More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0243 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0243  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 440 aa  877    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.182435 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0167  histidine kinase  43.02 
 
 		 429 aa  296  6e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 475 aa  224  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02837  two-component system sensor protein required for AvrXa21activity H2 (raxH2)  33.11 
 
 		 456 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1957  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 443 aa  206  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0083917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3354  ribose 5-phosphate isomerase  30.04 
 
 		 456 aa  206  8e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000158163  normal  0.115638 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3304  sensor histidine kinase  31.85 
 
 		 466 aa  203  6e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1841  two-component system, sensor protein  32.33 
 
 		 482 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775188  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3684  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.714122  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 482 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.480782  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 454 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0442368  normal  0.692011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1131  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 442 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4239  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.44 
 
 		 450 aa  193  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 454 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0526543  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1680  sensor protein PhoQ  30.29 
 
 		 448 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3708  sensor histidine kinase  30.07 
 
 		 448 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642299  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3381  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00620745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3247  sensor histidine kinase  28.26 
 
 		 469 aa  188  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000098482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4141  histidine kinase  29.3 
 
 		 454 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 443 aa  186  7e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0281  sensor histidine kinase  26.58 
 
 		 475 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.012454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2841  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 445 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2936  histidine kinase  27.13 
 
 		 517 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00120898  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 448 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1217  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 448 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1263  ATP-binding region, ATPase-like protein  27.17 
 
 		 474 aa  178  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000081586  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2975  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 460 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3909  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 454 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000571443  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3818  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 		 454 aa  177  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00854299  decreased coverage  0.0034747 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 		 454 aa  176  8e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4648  sensor histidine kinase  28.63 
 
 		 454 aa  176  9e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1389  sensor protein PhoQ  27.8 
 
 		 470 aa  175  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.812387  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 448 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4026  ATPase domain-containing protein  28.19 
 
 		 454 aa  172  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02298  sensor histidine kinase  27.13 
 
 		 443 aa  170  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1199  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 448 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49170  two-component sensor PhoQ  30.38 
 
 		 448 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000325542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 459 aa  159  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4199  two-component sensor PhoQ  30.16 
 
 		 448 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0802  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 		 463 aa  152  8e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00906644 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2696  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 484 aa  152  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110077  normal  0.128468 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 449 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0121943 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 449 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.796582  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 449 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1684  histidine kinase  29.71 
 
 		 471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1849  histidine kinase  31.32 
 
 		 449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00571096  hitchhiker  0.00108599 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 471 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1409  ATPase domain-containing protein  29.49 
 
 		 471 aa  147  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  27.7 
 
 		 458 aa  146  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1723  ATPase domain-containing protein  32.33 
 
 		 449 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124766 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1945  sensor protein PhoQ  32.21 
 
 		 449 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 472 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206747 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 459 aa  145  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1745  histidine kinase  31.82 
 
 		 450 aa  144  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000105534  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1790  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 451 aa  142  8e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1541  sensor protein PhoQ  29.75 
 
 		 450 aa  143  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 449 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 449 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0689547  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2349  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 449 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000892956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1579  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 449 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.15351 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2805  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 449 aa  141  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00328953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 458 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  28.15 
 
 		 444 aa  137  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1642  sensor protein PhoQ  30.69 
 
 		 487 aa  137  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 463 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1607  sensor protein PhoQ  29.41 
 
 		 484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5572  putative two-component sensor histidine kinase  29.87 
 
 		 471 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.118515 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 453 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 464 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 465 aa  133  6.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 465 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 460 aa  132  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.378674  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1347  sensor protein PhoQ  30.51 
 
 		 487 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1331  sensor protein PhoQ  30.51 
 
 		 487 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0246748  normal  0.298422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2136  sensor protein PhoQ  30.51 
 
 		 487 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.062219 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  24.94 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1309  sensor protein PhoQ  30.51 
 
 		 487 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1954  sensor protein PhoQ  30.51 
 
 		 487 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 		 478 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131083  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  26.08 
 
 		 462 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1714  sensor protein PhoQ  29.04 
 
 		 468 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2856  sensor protein PhoQ  29.04 
 
 		 484 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2673  histidine kinase  27.93 
 
 		 436 aa  129  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000107272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0614  ATPase domain-containing protein  31.8 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.617782  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  28.71 
 
 		 448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1938  sensor protein PhoQ  29.45 
 
 		 483 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0615  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.27687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0604  sensor histidine kinase  28.35 
 
 		 436 aa  128  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  28.71 
 
 		 448 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3415  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 442 aa  128  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.210462 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2067  sensor protein PhoQ  30.34 
 
 		 483 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.194184  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1996  sensor protein PhoQ  28.32 
 
 		 486 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.687103 
 
 
-
 
NC_004310  BR0605  sensor histidine kinase  27.5 
 
 		 432 aa  127  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.972928  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2150  sensor protein PhoQ  29.59 
 
 		 486 aa  126  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0666594  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 465 aa  126  6e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 442 aa  126  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  23.82 
 
 		 449 aa  126  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2518  histidine kinase  28.32 
 
 		 486 aa  126  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.208145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>