More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2208 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2208  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 116 aa  234  3e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1317  50S ribosomal protein L17  80.17 
 
 		 116 aa  192  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0352  50S ribosomal protein L17  79.13 
 
 		 116 aa  192  2e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1979  50S ribosomal protein L17  79.13 
 
 		 116 aa  191  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.205513  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23271  50S ribosomal protein L17  76.52 
 
 		 116 aa  185  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2987  50S ribosomal protein L17  75.65 
 
 		 116 aa  185  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2584  50S ribosomal protein L17  77.39 
 
 		 116 aa  182  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0716  50S ribosomal protein L17  75.86 
 
 		 116 aa  180  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000127542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16541  50S ribosomal protein L17  74.78 
 
 		 116 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.173204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19801  50S ribosomal protein L17  73.91 
 
 		 116 aa  177  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1105  50S ribosomal protein L17  73.91 
 
 		 116 aa  177  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1627  50S ribosomal protein L17  72.41 
 
 		 116 aa  177  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3728  50S ribosomal protein L17  80 
 
 		 116 aa  177  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17421  50S ribosomal protein L17  71.55 
 
 		 116 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17261  50S ribosomal protein L17  72.17 
 
 		 116 aa  175  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17161  50S ribosomal protein L17  72.17 
 
 		 116 aa  174  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0227  50S ribosomal protein L17  78.45 
 
 		 116 aa  169  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0224  50S ribosomal protein L17  78.45 
 
 		 116 aa  169  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0023231  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8720  predicted protein  65.52 
 
 		 116 aa  160  7e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.702196  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29223  Plastid ribosomal protein L17 large ribosomal subunit  64.35 
 
 		 145 aa  150  5e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.379624  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  56.48 
 
 		 112 aa  123  9e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  56.48 
 
 		 113 aa  116  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  50.47 
 
 		 113 aa  114  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  50.47 
 
 		 113 aa  114  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1456  50S ribosomal protein L17  48.76 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714244  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0224  LSU ribosomal protein L17P  51.4 
 
 		 113 aa  109  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.65294 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0085  50S ribosomal protein L17  49.59 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0996581  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0222  50S ribosomal protein L17  46.28 
 
 		 127 aa  107  6e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  50.93 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  49.06 
 
 		 203 aa  107  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  45.22 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  47.75 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  47.22 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  47.22 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1256  50S ribosomal protein L17  47.83 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  0.275749 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1880  50S ribosomal protein L17  48.78 
 
 		 128 aa  105  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_445  ribosomal protein L17  45.22 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  47.83 
 
 		 155 aa  103  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4941  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 115 aa  103  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  50.47 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0480  50S ribosomal protein L17  43.48 
 
 		 117 aa  103  9e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000309842  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  47.66 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0503  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000331122  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1804  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0204  50S ribosomal protein L17  42.61 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 117 aa  101  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  44.44 
 
 		 202 aa  101  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2250  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0379029  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2291  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  47.62 
 
 		 170 aa  100  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  45.22 
 
 		 168 aa  100  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  46.09 
 
 		 178 aa  100  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  47.22 
 
 		 229 aa  100  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 120 aa  100  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  44.44 
 
 		 180 aa  100  9e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  44.44 
 
 		 202 aa  99.4  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  46.09 
 
 		 184 aa  99.8  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  43.52 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  44.44 
 
 		 195 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  41.74 
 
 		 208 aa  99.4  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  44.44 
 
 		 195 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  44.44 
 
 		 195 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0294  50S ribosomal protein L17  44.44 
 
 		 118 aa  99  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133878  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0627  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 134 aa  98.2  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  47.22 
 
 		 172 aa  97.8  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  44.35 
 
 		 183 aa  98.2  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 135 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0348  ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0096  50S ribosomal protein L17  44.35 
 
 		 117 aa  97.4  5e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000142816  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  43.48 
 
 		 124 aa  97.1  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0060  50S ribosomal protein L17  41.74 
 
 		 118 aa  97.1  7e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.927708  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  47.62 
 
 		 190 aa  97.1  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23520  LSU ribosomal protein L17P  46.67 
 
 		 164 aa  97.1  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  49.52 
 
 		 190 aa  97.1  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  44.44 
 
 		 219 aa  96.7  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0716  ribosomal protein L17  43.52 
 
 		 202 aa  96.3  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2996  50S ribosomal protein L17  45.22 
 
 		 116 aa  96.3  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803225 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0169  50S ribosomal protein L17  46.09 
 
 		 194 aa  96.3  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.474086 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  43.1 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3381  ribosomal protein L17  43.4 
 
 		 233 aa  95.5  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1643  ribosomal protein L17  45.22 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2374  50S ribosomal protein L17  48.76 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0621  50S ribosomal protein L17P  44.8 
 
 		 131 aa  95.1  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  43.48 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  42.61 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  44.35 
 
 		 130 aa  94.7  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>