More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0451 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  100 
 
 
112 aa  225  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  71.43 
 
 
112 aa  166  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  70.54 
 
 
112 aa  163  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  68.75 
 
 
112 aa  160  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  66.96 
 
 
112 aa  154  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  65.77 
 
 
113 aa  150  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  65.77 
 
 
113 aa  150  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  60.83 
 
 
120 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  60.83 
 
 
120 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  60.83 
 
 
120 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  60.83 
 
 
120 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  60.83 
 
 
120 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  60.83 
 
 
120 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  60.83 
 
 
120 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  60.83 
 
 
120 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  60.83 
 
 
120 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  60.83 
 
 
120 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  60.83 
 
 
120 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  60 
 
 
120 aa  148  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  59.17 
 
 
120 aa  147  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0224  LSU ribosomal protein L17P  60.71 
 
 
113 aa  147  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.65294 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  64.22 
 
 
124 aa  147  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1804  50S ribosomal protein L17  63.11 
 
 
122 aa  146  9e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  62.5 
 
 
112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  61.47 
 
 
127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2291  50S ribosomal protein L17  62.3 
 
 
122 aa  143  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  64.22 
 
 
113 aa  144  6e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2250  50S ribosomal protein L17  62.3 
 
 
122 aa  143  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0379029  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  61.26 
 
 
178 aa  142  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  61.26 
 
 
175 aa  141  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  60 
 
 
113 aa  141  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  61.26 
 
 
168 aa  141  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  59.82 
 
 
113 aa  140  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  61.26 
 
 
184 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  59.63 
 
 
155 aa  137  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2682  ribosomal protein L17  57.02 
 
 
121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0293066  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  60.55 
 
 
113 aa  134  5e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  54.46 
 
 
114 aa  132  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  54.95 
 
 
116 aa  132  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0085  50S ribosomal protein L17  54.69 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0996581  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0317  50S ribosomal protein L17  55.12 
 
 
127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.09582e-21 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0222  50S ribosomal protein L17  53.97 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1456  50S ribosomal protein L17  53.17 
 
 
127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714244  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  57.41 
 
 
179 aa  128  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1880  50S ribosomal protein L17  52.34 
 
 
128 aa  128  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  56.48 
 
 
229 aa  128  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  55.05 
 
 
151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  56.48 
 
 
268 aa  127  7.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  61.86 
 
 
144 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  54.63 
 
 
190 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  56.25 
 
 
146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  57.41 
 
 
197 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  51.85 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  57.27 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  56.48 
 
 
208 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0503  50S ribosomal protein L17  55.05 
 
 
117 aa  124  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000331122  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0621  50S ribosomal protein L17P  51.54 
 
 
131 aa  124  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  55.36 
 
 
140 aa  124  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  53.57 
 
 
141 aa  124  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0480  50S ribosomal protein L17  53.21 
 
 
117 aa  123  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000309842  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2625  ribosomal protein L17  55.56 
 
 
168 aa  123  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_445  ribosomal protein L17  53.21 
 
 
117 aa  123  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  53.7 
 
 
190 aa  123  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  56.48 
 
 
172 aa  122  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1256  50S ribosomal protein L17  54.63 
 
 
161 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  0.275749 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  54.13 
 
 
117 aa  122  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  51.85 
 
 
170 aa  121  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  54.13 
 
 
129 aa  121  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  53.64 
 
 
135 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  53.21 
 
 
131 aa  120  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  53.21 
 
 
132 aa  120  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0077  50S ribosomal protein L17  54.13 
 
 
131 aa  120  7e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000148079 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  53.64 
 
 
138 aa  120  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  52.25 
 
 
143 aa  120  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  52.73 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  53.7 
 
 
190 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  53.15 
 
 
131 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  55.56 
 
 
203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  52.73 
 
 
141 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  52.29 
 
 
131 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  50.46 
 
 
137 aa  118  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  51.85 
 
 
195 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  51.85 
 
 
195 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  52.29 
 
 
131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  51.82 
 
 
138 aa  117  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  50.45 
 
 
137 aa  117  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  51.85 
 
 
195 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  51.38 
 
 
132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl151  50S ribosomal protein L17  51.26 
 
 
119 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.405073  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  50.46 
 
 
141 aa  117  6e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  51.38 
 
 
132 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  52.78 
 
 
169 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2748  ribosomal protein L17  53.15 
 
 
138 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.727707  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  51.85 
 
 
222 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  50.45 
 
 
141 aa  116  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  53.57 
 
 
141 aa  116  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  51.35 
 
 
140 aa  116  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  51.38 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  52.25 
 
 
140 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23271  50S ribosomal protein L17  53.7 
 
 
116 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>