More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0707 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 127 aa  254  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  77.95 
 
 		 175 aa  207  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  80.8 
 
 		 124 aa  199  8e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  77.69 
 
 		 178 aa  197  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  72.22 
 
 		 184 aa  190  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  77.78 
 
 		 168 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  69.29 
 
 		 155 aa  183  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  77.23 
 
 		 144 aa  163  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  60.66 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  64.66 
 
 		 208 aa  153  9e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  58.4 
 
 		 141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  58.4 
 
 		 146 aa  150  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  58.54 
 
 		 141 aa  150  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  58.82 
 
 		 140 aa  149  8.999999999999999e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  62.39 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  60.8 
 
 		 126 aa  147  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  56.35 
 
 		 141 aa  146  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  56 
 
 		 143 aa  146  9e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  59.83 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  55.2 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  60.5 
 
 		 120 aa  144  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  56.8 
 
 		 140 aa  144  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  62.39 
 
 		 112 aa  145  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  64.22 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  61.47 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  56 
 
 		 140 aa  144  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  62.5 
 
 		 113 aa  143  8.000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  53.6 
 
 		 139 aa  143  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  58.82 
 
 		 120 aa  142  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  58.97 
 
 		 120 aa  141  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  58.97 
 
 		 120 aa  141  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  58.97 
 
 		 120 aa  141  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  58.97 
 
 		 120 aa  141  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  53.23 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  58.97 
 
 		 120 aa  141  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  58.97 
 
 		 120 aa  141  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  58.97 
 
 		 120 aa  141  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  58.97 
 
 		 120 aa  141  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  58.97 
 
 		 120 aa  141  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  54.4 
 
 		 141 aa  141  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  58.97 
 
 		 120 aa  141  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  58.97 
 
 		 120 aa  141  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2682  ribosomal protein L17  58.47 
 
 		 121 aa  140  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0293066  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  53.23 
 
 		 137 aa  140  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  60.55 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  55.46 
 
 		 138 aa  140  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  54.4 
 
 		 138 aa  140  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0451  50S ribosomal protein L17  57.14 
 
 		 119 aa  140  7e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.701542  normal  0.045023 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  59.48 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  55.46 
 
 		 140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  59.48 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  52.8 
 
 		 138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  59.48 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  57.26 
 
 		 137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  54.4 
 
 		 140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  54.47 
 
 		 142 aa  138  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  56.69 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  56.69 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  58.62 
 
 		 131 aa  137  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  53.6 
 
 		 139 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  54.47 
 
 		 142 aa  137  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0363  50S ribosomal protein L17  55.46 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  54.47 
 
 		 142 aa  137  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  53.6 
 
 		 139 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0225  50S ribosomal protein L17  59.48 
 
 		 131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000697417  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0220  50S ribosomal protein L17  59.48 
 
 		 131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  55.46 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  59.48 
 
 		 131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  56.69 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  56.69 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  56.69 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  56.69 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  51.61 
 
 		 140 aa  137  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2509  50S ribosomal protein L17  52.8 
 
 		 139 aa  137  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.745035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  53.23 
 
 		 268 aa  136  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0515  50S ribosomal protein L17  54.62 
 
 		 119 aa  135  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336065 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  57.76 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0510  50S ribosomal protein L17  54.62 
 
 		 119 aa  135  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.698201  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  60.55 
 
 		 113 aa  135  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  60.55 
 
 		 113 aa  135  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2046  50S ribosomal protein L17  57.26 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0786511  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1918  50S ribosomal protein L17  57.26 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  52.8 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  59.63 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  54.92 
 
 		 190 aa  134  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0174  50S ribosomal protein L17  57.76 
 
 		 131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000106796  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 130 aa  134  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4250  50S ribosomal protein L17  57.26 
 
 		 125 aa  134  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00366931  unclonable  0.00000000000172 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0085  50S ribosomal protein L17  54.4 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0996581  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 130 aa  134  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  57.66 
 
 		 172 aa  134  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  52.8 
 
 		 139 aa  134  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 129 aa  134  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 129 aa  134  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0196  50S ribosomal protein L17  57.76 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00364658  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04495  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 129 aa  134  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  53.85 
 
 		 134 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1880  50S ribosomal protein L17  55.2 
 
 		 128 aa  134  6.0000000000000005e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 129 aa  133  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>