More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1389 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1389  sensor protein PhoQ  100 
 
 		 470 aa  957    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.812387  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0281  sensor histidine kinase  49.04 
 
 		 475 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.012454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3247  sensor histidine kinase  51.2 
 
 		 469 aa  431  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000098482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.34 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0442368  normal  0.692011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1131  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.33 
 
 		 442 aa  424  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4141  histidine kinase  49.34 
 
 		 454 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.91 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0526543  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4648  sensor histidine kinase  49.46 
 
 		 454 aa  410  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2936  histidine kinase  45.33 
 
 		 517 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00120898  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2696  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.27 
 
 		 484 aa  404  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110077  normal  0.128468 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3818  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.02 
 
 		 454 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00854299  decreased coverage  0.0034747 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3909  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.23 
 
 		 454 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000571443  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1263  ATP-binding region, ATPase-like protein  45.4 
 
 		 474 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000081586  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4026  ATPase domain-containing protein  49.02 
 
 		 454 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.12 
 
 		 454 aa  397  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3381  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.87 
 
 		 466 aa  391  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00620745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3304  sensor histidine kinase  43.74 
 
 		 466 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2841  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 445 aa  280  4e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02298  sensor histidine kinase  34.13 
 
 		 443 aa  259  6e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3354  ribose 5-phosphate isomerase  32.47 
 
 		 456 aa  249  7e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000158163  normal  0.115638 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4239  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 450 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3708  sensor histidine kinase  32.05 
 
 		 448 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642299  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1680  sensor protein PhoQ  32.48 
 
 		 448 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02837  two-component system sensor protein required for AvrXa21activity H2 (raxH2)  30.39 
 
 		 456 aa  228  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 		 443 aa  229  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0167  histidine kinase  33.26 
 
 		 429 aa  229  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1841  two-component system, sensor protein  30.19 
 
 		 482 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775188  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 482 aa  225  1e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.480782  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 448 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 475 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 448 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1217  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 448 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1957  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 443 aa  215  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0083917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1199  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 448 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2975  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 460 aa  209  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3684  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 455 aa  206  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.714122  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0243  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 440 aa  196  6e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.182435 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1642  sensor protein PhoQ  36 
 
 		 487 aa  188  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49170  two-component sensor PhoQ  30.84 
 
 		 448 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000325542 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2349  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 449 aa  186  8e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000892956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1954  sensor protein PhoQ  34.57 
 
 		 487 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1347  sensor protein PhoQ  34.57 
 
 		 487 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1331  sensor protein PhoQ  34.57 
 
 		 487 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0246748  normal  0.298422 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1309  sensor protein PhoQ  34.57 
 
 		 487 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2136  sensor protein PhoQ  34.57 
 
 		 487 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.062219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4199  two-component sensor PhoQ  30.41 
 
 		 448 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1790  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 		 450 aa  180  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1996  sensor protein PhoQ  34.26 
 
 		 486 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.687103 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1249  sensor protein PhoQ  34.26 
 
 		 486 aa  179  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2474  sensor protein PhoQ  34.26 
 
 		 486 aa  179  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.701623  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01127  sensory histidine kinase in two-compoent regulatory system with PhoP  33.95 
 
 		 486 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2518  histidine kinase  33.95 
 
 		 486 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.208145  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01135  hypothetical protein  33.95 
 
 		 486 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1590  sensor protein PhoQ  33.95 
 
 		 486 aa  178  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000452252 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1292  sensor protein PhoQ  33.95 
 
 		 486 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1307  sensor protein PhoQ  33.95 
 
 		 486 aa  177  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1745  histidine kinase  39 
 
 		 450 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000105534  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  30.28 
 
 		 462 aa  169  7e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1849  histidine kinase  36.92 
 
 		 449 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00571096  hitchhiker  0.00108599 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0121943 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.796582  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 449 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  29.78 
 
 		 449 aa  167  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1945  sensor protein PhoQ  37.84 
 
 		 449 aa  166  9e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1714  sensor protein PhoQ  36.98 
 
 		 468 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2805  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 449 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00328953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1723  ATPase domain-containing protein  37.35 
 
 		 449 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124766 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1541  sensor protein PhoQ  35.81 
 
 		 450 aa  164  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2067  sensor protein PhoQ  31.07 
 
 		 483 aa  164  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.194184  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 449 aa  164  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1607  sensor protein PhoQ  36.23 
 
 		 484 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2856  sensor protein PhoQ  36.23 
 
 		 484 aa  163  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2150  sensor protein PhoQ  36.33 
 
 		 486 aa  163  6e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0666594  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1579  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 449 aa  161  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.15351 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 449 aa  161  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0689547  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1938  sensor protein PhoQ  34.36 
 
 		 483 aa  160  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 		 441 aa  160  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000107272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1865  sensor protein PhoQ  32.33 
 
 		 484 aa  160  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  30.84 
 
 		 444 aa  159  8e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3211  sensor histidine kinase  28.69 
 
 		 439 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.608335  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1886  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 		 484 aa  158  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 442 aa  156  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3380  sensor histidine kinase  28.27 
 
 		 439 aa  156  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.625161  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 459 aa  155  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2012  sensor protein PhoQ  35.58 
 
 		 485 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0783662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1948  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 439 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 460 aa  153  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.378674  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 		 445 aa  153  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.684402  normal  0.489398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4931  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 450 aa  153  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.231481 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3512  histidine kinase  29.39 
 
 		 441 aa  152  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00937623  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 452 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  27.07 
 
 		 448 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 442 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 459 aa  150  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  27.07 
 
 		 448 aa  150  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5572  putative two-component sensor histidine kinase  28.45 
 
 		 471 aa  150  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.118515 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3693  histidine kinase  32.21 
 
 		 442 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 464 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>