More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0352 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0352  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 116 aa  234  2e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1979  50S ribosomal protein L17  96.55 
 
 		 116 aa  227  4e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.205513  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23271  50S ribosomal protein L17  91.38 
 
 		 116 aa  216  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16541  50S ribosomal protein L17  84.48 
 
 		 116 aa  202  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.173204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19801  50S ribosomal protein L17  83.62 
 
 		 116 aa  200  4e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1105  50S ribosomal protein L17  83.62 
 
 		 116 aa  200  4e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1627  50S ribosomal protein L17  82.76 
 
 		 116 aa  199  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17421  50S ribosomal protein L17  81.03 
 
 		 116 aa  196  7e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17261  50S ribosomal protein L17  81.03 
 
 		 116 aa  196  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2208  50S ribosomal protein L17  79.13 
 
 		 116 aa  192  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17161  50S ribosomal protein L17  78.45 
 
 		 116 aa  191  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1317  50S ribosomal protein L17  76.72 
 
 		 116 aa  187  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0716  50S ribosomal protein L17  73.28 
 
 		 116 aa  181  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000127542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2584  50S ribosomal protein L17  72.41 
 
 		 116 aa  179  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2987  50S ribosomal protein L17  70.69 
 
 		 116 aa  179  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3728  50S ribosomal protein L17  78.45 
 
 		 116 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0224  50S ribosomal protein L17  76.72 
 
 		 116 aa  170  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0023231  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0227  50S ribosomal protein L17  76.72 
 
 		 116 aa  170  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8720  predicted protein  60.34 
 
 		 116 aa  151  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.702196  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29223  Plastid ribosomal protein L17 large ribosomal subunit  62.07 
 
 		 145 aa  147  5e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.379624  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  56.48 
 
 		 112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  56.07 
 
 		 203 aa  120  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  50.93 
 
 		 113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  50.93 
 
 		 113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  54.63 
 
 		 113 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  53.57 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  54.72 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1456  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714244  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  48.28 
 
 		 202 aa  113  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  50 
 
 		 229 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  49.55 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23520  LSU ribosomal protein L17P  54.72 
 
 		 164 aa  110  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 195 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  50.93 
 
 		 112 aa  110  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 195 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  51.85 
 
 		 112 aa  110  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_445  ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 117 aa  110  6e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 195 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 116 aa  110  9e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0224  LSU ribosomal protein L17P  49.07 
 
 		 113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.65294 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  49.07 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0503  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000331122  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  54.72 
 
 		 190 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0480  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000309842  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 197 aa  107  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 202 aa  107  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  50.46 
 
 		 268 aa  107  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  52.83 
 
 		 190 aa  107  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1804  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 122 aa  106  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 180 aa  106  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  49.54 
 
 		 219 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  51.89 
 
 		 190 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 172 aa  105  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  49.53 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1256  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  0.275749 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2625  ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0085  50S ribosomal protein L17  49.19 
 
 		 128 aa  104  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0996581  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2250  50S ribosomal protein L17  49.15 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0379029  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 155 aa  104  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2291  50S ribosomal protein L17  49.15 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6582  ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 196 aa  104  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  50.46 
 
 		 113 aa  104  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  52.88 
 
 		 179 aa  103  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04280  LSU ribosomal protein L17P  51.89 
 
 		 189 aa  103  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0222  50S ribosomal protein L17  45.9 
 
 		 127 aa  103  6e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 178 aa  103  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 183 aa  102  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 184 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 208 aa  101  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0294  50S ribosomal protein L17  45.3 
 
 		 118 aa  101  4e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133878  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0716  ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 202 aa  101  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1880  50S ribosomal protein L17  47.58 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3381  ribosomal protein L17  48.6 
 
 		 233 aa  100  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 117 aa  100  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 120 aa  100  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 120 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 175 aa  98.6  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4969  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 199 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.392078  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  50.94 
 
 		 169 aa  99  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0278  ribosomal protein L17  46.79 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 135 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2996  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 116 aa  97.8  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803225 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1734  50S ribosomal protein L17  47.71 
 
 		 183 aa  97.8  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0169  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 194 aa  97.8  5e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.474086 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0655  ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 178 aa  97.1  7e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.929452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>