More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0280 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 141 aa  284  2.9999999999999996e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  87.23 
 
 		 138 aa  251  3e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  87.14 
 
 		 140 aa  250  5.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  85.61 
 
 		 139 aa  246  6e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  85.61 
 
 		 139 aa  246  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  88.89 
 
 		 138 aa  243  4.9999999999999997e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2509  50S ribosomal protein L17  84.17 
 
 		 139 aa  242  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.745035  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  70.23 
 
 		 142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  70.23 
 
 		 142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  67.14 
 
 		 140 aa  196  7e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  65.71 
 
 		 141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  71.77 
 
 		 140 aa  192  9e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  68.7 
 
 		 143 aa  192  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  70.16 
 
 		 137 aa  191  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  69.53 
 
 		 142 aa  191  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  69.23 
 
 		 140 aa  190  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  67.18 
 
 		 141 aa  190  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  70.16 
 
 		 142 aa  189  8e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  70.97 
 
 		 140 aa  189  8e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  67.69 
 
 		 140 aa  189  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  67.18 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  70.97 
 
 		 138 aa  189  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  71.77 
 
 		 138 aa  189  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  72.58 
 
 		 139 aa  189  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  68.09 
 
 		 140 aa  188  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  69.35 
 
 		 140 aa  187  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  64.49 
 
 		 138 aa  186  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  70.16 
 
 		 135 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  68.55 
 
 		 137 aa  183  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  68.55 
 
 		 136 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  68.55 
 
 		 138 aa  180  7e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  66.94 
 
 		 139 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  64.52 
 
 		 138 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  63.71 
 
 		 138 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  63.71 
 
 		 138 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  64.52 
 
 		 141 aa  168  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2190  50S ribosomal protein L17  64.52 
 
 		 136 aa  168  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.407841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  60.43 
 
 		 139 aa  166  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  66.13 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1325  50S ribosomal protein L17  62.9 
 
 		 140 aa  155  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.355864 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3777  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 		 131 aa  153  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0276  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 		 131 aa  153  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0461081 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3505  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 		 131 aa  153  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3719  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 		 131 aa  153  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2604  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 		 131 aa  153  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3749  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 		 131 aa  153  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648028  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3041  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 		 131 aa  153  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490666  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1951  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 		 131 aa  153  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3142  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 		 131 aa  153  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0303  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3474  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  60 
 
 		 126 aa  152  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2732  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0294  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0354  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341272 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0375  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  59.68 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4216  ribosomal protein L17  59.38 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719281  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2300  ribosomal protein L17  61.86 
 
 		 133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2812  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0476754  normal  0.443503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0627  50S ribosomal protein L17P  57.46 
 
 		 134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  58.27 
 
 		 127 aa  151  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  58.27 
 
 		 127 aa  151  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  58.27 
 
 		 127 aa  151  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  58.27 
 
 		 127 aa  151  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  58.27 
 
 		 127 aa  151  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  58.27 
 
 		 127 aa  151  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  58.27 
 
 		 127 aa  151  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  58.27 
 
 		 127 aa  151  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  61.67 
 
 		 132 aa  151  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  61.79 
 
 		 126 aa  150  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  58.27 
 
 		 127 aa  151  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  60.33 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  58.14 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  58.14 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 		 128 aa  150  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  59.5 
 
 		 178 aa  149  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 		 132 aa  149  8.999999999999999e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  59.5 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  57.48 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  59.5 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  57.48 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3617  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201184  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  57.48 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  59.5 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  57.48 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0341  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0245552 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  59.5 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  57.48 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  59.5 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  59.5 
 
 		 128 aa  148  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  57.36 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 		 129 aa  147  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0346  50S ribosomal protein L17  59.23 
 
 		 133 aa  147  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.000393302 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  61.02 
 
 		 128 aa  147  7e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0502  50S ribosomal protein L17  57.69 
 
 		 132 aa  147  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4250  50S ribosomal protein L17  61.16 
 
 		 125 aa  146  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00366931  unclonable  0.00000000000172 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  59.32 
 
 		 129 aa  146  9e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 		 126 aa  146  9e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  60.68 
 
 		 175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>