More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3341 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3341  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  100 
 
 		 285 aa  557  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3992  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  98.95 
 
 		 285 aa  554  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.182521 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  64.41 
 
 		 276 aa  335  5e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614952 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4629  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  65.61 
 
 		 283 aa  333  3e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3175  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  62.08 
 
 		 303 aa  328  5.0000000000000004e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.684146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4716  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  56.76 
 
 		 292 aa  295  4e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3965  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  56.8 
 
 		 308 aa  279  4e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.89958  normal  0.0374002 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3953  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  58.24 
 
 		 268 aa  268  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5200  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  54.8 
 
 		 275 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.105506  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0227  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  50.35 
 
 		 262 aa  225  6e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00038256 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0263  biotin acetyl-CoA-carboxylase synthetase  48.97 
 
 		 291 aa  205  8e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147869 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0073  biotin--protein ligase  39.42 
 
 		 285 aa  125  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.702906 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0102  biotin--protein ligase  38.98 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2082  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.11 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4226  biotin--protein ligase  37.32 
 
 		 305 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0490  biotin--protein ligase  37.94 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0887139 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3757  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.9 
 
 		 267 aa  112  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.450721 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3943  biotin--protein ligase  33.46 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.596693  decreased coverage  0.000472258 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0702  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.11 
 
 		 319 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0362526  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3871  biotin--protein ligase  32.96 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000364778  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0327  biotin--protein ligase  32.96 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0364706  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2081  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.33 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3396  biotin--protein ligase  32.96 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03854  biotin-protein ligase  33.94 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0188201  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4421  biotin--protein ligase  33.94 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000434302  hitchhiker  0.00072275 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03807  hypothetical protein  33.94 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4512  biotin--protein ligase  33.94 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295045  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5438  biotin--protein ligase  33.94 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000183056  hitchhiker  0.00134266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4207  biotin--protein ligase  33.94 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000658318  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4047  biotin--protein ligase  33.94 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0641292  hitchhiker  0.00297103 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4461  biotin--protein ligase  33.94 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000740491  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0142  biotin--protein ligase  32.28 
 
 		 319 aa  102  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.330287  normal  0.0344662 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4017  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.58 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0118949  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0204  biotin--protein ligase  35.09 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0312  biotin--protein ligase  36.19 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0406  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.02 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.617579  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08620  biotin--protein ligase  33.97 
 
 		 312 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664696 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4468  biotin--protein ligase  32.72 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0221784  hitchhiker  0.00169649 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0816  biotin--protein ligase  36.19 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4381  biotin--protein ligase  32.72 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002163  biotin-protein ligase/biotin operon repressor  31.25 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4349  biotin--protein ligase  32.72 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000983671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4471  biotin--protein ligase  32.72 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000340796  hitchhiker  0.00000000000240151 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4546  biotin--protein ligase  32.72 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000449604  hitchhiker  0.00000000138084 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1136  biotin--protein ligase  34.3 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0167  biotin--protein ligase  35.49 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0268  biotin--protein ligase  33.7 
 
 		 320 aa  98.2  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0393829  hitchhiker  0.0050705 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0174  biotin--protein ligase  35.92 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03573  putative BirA bifunctional protein  32.71 
 
 		 328 aa  97.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.184427  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4766  biotin--protein ligase  33.7 
 
 		 321 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0199355  normal  0.789599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0467  biotin--protein ligase  33.21 
 
 		 319 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1229  biotin--protein ligase  34.31 
 
 		 317 aa  95.5  8e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0437  biotin--protein ligase  33.21 
 
 		 319 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193351  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00240  biotin--protein ligase  31.82 
 
 		 321 aa  95.1  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6247  biotin--protein ligase  32.99 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.791629 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3895  biotin--protein ligase  31.05 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.282712  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0470  biotin--protein ligase  33.21 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0969933  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4334  biotin--protein ligase  30.12 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.152634  hitchhiker  0.00000000217796 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4292  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.57 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.422429  hitchhiker  0.0000115964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2290  biotin--protein ligase  32.65 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2904  biotin--protein ligase  32.65 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.125895  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2919  biotin--protein ligase  32.65 
 
 		 306 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3740  biotin--protein ligase  31.23 
 
 		 319 aa  92.8  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00032759  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3998  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.03 
 
 		 328 aa  92.8  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00153965  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0168  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.99 
 
 		 333 aa  92.8  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0500  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.58 
 
 		 329 aa  92.4  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3204  biotin--protein ligase  32.35 
 
 		 319 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0069  biotin--protein ligase  32.35 
 
 		 319 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0235  biotin--protein ligase  32.35 
 
 		 319 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1358  biotin--protein ligase  32.35 
 
 		 319 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0784904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1631  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  29.52 
 
 		 326 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.104533 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1463  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.52 
 
 		 326 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1447  birA bifunctional protein  29.52 
 
 		 326 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.867427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1420  biotin operon repressor  29.96 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1560  bifunctional biotin operon repressor/biotin--[acetyl-CoA-carboxylase] synthetase  29.52 
 
 		 326 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1419  biotin operon repressor  29.52 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1044  biotin operon repressor  27.13 
 
 		 323 aa  90.5  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4072  biotin--protein ligase  29.55 
 
 		 319 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0132  biotin--protein ligase  30.04 
 
 		 320 aa  90.1  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000234608  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0937  bifunctional protein birA  27.13 
 
 		 323 aa  90.5  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2816  biotin--protein ligase  32.77 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.688853  normal  0.200473 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1781  birA bifunctional protein  33.21 
 
 		 331 aa  90.1  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4745  biotin--protein ligase  31.06 
 
 		 333 aa  90.1  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.167382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3752  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  29.89 
 
 		 326 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0915  biotin--(acetyl-CoA-carboxylase) ligase  31.84 
 
 		 332 aa  89.7  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.277179  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0447  biotin--protein ligase  32.03 
 
 		 319 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0168  biotin--protein ligase  30.5 
 
 		 320 aa  89.7  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00063361  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2717  biotin--protein ligase  31.77 
 
 		 320 aa  89.7  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000120108  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0609  biotin--protein ligase  32.03 
 
 		 319 aa  89.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0428  biotin--protein ligase  32.03 
 
 		 319 aa  89.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.372938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1666  birA bifunctional protein  29.15 
 
 		 326 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0086  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.37 
 
 		 332 aa  89  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0775  transcriptional repressor of the biotin operon / biotin acetyl-CoA-carboxylase synthetase; RBL03563  26.3 
 
 		 325 aa  89  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000728901  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1593  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  29.15 
 
 		 326 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1967  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.33 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4174  biotin--protein ligase  28.85 
 
 		 319 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000228488  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1704  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  29.67 
 
 		 326 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0104372  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0201  biotin--protein ligase  31.48 
 
 		 319 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286867  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0180  biotin--protein ligase  28.85 
 
 		 319 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0210584  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4140  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.18 
 
 		 264 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>