More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2830 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 175 aa  355  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  77.47 
 
 		 178 aa  252  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  71.2 
 
 		 184 aa  231  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  88.03 
 
 		 168 aa  215  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  85.59 
 
 		 124 aa  210  7.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  77.95 
 
 		 127 aa  207  5e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  67.88 
 
 		 155 aa  187  7e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  83.33 
 
 		 144 aa  178  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  59.26 
 
 		 141 aa  163  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  57.43 
 
 		 151 aa  163  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  60.47 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  64.66 
 
 		 208 aa  158  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 137 aa  157  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  61.72 
 
 		 141 aa  157  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  62.6 
 
 		 141 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  58.21 
 
 		 140 aa  156  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  60.98 
 
 		 141 aa  156  2e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  66.95 
 
 		 126 aa  155  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  64.96 
 
 		 140 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  62.6 
 
 		 140 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  63.25 
 
 		 143 aa  153  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  60.8 
 
 		 142 aa  153  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  59.38 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  59.38 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  55.64 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  56.39 
 
 		 138 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  66.97 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  55.38 
 
 		 139 aa  149  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  54.89 
 
 		 140 aa  148  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  66.06 
 
 		 112 aa  148  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 		 136 aa  148  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  54.89 
 
 		 140 aa  147  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  50.29 
 
 		 172 aa  147  8e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  62.16 
 
 		 112 aa  147  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  55.47 
 
 		 138 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  54.61 
 
 		 138 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  57.69 
 
 		 138 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  59.83 
 
 		 128 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  60.68 
 
 		 141 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  61.54 
 
 		 120 aa  143  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  55.04 
 
 		 139 aa  143  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  56.91 
 
 		 138 aa  143  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  62.39 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  51.68 
 
 		 137 aa  142  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  61.82 
 
 		 113 aa  142  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  59.83 
 
 		 120 aa  141  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  61.26 
 
 		 112 aa  141  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  54.62 
 
 		 139 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2682  ribosomal protein L17  60.83 
 
 		 121 aa  140  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0293066  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  56.41 
 
 		 137 aa  140  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1918  50S ribosomal protein L17  60.68 
 
 		 162 aa  140  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2046  50S ribosomal protein L17  60.68 
 
 		 164 aa  140  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0786511  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  60.18 
 
 		 229 aa  140  9e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  54.01 
 
 		 138 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  49.66 
 
 		 139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  51.91 
 
 		 138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  57.98 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  57.98 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  57.98 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  57.98 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  57.98 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  57.98 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  57.98 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  49.66 
 
 		 139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  57.98 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  58.12 
 
 		 140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  57.98 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  57.98 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  57.98 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  51.91 
 
 		 138 aa  139  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  58.12 
 
 		 140 aa  138  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  53.66 
 
 		 140 aa  137  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  51.15 
 
 		 138 aa  137  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2509  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 139 aa  137  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.745035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1961  50S ribosomal protein L17  59.83 
 
 		 158 aa  137  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  53.38 
 
 		 141 aa  137  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  61.26 
 
 		 179 aa  136  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1939  50S ribosomal protein L17  58.97 
 
 		 168 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  61.26 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  58.12 
 
 		 135 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0525  50S ribosomal protein L17  55.46 
 
 		 124 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000217625 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0355  50S ribosomal protein L17  55.46 
 
 		 124 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  61.47 
 
 		 112 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2190  50S ribosomal protein L17  50.37 
 
 		 136 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.407841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  54.62 
 
 		 268 aa  134  6.0000000000000005e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  57.76 
 
 		 132 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  57.76 
 
 		 131 aa  134  8e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  57.76 
 
 		 132 aa  134  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  57.76 
 
 		 131 aa  134  8e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0085  50S ribosomal protein L17  55.91 
 
 		 128 aa  133  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0996581  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0451  50S ribosomal protein L17  58.12 
 
 		 119 aa  133  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.701542  normal  0.045023 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 126 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0792  50S ribosomal protein L17  54.17 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  56.9 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  57.76 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  57.76 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0225  50S ribosomal protein L17  57.76 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000697417  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0220  50S ribosomal protein L17  57.76 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  57.76 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  57.76 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>