More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1374 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  85.59 
 
 		 175 aa  210  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  85.59 
 
 		 178 aa  209  7.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  81.36 
 
 		 184 aa  202  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  80.8 
 
 		 127 aa  199  8e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  81.2 
 
 		 168 aa  197  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  72.03 
 
 		 155 aa  176  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  79.59 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  63.87 
 
 		 151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  63.25 
 
 		 146 aa  154  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  63.25 
 
 		 141 aa  152  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  66.97 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  65.52 
 
 		 208 aa  152  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  62.39 
 
 		 141 aa  151  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  62.39 
 
 		 140 aa  151  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  61.54 
 
 		 143 aa  150  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  61.54 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  61.67 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  61.67 
 
 		 141 aa  147  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  60.68 
 
 		 138 aa  147  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  64.22 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  58.97 
 
 		 139 aa  146  8e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  61.54 
 
 		 141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  64.22 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  58.12 
 
 		 142 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  62.18 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  61.54 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  61.54 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  61.54 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  58.12 
 
 		 140 aa  144  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  58.12 
 
 		 137 aa  143  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  60.5 
 
 		 120 aa  143  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  61.98 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  62.39 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 140 aa  141  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  58.12 
 
 		 141 aa  140  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1961  50S ribosomal protein L17  59.83 
 
 		 158 aa  139  9e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  60.55 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2046  50S ribosomal protein L17  58.97 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0786511  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1918  50S ribosomal protein L17  58.97 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 140 aa  137  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  57.26 
 
 		 138 aa  138  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  57.26 
 
 		 137 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  62.5 
 
 		 113 aa  137  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  58.12 
 
 		 140 aa  137  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  58.12 
 
 		 120 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  58.12 
 
 		 120 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  58.12 
 
 		 120 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  58.12 
 
 		 120 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  58.12 
 
 		 120 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  58.12 
 
 		 120 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  58.12 
 
 		 120 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  58.12 
 
 		 120 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  58.12 
 
 		 120 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  58.12 
 
 		 120 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1939  50S ribosomal protein L17  58.97 
 
 		 168 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  58.12 
 
 		 120 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 138 aa  137  7e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 139 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  60.55 
 
 		 112 aa  136  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  55.91 
 
 		 138 aa  136  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 136 aa  135  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 138 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0085  50S ribosomal protein L17  56 
 
 		 128 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0996581  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  58.72 
 
 		 113 aa  134  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  58.72 
 
 		 113 aa  134  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  58.56 
 
 		 114 aa  134  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2509  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 139 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.745035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 172 aa  133  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2682  ribosomal protein L17  58.47 
 
 		 121 aa  133  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0293066  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 128 aa  133  9e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 138 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 229 aa  132  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 138 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0317  50S ribosomal protein L17  57.26 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.09582e-21 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 139 aa  131  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_445  ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1880  50S ribosomal protein L17  54.4 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 135 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 179 aa  130  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  51.24 
 
 		 137 aa  130  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 138 aa  130  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 138 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_002936  DET0503  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 117 aa  130  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000331122  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  58.72 
 
 		 113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  54.7 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0480  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 117 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000309842  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0792  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 179 aa  128  3e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  56.03 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3922  ribosomal protein L17  50 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  52.07 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  54.1 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  54.1 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  54.1 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  50.81 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  56.03 
 
 		 131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2190  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.407841  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>