More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0505 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007984  BCI_0505  biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  100 
 
 
282 aa  571  1.0000000000000001e-162  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0195  biotin--protein ligase  47.52 
 
 
319 aa  265  5e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3740  biotin--protein ligase  45.62 
 
 
319 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00032759  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4349  biotin--protein ligase  45.36 
 
 
320 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000983671  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4546  biotin--protein ligase  45.36 
 
 
320 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000449604  hitchhiker  0.00000000138084 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3895  biotin--protein ligase  46.72 
 
 
319 aa  258  7e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.282712  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4471  biotin--protein ligase  45.36 
 
 
320 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000340796  hitchhiker  0.00000000000240151 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4381  biotin--protein ligase  45.36 
 
 
320 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4468  biotin--protein ligase  45.36 
 
 
320 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0221784  hitchhiker  0.00169649 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3943  biotin--protein ligase  43.99 
 
 
320 aa  258  8e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.596693  decreased coverage  0.000472258 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0268  biotin--protein ligase  46.81 
 
 
320 aa  258  9e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0393829  hitchhiker  0.0050705 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0201  biotin--protein ligase  46.45 
 
 
319 aa  257  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286867  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03854  biotin-protein ligase  44.67 
 
 
321 aa  255  5e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0188201  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5438  biotin--protein ligase  44.67 
 
 
321 aa  255  5e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000183056  hitchhiker  0.00134266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03807  hypothetical protein  44.67 
 
 
321 aa  255  5e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4047  biotin--protein ligase  44.67 
 
 
321 aa  255  5e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0641292  hitchhiker  0.00297103 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4461  biotin--protein ligase  44.67 
 
 
321 aa  255  5e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000740491  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4512  biotin--protein ligase  44.67 
 
 
321 aa  255  5e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295045  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4421  biotin--protein ligase  44.67 
 
 
321 aa  255  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000434302  hitchhiker  0.00072275 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4207  biotin--protein ligase  44.67 
 
 
321 aa  255  5e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000658318  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4017  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  44.33 
 
 
321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0118949  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3396  biotin--protein ligase  45.74 
 
 
319 aa  253  3e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.199101  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3871  biotin--protein ligase  45.74 
 
 
319 aa  253  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000364778  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0327  biotin--protein ligase  45.74 
 
 
319 aa  253  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0364706  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002163  biotin-protein ligase/biotin operon repressor  39.93 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00240  biotin--protein ligase  40.3 
 
 
321 aa  206  5e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2717  biotin--protein ligase  38.55 
 
 
320 aa  204  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000120108  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2876  biotin--protein ligase  40 
 
 
319 aa  202  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0219  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.71 
 
 
322 aa  182  7e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.440436  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0142  biotin--protein ligase  37.22 
 
 
319 aa  180  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.330287  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3998  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.04 
 
 
328 aa  176  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00153965  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0197  biotin--protein ligase  34.73 
 
 
317 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00143406  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4072  biotin--protein ligase  34.6 
 
 
319 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0180  biotin--protein ligase  34.22 
 
 
319 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0210584  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4174  biotin--protein ligase  34.22 
 
 
319 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000228488  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0184  biotin--protein ligase  34.22 
 
 
319 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.570128  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4706  biotin--protein ligase  33.83 
 
 
320 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.144079  hitchhiker  0.00201782 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4745  biotin--protein ligase  35.51 
 
 
333 aa  166  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.167382  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0183  biotin--protein ligase  33.08 
 
 
319 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00618712  normal  0.258521 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0182  biotin--protein ligase  33.46 
 
 
319 aa  165  9e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000279859  normal  0.096767 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3775  biotin--protein ligase  33.08 
 
 
319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00231404  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0214  biotin--protein ligase  32.33 
 
 
319 aa  161  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0419  biotin--protein ligase  37.55 
 
 
310 aa  161  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0154  biotin--protein ligase  34.72 
 
 
323 aa  157  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00266236  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0132  biotin--protein ligase  34.25 
 
 
320 aa  158  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000234608  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4334  biotin--protein ligase  32.45 
 
 
320 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.152634  hitchhiker  0.00000000217796 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0168  biotin--protein ligase  32.85 
 
 
320 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00063361  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0177  biotin--protein ligase  33.46 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131379  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1781  birA bifunctional protein  31.39 
 
 
331 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08620  biotin--protein ligase  33.46 
 
 
312 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000664696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0467  biotin--protein ligase  32.96 
 
 
319 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800228  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03573  putative BirA bifunctional protein  29.3 
 
 
328 aa  135  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.184427  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0406  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.41 
 
 
326 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.617579  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4564  biotin--protein ligase  32.1 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0610  birA bifunctional protein  30.63 
 
 
319 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0915  biotin--(acetyl-CoA-carboxylase) ligase  31.07 
 
 
332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.277179  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0437  biotin--protein ligase  31.34 
 
 
319 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193351  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0470  biotin--protein ligase  31.34 
 
 
319 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0969933  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0816  biotin--protein ligase  37.84 
 
 
293 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4766  biotin--protein ligase  38.71 
 
 
321 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0199355  normal  0.789599 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0937  bifunctional protein birA  30.94 
 
 
323 aa  122  9e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1136  biotin--protein ligase  34.24 
 
 
317 aa  122  9e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1044  biotin operon repressor  30.94 
 
 
323 aa  122  9e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1229  biotin--protein ligase  33.85 
 
 
317 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0822  biotin-[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  30.71 
 
 
333 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3926  biotin--protein ligase  31.71 
 
 
321 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541608  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0847  biotin-[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  31.43 
 
 
331 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5096  biotin--protein ligase  33.46 
 
 
317 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000301513  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2081  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.43 
 
 
325 aa  119  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2082  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.54 
 
 
329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0233  biotin--protein ligase  33.59 
 
 
322 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0460  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.95 
 
 
331 aa  112  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0440  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.52 
 
 
336 aa  108  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.028543  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0453  birA bifunctional protein  30.26 
 
 
301 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0614  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.26 
 
 
313 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.695389  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4292  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.41 
 
 
317 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.422429  hitchhiker  0.0000115964 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1317  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.47 
 
 
328 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.61009  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06050  biotin--protein ligase  31.25 
 
 
330 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0702  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.04 
 
 
319 aa  99.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0362526  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02842  biotin--protein ligase  34.36 
 
 
338 aa  97.8  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3757  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.98 
 
 
267 aa  96.3  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.450721 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0188  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.39 
 
 
269 aa  94.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2403  bifunctional protein BirA  31 
 
 
313 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0663  BirA bifunctional protein  31.19 
 
 
328 aa  93.2  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0814484  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0244  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  24.82 
 
 
329 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  0.860661 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0775  transcriptional repressor of the biotin operon / biotin acetyl-CoA-carboxylase synthetase; RBL03563  29.67 
 
 
325 aa  91.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000728901  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2427  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  26.43 
 
 
321 aa  90.5  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1295  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.71 
 
 
237 aa  90.1  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.486706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0664  BirA bifunctional protein  30.73 
 
 
328 aa  90.1  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.06678  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0875  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  26.74 
 
 
325 aa  89  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107744  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3965  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.07 
 
 
308 aa  88.2  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.89958  normal  0.0374002 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3720  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.73 
 
 
344 aa  88.2  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.071565  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0227  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.15 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00038256 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2779  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.19 
 
 
325 aa  86.3  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0162859  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2840  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.19 
 
 
328 aa  85.9  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4629  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.9 
 
 
283 aa  85.9  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0134  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.42 
 
 
326 aa  85.5  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00373648  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0788  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.23 
 
 
318 aa  85.5  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1971  biotin-(acetyl-CoA carboxylase) holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  30.95 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0077  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.45 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>