More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2175 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 138 aa  285  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  99.28 
 
 		 138 aa  284  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  95.65 
 
 		 138 aa  276  8e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2190  50S ribosomal protein L17  86.67 
 
 		 136 aa  251  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.407841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  86.23 
 
 		 138 aa  247  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  82.35 
 
 		 140 aa  243  8e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  70.29 
 
 		 138 aa  209  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  69.57 
 
 		 138 aa  209  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  75.38 
 
 		 142 aa  208  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  74.62 
 
 		 140 aa  208  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  71.74 
 
 		 137 aa  206  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  70.29 
 
 		 136 aa  203  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  69.57 
 
 		 138 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  69.06 
 
 		 139 aa  199  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  68.12 
 
 		 139 aa  196  7e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  71.77 
 
 		 141 aa  196  7e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  71.77 
 
 		 140 aa  193  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  69.47 
 
 		 140 aa  192  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  66.92 
 
 		 137 aa  191  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  65.19 
 
 		 135 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  67.74 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  67.74 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  67.74 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  66.4 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  66.4 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  67.74 
 
 		 140 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  66.4 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  66.94 
 
 		 140 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  67.74 
 
 		 138 aa  178  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  62.5 
 
 		 141 aa  176  7e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  66.94 
 
 		 138 aa  176  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  61.76 
 
 		 139 aa  175  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  61.76 
 
 		 139 aa  175  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2509  50S ribosomal protein L17  63.71 
 
 		 139 aa  173  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.745035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  64.52 
 
 		 141 aa  172  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  65.32 
 
 		 140 aa  172  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  63.71 
 
 		 140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1325  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 140 aa  166  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.355864 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  62.79 
 
 		 146 aa  166  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04495  50S ribosomal protein L17  63.93 
 
 		 127 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  56.39 
 
 		 139 aa  160  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4250  50S ribosomal protein L17  65 
 
 		 125 aa  160  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00366931  unclonable  0.00000000000172 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0781  50S ribosomal protein L17  61.48 
 
 		 127 aa  159  9e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478066  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  58.09 
 
 		 130 aa  159  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  58.09 
 
 		 130 aa  159  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  60.83 
 
 		 126 aa  158  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0346  50S ribosomal protein L17  58.91 
 
 		 133 aa  158  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.000393302 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  61.16 
 
 		 130 aa  157  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  62.71 
 
 		 128 aa  157  6e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  61.86 
 
 		 126 aa  157  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  60.66 
 
 		 127 aa  156  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  60.66 
 
 		 127 aa  156  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  60.66 
 
 		 127 aa  156  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  61.34 
 
 		 128 aa  156  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  60.66 
 
 		 127 aa  156  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  61.34 
 
 		 127 aa  155  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  60.66 
 
 		 127 aa  156  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 		 130 aa  156  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  60.66 
 
 		 127 aa  156  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 		 129 aa  155  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 		 131 aa  155  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  60.66 
 
 		 127 aa  156  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  57.36 
 
 		 141 aa  155  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  60.66 
 
 		 127 aa  156  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 		 129 aa  155  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  61.34 
 
 		 127 aa  155  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  61.34 
 
 		 127 aa  155  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  61.34 
 
 		 127 aa  155  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  61.34 
 
 		 127 aa  155  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  60.66 
 
 		 127 aa  156  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0431  50S ribosomal protein L17P  57.14 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 		 132 aa  154  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 		 133 aa  154  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0077  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 		 131 aa  154  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148079 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 		 128 aa  154  5.0000000000000005e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 		 129 aa  153  8e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 		 129 aa  153  8e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  59.35 
 
 		 126 aa  153  9e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  59.02 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  59.32 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  59.02 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  60.17 
 
 		 134 aa  152  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  60.83 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3777  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 		 131 aa  151  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1951  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 		 131 aa  151  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2604  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 		 131 aa  151  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3617  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201184  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3142  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 		 131 aa  151  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  55.88 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3719  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 		 131 aa  151  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3041  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 		 131 aa  151  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490666  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0502  50S ribosomal protein L17  59.32 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0341  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0245552 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1015  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 		 133 aa  152  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000218208  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  59.32 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0276  50S ribosomal protein L17  60.66 
 
 		 131 aa  151  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0461081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>