More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1933 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  100 
 
 
140 aa  289  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  92.75 
 
 
138 aa  268  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  83.09 
 
 
138 aa  243  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  82.35 
 
 
138 aa  243  8e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  86.15 
 
 
138 aa  240  5e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2190  50S ribosomal protein L17  82.71 
 
 
136 aa  232  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.407841  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  79.29 
 
 
140 aa  230  4.0000000000000004e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  78.57 
 
 
142 aa  222  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  75 
 
 
138 aa  215  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  74.29 
 
 
138 aa  214  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  76.34 
 
 
137 aa  210  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  71.22 
 
 
139 aa  210  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  72.86 
 
 
139 aa  208  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  72.14 
 
 
136 aa  207  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  76.61 
 
 
141 aa  207  4e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  71.32 
 
 
138 aa  205  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  75.81 
 
 
140 aa  204  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  73.68 
 
 
140 aa  203  8e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  73.6 
 
 
141 aa  201  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  70.37 
 
 
137 aa  202  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  75 
 
 
140 aa  199  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  74.19 
 
 
143 aa  199  8e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  74.19 
 
 
140 aa  199  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  69.63 
 
 
135 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  72 
 
 
142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  72 
 
 
142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  72 
 
 
142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  71.77 
 
 
141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  67.14 
 
 
141 aa  194  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  70.68 
 
 
138 aa  194  5.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  65.94 
 
 
139 aa  190  7e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  65.94 
 
 
139 aa  190  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  71.77 
 
 
138 aa  189  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  71.77 
 
 
140 aa  188  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  69.35 
 
 
141 aa  187  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2509  50S ribosomal protein L17  69.35 
 
 
139 aa  186  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.745035  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  66.67 
 
 
146 aa  184  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  67.74 
 
 
140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1325  50S ribosomal protein L17  62.14 
 
 
140 aa  176  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.355864 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  63.57 
 
 
139 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  60.9 
 
 
141 aa  164  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  59.48 
 
 
151 aa  155  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04495  50S ribosomal protein L17  64.75 
 
 
127 aa  154  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  58.68 
 
 
178 aa  151  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  61.86 
 
 
128 aa  151  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  63.56 
 
 
129 aa  152  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3617  50S ribosomal protein L17  63.56 
 
 
130 aa  151  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201184  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0341  50S ribosomal protein L17  63.56 
 
 
130 aa  151  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0245552 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0077  50S ribosomal protein L17  63.56 
 
 
131 aa  150  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000148079 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0346  50S ribosomal protein L17  59.69 
 
 
133 aa  150  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.000393302 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0781  50S ribosomal protein L17  60.66 
 
 
127 aa  149  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478066  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0431  50S ribosomal protein L17P  58.33 
 
 
129 aa  149  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  59.17 
 
 
126 aa  149  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  53.73 
 
 
155 aa  149  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  60.83 
 
 
132 aa  149  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  59.83 
 
 
168 aa  148  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  61.86 
 
 
134 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4250  50S ribosomal protein L17  62.5 
 
 
125 aa  148  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00366931  unclonable  0.00000000000172 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  54.89 
 
 
175 aa  148  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  60 
 
 
137 aa  147  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  61.02 
 
 
131 aa  147  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  59.5 
 
 
130 aa  147  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  59.5 
 
 
130 aa  147  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1951  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 
131 aa  147  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0276  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 
131 aa  147  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0461081 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3719  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 
131 aa  147  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3505  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 
131 aa  147  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2604  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 
131 aa  147  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3749  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 
131 aa  147  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648028  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3041  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 
131 aa  147  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490666  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3142  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 
131 aa  147  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  62.71 
 
 
131 aa  147  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3777  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 
131 aa  147  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2812  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 
131 aa  147  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0476754  normal  0.443503 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  58.54 
 
 
126 aa  147  7e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  62.71 
 
 
132 aa  146  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0354  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 
131 aa  146  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.341272 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3474  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 
131 aa  146  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0303  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 
131 aa  146  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2732  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 
131 aa  146  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  55.71 
 
 
130 aa  146  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0294  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 
131 aa  146  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0375  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 
131 aa  146  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  55.74 
 
 
184 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 
131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  61.02 
 
 
126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  54.76 
 
 
126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0363  50S ribosomal protein L17  54.76 
 
 
126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0420  50S ribosomal protein L17  56.56 
 
 
127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 
129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  59.5 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 
129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 
129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  59.02 
 
 
127 aa  144  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 
132 aa  144  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  58.12 
 
 
124 aa  144  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  56.72 
 
 
127 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  56.72 
 
 
127 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  59.32 
 
 
133 aa  145  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  59.02 
 
 
127 aa  144  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>