More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2991 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 141 aa  281  3.0000000000000004e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  85.19 
 
 		 146 aa  234  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  76.74 
 
 		 139 aa  202  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  71.01 
 
 		 140 aa  197  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  67.14 
 
 		 140 aa  194  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  69.12 
 
 		 138 aa  192  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  67.86 
 
 		 140 aa  191  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  72.87 
 
 		 137 aa  190  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  70.97 
 
 		 140 aa  187  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  71.32 
 
 		 142 aa  186  7e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  70.97 
 
 		 140 aa  186  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  70.97 
 
 		 141 aa  186  9e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  70.97 
 
 		 143 aa  184  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  70.97 
 
 		 141 aa  184  3e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  66.91 
 
 		 138 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  67.91 
 
 		 137 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  65.44 
 
 		 138 aa  180  7e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1325  50S ribosomal protein L17  68.22 
 
 		 140 aa  180  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.355864 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  69.35 
 
 		 141 aa  179  8.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  68.22 
 
 		 141 aa  178  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  65.93 
 
 		 136 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  63.24 
 
 		 138 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  67.44 
 
 		 139 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  62.5 
 
 		 138 aa  176  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  64.71 
 
 		 138 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  67.2 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  67.2 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  67.2 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  65.89 
 
 		 139 aa  173  8e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  63.57 
 
 		 138 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2190  50S ribosomal protein L17  64.34 
 
 		 136 aa  170  6.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.407841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  62.96 
 
 		 135 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  67.74 
 
 		 140 aa  169  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  62.59 
 
 		 138 aa  169  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  64.52 
 
 		 141 aa  168  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  62.14 
 
 		 140 aa  168  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  66.94 
 
 		 140 aa  167  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  60.29 
 
 		 138 aa  167  7e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  61.87 
 
 		 139 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  61.87 
 
 		 139 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2509  50S ribosomal protein L17  64.52 
 
 		 139 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.745035  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  59.26 
 
 		 175 aa  163  9e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  62.5 
 
 		 178 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  62.39 
 
 		 124 aa  151  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  61.54 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  58.2 
 
 		 184 aa  150  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  58.54 
 
 		 127 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  52.86 
 
 		 151 aa  149  8.999999999999999e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  58.73 
 
 		 126 aa  148  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0363  50S ribosomal protein L17  58.73 
 
 		 126 aa  148  3e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  59.35 
 
 		 126 aa  147  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  59.52 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 		 129 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0077  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148079 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  59.5 
 
 		 130 aa  144  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  59.5 
 
 		 130 aa  144  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  53.19 
 
 		 155 aa  144  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 		 132 aa  143  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  57.14 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  53.62 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2143  ribosomal protein L17  56.25 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  0.318394 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04495  50S ribosomal protein L17  60.16 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  59.5 
 
 		 130 aa  141  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  58.47 
 
 		 128 aa  141  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  56.67 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 		 129 aa  141  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 		 129 aa  141  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 		 129 aa  141  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  56.67 
 
 		 137 aa  141  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  56.62 
 
 		 127 aa  141  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  56.62 
 
 		 127 aa  141  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  56.62 
 
 		 127 aa  141  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  59.66 
 
 		 128 aa  140  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  56.62 
 
 		 127 aa  141  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  56.62 
 
 		 127 aa  141  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  56.62 
 
 		 127 aa  141  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 		 130 aa  140  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  56.62 
 
 		 127 aa  141  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  56.62 
 
 		 127 aa  141  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  56.62 
 
 		 127 aa  141  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  55.88 
 
 		 127 aa  140  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  55.88 
 
 		 127 aa  140  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  55.88 
 
 		 127 aa  140  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  55.88 
 
 		 127 aa  140  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  55.88 
 
 		 127 aa  140  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 		 129 aa  140  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2346  ribosomal protein L17  58.47 
 
 		 119 aa  140  7e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  59.32 
 
 		 128 aa  140  9e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4250  50S ribosomal protein L17  59.5 
 
 		 125 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00366931  unclonable  0.00000000000172 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0781  50S ribosomal protein L17  57.26 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478066  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  54.41 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3498  ribosomal protein L17  54.76 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110108  hitchhiker  0.0000306031 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2615  ribosomal protein L17  54.76 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.718134  normal  0.325344 
 
 
-
 
NC_002978  WD0657  50S ribosomal protein L17  51.97 
 
 		 142 aa  137  3.9999999999999997e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0531891  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3883  50S ribosomal protein L17  58.33 
 
 		 128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0431  50S ribosomal protein L17P  58.47 
 
 		 129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0588  50S ribosomal protein L17  53.17 
 
 		 132 aa  137  4.999999999999999e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.348029  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0451  50S ribosomal protein L17  57.98 
 
 		 119 aa  137  7e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.701542  normal  0.045023 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0341  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 		 130 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0245552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>