hitchhiker  0.00201782 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0406  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  40.13 
 
 
326 aa  182  7e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.617579  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0195  biotin--protein ligase  36.91 
 
 
319 aa  182  9.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4745  biotin--protein ligase  35.91 
 
 
333 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.167382  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03573  putative BirA bifunctional protein  36.45 
 
 
328 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.184427  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4564  biotin--protein ligase  38.14 
 
 
335 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0132  biotin--protein ligase  34.07 
 
 
320 aa  180  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000234608  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0702  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.49 
 
 
319 aa  179  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0362526  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0168  biotin--protein ligase  35.33 
 
 
320 aa  178  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00063361  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0610  birA bifunctional protein  37.07 
 
 
319 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4766  biotin--protein ligase  38.01 
 
 
321 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0199355  normal  0.789599 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08620  biotin--protein ligase  36.68 
 
 
312 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000664696 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0177  biotin--protein ligase  35.2 
 
 
319 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131379  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0440  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.94 
 
 
336 aa  169  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.028543  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0470  biotin--protein ligase  37.85 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0969933  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0437  biotin--protein ligase  38.17 
 
 
319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193351  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2082  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.48 
 
 
329 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0816  biotin--protein ligase  37.04 
 
 
293 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2081  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.12 
 
 
325 aa  157  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06050  biotin--protein ligase  36.56 
 
 
330 aa  155  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0822  biotin-[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  32.18 
 
 
333 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0847  biotin-[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  32.06 
 
 
331 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5096  biotin--protein ligase  35.02 
 
 
317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000301513  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0168  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.63 
 
 
333 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153675  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0875  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.58 
 
 
325 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107744  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0159  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.87 
 
 
326 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000241219  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0419  biotin--protein ligase  32.43 
 
 
310 aa  137  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0460  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.07 
 
 
331 aa  136  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2459  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.33 
 
 
329 aa  135  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.472126  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1871  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.11 
 
 
332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000312804  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2071  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.63 
 
 
326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2431  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.54 
 
 
330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552331  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0788  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  24.69 
 
 
318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1971  biotin-(acetyl-CoA carboxylase) holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  33.12 
 
 
327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0134  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.06 
 
 
326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00373648  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0505  biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  34.36 
 
 
282 aa  131  2.0000000000000002e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2320  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.65 
 
 
327 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0571544  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5200  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  40.08 
 
 
275 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.105506  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2403  bifunctional protein BirA  43.33 
 
 
313 aa  129  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1903  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.31 
 
 
327 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.37759 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1317  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.01 
 
 
328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.61009  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0664  BirA bifunctional protein  27.99 
 
 
328 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.06678  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0663  BirA bifunctional protein  27.36 
 
 
328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0814484  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0188  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.94 
 
 
269 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1653  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.39 
 
 
333 aa  126  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0054  hypothetical protein  28.53 
 
 
319 aa  126  5e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0287578 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2840  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.29 
 
 
328 aa  125  9e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0227  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  41.06 
 
 
262 aa  124  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00038256 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0775  transcriptional repressor of the biotin operon / biotin acetyl-CoA-carboxylase synthetase; RBL03563  29.25 
 
 
325 aa  124  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000728901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>