More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0102 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0102  biotin--protein ligase  100 
 
 
305 aa  592  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0073  biotin--protein ligase  74.82 
 
 
285 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.702906 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0312  biotin--protein ligase  47.89 
 
 
296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0167  biotin--protein ligase  46.67 
 
 
293 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0174  biotin--protein ligase  46.34 
 
 
293 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0490  biotin--protein ligase  41.81 
 
 
297 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0887139 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4226  biotin--protein ligase  42.01 
 
 
305 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0204  biotin--protein ligase  39.6 
 
 
319 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3757  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  43.48 
 
 
267 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.450721 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2919  biotin--protein ligase  39.74 
 
 
306 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2290  biotin--protein ligase  39.74 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2904  biotin--protein ligase  39.74 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.125895  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6247  biotin--protein ligase  40.7 
 
 
306 aa  146  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.791629 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2816  biotin--protein ligase  38.78 
 
 
306 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.688853  normal  0.200473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4629  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  40.62 
 
 
283 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4716  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.2 
 
 
292 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492677  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2953  biotin--protein ligase  40.55 
 
 
306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  41.22 
 
 
276 aa  138  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.614952 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5200  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  40.49 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.105506  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0069  biotin--protein ligase  40.5 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1358  biotin--protein ligase  40.5 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0784904  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0235  biotin--protein ligase  40.5 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3204  biotin--protein ligase  40.5 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0609  biotin--protein ligase  40.5 
 
 
319 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0447  biotin--protein ligase  40.75 
 
 
319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0428  biotin--protein ligase  40.69 
 
 
319 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.372938  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2081  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.22 
 
 
325 aa  127  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1967  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.37 
 
 
262 aa  127  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3992  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.66 
 
 
285 aa  126  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.182521 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3175  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.25 
 
 
303 aa  126  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.684146  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0370  biotin--protein ligase  42.52 
 
 
320 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0326078  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3341  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.98 
 
 
285 aa  123  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1674  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.38 
 
 
261 aa  123  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03573  putative BirA bifunctional protein  36.4 
 
 
328 aa  123  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.184427  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0197  biotin--protein ligase  35.18 
 
 
317 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00143406  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3953  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.86 
 
 
268 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0227  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.95 
 
 
262 aa  120  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00038256 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3998  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.78 
 
 
328 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00153965  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3652  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.11 
 
 
277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0948912  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4334  biotin--protein ligase  32.34 
 
 
320 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.152634  hitchhiker  0.00000000217796 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3965  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.65 
 
 
308 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.89958  normal  0.0374002 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0419  biotin--protein ligase  34.02 
 
 
310 aa  114  3e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0132  biotin--protein ligase  34.55 
 
 
320 aa  113  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000234608  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0168  biotin--protein ligase  33.21 
 
 
320 aa  112  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00063361  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4706  biotin--protein ligase  30.48 
 
 
320 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.144079  hitchhiker  0.00201782 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0268  biotin--protein ligase  37.45 
 
 
320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0393829  hitchhiker  0.0050705 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4745  biotin--protein ligase  33.72 
 
 
333 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.167382  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3943  biotin--protein ligase  33.95 
 
 
320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.596693  decreased coverage  0.000472258 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2082  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.21 
 
 
329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0327  biotin--protein ligase  32.61 
 
 
319 aa  109  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0364706  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3871  biotin--protein ligase  32.61 
 
 
319 aa  109  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000364778  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3396  biotin--protein ligase  32.61 
 
 
319 aa  109  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.199101  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0775  transcriptional repressor of the biotin operon / biotin acetyl-CoA-carboxylase synthetase; RBL03563  31.56 
 
 
325 aa  109  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000728901  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4174  biotin--protein ligase  32.39 
 
 
319 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000228488  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0180  biotin--protein ligase  32.39 
 
 
319 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0210584  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0142  biotin--protein ligase  30.63 
 
 
319 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.330287  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0184  biotin--protein ligase  31.98 
 
 
319 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.570128  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0182  biotin--protein ligase  34.65 
 
 
319 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000279859  normal  0.096767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0183  biotin--protein ligase  34.65 
 
 
319 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00618712  normal  0.258521 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0937  bifunctional protein birA  31.35 
 
 
323 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0086  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.97 
 
 
332 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1044  biotin operon repressor  31.35 
 
 
323 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0219  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.2 
 
 
322 aa  107  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.440436  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4072  biotin--protein ligase  31.98 
 
 
319 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3775  biotin--protein ligase  31.85 
 
 
319 aa  106  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00231404  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0214  biotin--protein ligase  32.89 
 
 
319 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0406  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36 
 
 
326 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.617579  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4017  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.92 
 
 
321 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0118949  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4766  biotin--protein ligase  33.98 
 
 
321 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0199355  normal  0.789599 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03854  biotin-protein ligase  35.92 
 
 
321 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0188201  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4421  biotin--protein ligase  35.92 
 
 
321 aa  103  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000434302  hitchhiker  0.00072275 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4512  biotin--protein ligase  35.92 
 
 
321 aa  103  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295045  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4461  biotin--protein ligase  35.92 
 
 
321 aa  103  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000740491  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4047  biotin--protein ligase  35.92 
 
 
321 aa  103  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0641292  hitchhiker  0.00297103 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4207  biotin--protein ligase  35.92 
 
 
321 aa  103  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000658318  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0154  biotin--protein ligase  32.76 
 
 
323 aa  103  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00266236  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0816  biotin--protein ligase  34.24 
 
 
293 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5438  biotin--protein ligase  35.92 
 
 
321 aa  103  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000183056  hitchhiker  0.00134266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03807  hypothetical protein  35.92 
 
 
321 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0460  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.18 
 
 
331 aa  102  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0263  biotin acetyl-CoA-carboxylase synthetase  38.7 
 
 
291 aa  102  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147869 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4349  biotin--protein ligase  32.34 
 
 
320 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000983671  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4546  biotin--protein ligase  32.34 
 
 
320 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000449604  hitchhiker  0.00000000138084 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4468  biotin--protein ligase  32.34 
 
 
320 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0221784  hitchhiker  0.00169649 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4471  biotin--protein ligase  32.34 
 
 
320 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000340796  hitchhiker  0.00000000000240151 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4381  biotin--protein ligase  32.34 
 
 
320 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0201  biotin--protein ligase  31.96 
 
 
319 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286867  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3740  biotin--protein ligase  30.03 
 
 
319 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00032759  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4292  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.72 
 
 
317 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.422429  hitchhiker  0.0000115964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0470  biotin--protein ligase  34.48 
 
 
319 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0969933  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08620  biotin--protein ligase  33.33 
 
 
312 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000664696 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0788  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.13 
 
 
318 aa  100  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0437  biotin--protein ligase  34.48 
 
 
319 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193351  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0467  biotin--protein ligase  33.33 
 
 
319 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800228  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3895  biotin--protein ligase  30.45 
 
 
319 aa  99.8  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.282712  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2553  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.42 
 
 
299 aa  99.4  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0195  biotin--protein ligase  32.3 
 
 
319 aa  99.4  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1781  birA bifunctional protein  32.38 
 
 
331 aa  98.2  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0915  biotin--(acetyl-CoA-carboxylase) ligase  35.54 
 
 
332 aa  99  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.277179  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4741  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.33 
 
 
266 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>