More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0729 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 155 aa  312  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  65.16 
 
 		 175 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  73.95 
 
 		 178 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  74.36 
 
 		 168 aa  184  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  69.29 
 
 		 127 aa  183  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  70.83 
 
 		 184 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  72.03 
 
 		 124 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  52.29 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  74 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  54.41 
 
 		 138 aa  154  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  58.14 
 
 		 143 aa  153  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  58.82 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  52.82 
 
 		 140 aa  150  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  62.93 
 
 		 208 aa  150  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  57.58 
 
 		 141 aa  150  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  58.82 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  55.28 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  66.06 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  54.47 
 
 		 140 aa  147  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  56.06 
 
 		 140 aa  146  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  57.14 
 
 		 142 aa  145  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  55.3 
 
 		 140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  66.06 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  55.46 
 
 		 142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  57.14 
 
 		 142 aa  145  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  57.14 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  53.19 
 
 		 141 aa  144  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  57.26 
 
 		 137 aa  144  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  58.97 
 
 		 128 aa  144  6e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  59.84 
 
 		 126 aa  143  9e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 141 aa  142  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 		 140 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  62.39 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  52.9 
 
 		 138 aa  142  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  53.78 
 
 		 139 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  57.14 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  60.34 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 229 aa  140  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  60.34 
 
 		 132 aa  140  9e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  60.34 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2230  50S ribosomal protein L17  59.48 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025919  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  60.34 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 138 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  60.34 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  49.29 
 
 		 139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  50.7 
 
 		 138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  49.29 
 
 		 139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 138 aa  138  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  54.7 
 
 		 134 aa  138  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  46.88 
 
 		 172 aa  138  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  60.34 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  60.34 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  60.34 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0225  50S ribosomal protein L17  60.34 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000697417  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0220  50S ribosomal protein L17  60.34 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  60.34 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  60.34 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  59.48 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  52.94 
 
 		 140 aa  137  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  61.61 
 
 		 113 aa  137  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3719  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3505  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  60.55 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2604  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3749  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648028  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3041  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490666  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3142  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1951  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2127  50S ribosomal protein L17P  58.62 
 
 		 121 aa  137  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0812324  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  54.55 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3777  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  59.63 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0276  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 131 aa  137  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0461081 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  54.62 
 
 		 135 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3617  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 130 aa  137  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201184  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0341  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 130 aa  137  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0245552 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0354  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 131 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341272 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3474  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 131 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0303  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 131 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2732  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 131 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0294  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 131 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0375  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 131 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3922  ribosomal protein L17  51.52 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  51.94 
 
 		 140 aa  135  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  52.11 
 
 		 140 aa  136  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  56.76 
 
 		 179 aa  135  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2812  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0476754  normal  0.443503 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  52.76 
 
 		 268 aa  135  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  54.62 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  51.22 
 
 		 197 aa  135  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  59.66 
 
 		 120 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0196  50S ribosomal protein L17  58.62 
 
 		 131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00364658  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2143  ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 131 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  0.318394 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1015  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 133 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000218208  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0174  50S ribosomal protein L17  58.62 
 
 		 131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000106796  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01460  ribosomal protein L17  53.78 
 
 		 247 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.186143  normal  0.514697 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  53.78 
 
 		 138 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0451  50S ribosomal protein L17  55.46 
 
 		 119 aa  134  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.701542  normal  0.045023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>