More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0654 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  100 
 
 
178 aa  362  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  78.02 
 
 
175 aa  268  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  69.73 
 
 
184 aa  232  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  90.6 
 
 
168 aa  223  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  85.59 
 
 
124 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  75.59 
 
 
127 aa  199  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  69.7 
 
 
155 aa  190  8e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  87.13 
 
 
144 aa  186  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  56.38 
 
 
151 aa  167  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  63.41 
 
 
141 aa  166  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  63.49 
 
 
141 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  60.47 
 
 
137 aa  164  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  59.69 
 
 
141 aa  163  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  63.41 
 
 
141 aa  162  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  62.4 
 
 
142 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  62.4 
 
 
142 aa  161  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  62.4 
 
 
142 aa  161  5.0000000000000005e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  59.69 
 
 
146 aa  159  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  64.1 
 
 
143 aa  159  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  64.66 
 
 
208 aa  159  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  56.39 
 
 
138 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  55.64 
 
 
142 aa  159  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  62.6 
 
 
140 aa  158  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  64.1 
 
 
140 aa  158  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  54.29 
 
 
140 aa  157  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  68.81 
 
 
112 aa  155  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  53.1 
 
 
140 aa  153  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  61.54 
 
 
140 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  60.16 
 
 
138 aa  151  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  56.49 
 
 
138 aa  151  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  59.35 
 
 
141 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  66.06 
 
 
112 aa  150  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  54.26 
 
 
139 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  56.49 
 
 
138 aa  149  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  59.83 
 
 
128 aa  149  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  62.16 
 
 
112 aa  149  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  55.73 
 
 
136 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  64.41 
 
 
126 aa  149  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  55.64 
 
 
138 aa  147  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  54.2 
 
 
137 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  61.82 
 
 
113 aa  144  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  60.18 
 
 
229 aa  144  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  53.49 
 
 
139 aa  144  9e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  58.97 
 
 
140 aa  144  9e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  51.94 
 
 
138 aa  143  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  61.47 
 
 
112 aa  143  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  55.28 
 
 
139 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  54.2 
 
 
138 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  55.28 
 
 
139 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  60.68 
 
 
120 aa  143  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  54.47 
 
 
140 aa  143  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  51.94 
 
 
138 aa  142  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2509  50S ribosomal protein L17  54.47 
 
 
139 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.745035  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  61.26 
 
 
172 aa  142  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  52.67 
 
 
139 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  56.91 
 
 
135 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  55.56 
 
 
137 aa  142  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1961  50S ribosomal protein L17  60.68 
 
 
158 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  56.1 
 
 
140 aa  142  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  61.26 
 
 
112 aa  142  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1939  50S ribosomal protein L17  59.83 
 
 
168 aa  141  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1918  50S ribosomal protein L17  59.83 
 
 
162 aa  141  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2046  50S ribosomal protein L17  59.83 
 
 
164 aa  141  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0786511  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  58.97 
 
 
120 aa  141  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  47.09 
 
 
179 aa  140  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  50.39 
 
 
138 aa  140  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2190  50S ribosomal protein L17  50.38 
 
 
136 aa  140  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.407841  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  54.47 
 
 
268 aa  139  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  55.56 
 
 
126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0431  50S ribosomal protein L17P  51.52 
 
 
129 aa  139  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  57.14 
 
 
120 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  57.14 
 
 
120 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  57.14 
 
 
120 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  57.14 
 
 
120 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  57.14 
 
 
120 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  57.14 
 
 
120 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  57.14 
 
 
120 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  57.14 
 
 
120 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  57.14 
 
 
120 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  57.14 
 
 
120 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  57.14 
 
 
120 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 
129 aa  138  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  56.9 
 
 
131 aa  136  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  56.9 
 
 
132 aa  136  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2682  ribosomal protein L17  59.17 
 
 
121 aa  137  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0293066  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  51.88 
 
 
141 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0525  50S ribosomal protein L17  54.62 
 
 
124 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000217625 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  55.56 
 
 
131 aa  137  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0355  50S ribosomal protein L17  54.62 
 
 
124 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  58.72 
 
 
113 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  58.72 
 
 
113 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0451  50S ribosomal protein L17  58.12 
 
 
119 aa  136  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.701542  normal  0.045023 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  61.26 
 
 
114 aa  137  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  56.9 
 
 
131 aa  136  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  56.9 
 
 
132 aa  137  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  51.97 
 
 
130 aa  136  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0077  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 
131 aa  136  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000148079 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  51.97 
 
 
130 aa  136  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  56.9 
 
 
131 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  56.9 
 
 
131 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>