More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0167 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0167  biotin--protein ligase  100 
 
 		 293 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0174  biotin--protein ligase  90.44 
 
 		 293 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0312  biotin--protein ligase  81.23 
 
 		 296 aa  422  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0102  biotin--protein ligase  46.67 
 
 		 305 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0073  biotin--protein ligase  47.64 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.702906 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4226  biotin--protein ligase  42.95 
 
 		 305 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0204  biotin--protein ligase  42.24 
 
 		 319 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0490  biotin--protein ligase  41.45 
 
 		 297 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0887139 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2290  biotin--protein ligase  39.93 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2904  biotin--protein ligase  39.93 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.125895  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2919  biotin--protein ligase  39.93 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2816  biotin--protein ligase  39.8 
 
 		 306 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.688853  normal  0.200473 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6247  biotin--protein ligase  39.27 
 
 		 306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.791629 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2953  biotin--protein ligase  39.8 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4716  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.07 
 
 		 292 aa  129  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.52 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614952 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0180  biotin--protein ligase  35.37 
 
 		 319 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0210584  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4174  biotin--protein ligase  35.37 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000228488  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0184  biotin--protein ligase  35.37 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.570128  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4072  biotin--protein ligase  34.5 
 
 		 319 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1674  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.6 
 
 		 261 aa  122  7e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03573  putative BirA bifunctional protein  37.27 
 
 		 328 aa  122  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.184427  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0227  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.99 
 
 		 262 aa  122  9e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00038256 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5200  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.23 
 
 		 275 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.105506  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0406  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36 
 
 		 326 aa  115  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.617579  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3992  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.84 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.182521 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1358  biotin--protein ligase  38.85 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0784904  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0235  biotin--protein ligase  38.85 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3775  biotin--protein ligase  33.63 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00231404  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0069  biotin--protein ligase  38.85 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3757  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.21 
 
 		 267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.450721 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3204  biotin--protein ligase  38.85 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1967  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.21 
 
 		 262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0268  biotin--protein ligase  32.95 
 
 		 320 aa  113  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0393829  hitchhiker  0.0050705 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0428  biotin--protein ligase  38.85 
 
 		 319 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.372938  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1136  biotin--protein ligase  37.14 
 
 		 317 aa  112  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0182  biotin--protein ligase  34.04 
 
 		 319 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000279859  normal  0.096767 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0447  biotin--protein ligase  39.53 
 
 		 319 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0183  biotin--protein ligase  34.04 
 
 		 319 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00618712  normal  0.258521 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4745  biotin--protein ligase  35.14 
 
 		 333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.167382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08620  biotin--protein ligase  33.45 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664696 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3341  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.49 
 
 		 285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0609  biotin--protein ligase  38.51 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2082  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.65 
 
 		 329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3965  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.23 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.89958  normal  0.0374002 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0219  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.33 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.440436  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2876  biotin--protein ligase  33.56 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0132  biotin--protein ligase  30.94 
 
 		 320 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000234608  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3953  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.46 
 
 		 268 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0214  biotin--protein ligase  33.48 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0370  biotin--protein ligase  37.97 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0326078  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0816  biotin--protein ligase  34.84 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1229  biotin--protein ligase  36.33 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0142  biotin--protein ligase  32.03 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.330287  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3998  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.91 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00153965  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03854  biotin-protein ligase  33.64 
 
 		 321 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0188201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4017  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.79 
 
 		 321 aa  106  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0118949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03807  hypothetical protein  33.64 
 
 		 321 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4512  biotin--protein ligase  33.64 
 
 		 321 aa  106  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295045  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4047  biotin--protein ligase  33.64 
 
 		 321 aa  106  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0641292  hitchhiker  0.00297103 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4461  biotin--protein ligase  33.64 
 
 		 321 aa  106  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000740491  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00240  biotin--protein ligase  32.16 
 
 		 321 aa  106  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4207  biotin--protein ligase  33.64 
 
 		 321 aa  106  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000658318  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5438  biotin--protein ligase  33.64 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000183056  hitchhiker  0.00134266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4421  biotin--protein ligase  33.64 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000434302  hitchhiker  0.00072275 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0263  biotin acetyl-CoA-carboxylase synthetase  42.44 
 
 		 291 aa  105  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147869 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4468  biotin--protein ligase  33.18 
 
 		 320 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0221784  hitchhiker  0.00169649 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4471  biotin--protein ligase  33.18 
 
 		 320 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000340796  hitchhiker  0.00000000000240151 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4706  biotin--protein ligase  31.98 
 
 		 320 aa  105  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.144079  hitchhiker  0.00201782 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4546  biotin--protein ligase  33.18 
 
 		 320 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000449604  hitchhiker  0.00000000138084 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4349  biotin--protein ligase  33.18 
 
 		 320 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000983671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4381  biotin--protein ligase  33.18 
 
 		 320 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4292  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.39 
 
 		 317 aa  105  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.422429  hitchhiker  0.0000115964 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0233  biotin--protein ligase  36.06 
 
 		 322 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0154  biotin--protein ligase  32.43 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00266236  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3943  biotin--protein ligase  34.39 
 
 		 320 aa  102  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.596693  decreased coverage  0.000472258 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0419  biotin--protein ligase  31.96 
 
 		 310 aa  102  8e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0197  biotin--protein ligase  35.5 
 
 		 317 aa  102  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00143406  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0201  biotin--protein ligase  31.54 
 
 		 319 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286867  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2081  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.91 
 
 		 325 aa  101  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0195  biotin--protein ligase  34.86 
 
 		 319 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002163  biotin-protein ligase/biotin operon repressor  36.09 
 
 		 321 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0437  biotin--protein ligase  33.46 
 
 		 319 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193351  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0470  biotin--protein ligase  33.46 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0969933  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1326  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.49 
 
 		 274 aa  99.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.194167 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02842  biotin--protein ligase  39.41 
 
 		 338 aa  99.4  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0168  biotin--protein ligase  33.77 
 
 		 320 aa  99.4  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00063361  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0467  biotin--protein ligase  33.46 
 
 		 319 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4629  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.19 
 
 		 283 aa  99  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4766  biotin--protein ligase  32.59 
 
 		 321 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0199355  normal  0.789599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3175  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.16 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.684146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2717  biotin--protein ligase  32.37 
 
 		 320 aa  98.2  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000120108  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0937  bifunctional protein birA  27.4 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1044  biotin operon repressor  27.4 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13308  bifunctional protein birA: biotin operon repressor + biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] synthetase  35.16 
 
 		 266 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0822  biotin-[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  26.91 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4334  biotin--protein ligase  30.94 
 
 		 320 aa  96.3  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.152634  hitchhiker  0.00000000217796 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3740  biotin--protein ligase  31.8 
 
 		 319 aa  95.5  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00032759  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0177  biotin--protein ligase  33.62 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131379  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0915  biotin--(acetyl-CoA-carboxylase) ligase  33.18 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.277179  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>