More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4144 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  100 
 
 
131 aa  266  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  100 
 
 
131 aa  266  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  100 
 
 
131 aa  266  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  100 
 
 
131 aa  266  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  99.24 
 
 
131 aa  264  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  99.24 
 
 
131 aa  264  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0225  50S ribosomal protein L17  98.47 
 
 
131 aa  263  8e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000697417  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0220  50S ribosomal protein L17  98.47 
 
 
131 aa  263  8e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  98.47 
 
 
131 aa  263  8e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  92.97 
 
 
132 aa  247  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  94.44 
 
 
130 aa  247  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  92.19 
 
 
132 aa  246  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  96.64 
 
 
130 aa  238  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0196  50S ribosomal protein L17  96.64 
 
 
131 aa  236  5e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00364658  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  95.8 
 
 
131 aa  235  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0174  50S ribosomal protein L17  95.8 
 
 
131 aa  235  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000106796  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  86.29 
 
 
127 aa  222  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  86.29 
 
 
127 aa  222  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  86.29 
 
 
127 aa  222  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  86.29 
 
 
127 aa  222  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  86.29 
 
 
127 aa  222  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  86.29 
 
 
127 aa  222  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  86.29 
 
 
127 aa  222  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  86.29 
 
 
127 aa  222  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  86.29 
 
 
127 aa  222  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  85.48 
 
 
127 aa  220  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  85.48 
 
 
127 aa  220  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  83.21 
 
 
130 aa  221  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  85.48 
 
 
127 aa  220  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  85.48 
 
 
127 aa  220  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  85.48 
 
 
127 aa  220  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  84.92 
 
 
126 aa  220  6e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0627  50S ribosomal protein L17  81.95 
 
 
134 aa  220  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  83.21 
 
 
130 aa  220  6e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  83.21 
 
 
129 aa  219  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  83.21 
 
 
129 aa  219  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  84.8 
 
 
129 aa  219  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  83.21 
 
 
129 aa  219  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  86.78 
 
 
128 aa  219  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  85.71 
 
 
133 aa  218  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  81.68 
 
 
130 aa  217  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  81.68 
 
 
130 aa  217  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1015  50S ribosomal protein L17  85.71 
 
 
133 aa  215  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000218208  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  82.54 
 
 
126 aa  214  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  86.55 
 
 
128 aa  214  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0085  50S ribosomal protein L17  78.91 
 
 
128 aa  209  7e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000013942  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4250  50S ribosomal protein L17  78.23 
 
 
125 aa  204  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00366931  unclonable  0.00000000000172 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3498  ribosomal protein L17  78.86 
 
 
126 aa  204  4e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110108  hitchhiker  0.0000306031 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2615  ribosomal protein L17  78.86 
 
 
126 aa  204  4e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.718134  normal  0.325344 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  74.05 
 
 
132 aa  202  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0447  50S ribosomal protein L17  76.19 
 
 
127 aa  201  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  77.5 
 
 
128 aa  199  8e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  78.99 
 
 
137 aa  198  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0781  50S ribosomal protein L17  74.4 
 
 
127 aa  197  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478066  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  77.31 
 
 
132 aa  196  7.999999999999999e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  71.76 
 
 
131 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04495  50S ribosomal protein L17  73.6 
 
 
127 aa  193  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  70.77 
 
 
132 aa  191  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4523  50S ribosomal protein L17  73.28 
 
 
128 aa  191  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0863  50S ribosomal protein L17  72.52 
 
 
129 aa  190  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09130  50S ribosomal protein L17  72.52 
 
 
129 aa  190  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  70.45 
 
 
134 aa  190  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0652  ribosomal protein L17  72.52 
 
 
128 aa  189  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5054  50S ribosomal protein L17  71.88 
 
 
128 aa  189  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088451  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06510  50S ribosomal protein L17  72.52 
 
 
130 aa  189  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0480  50S ribosomal protein L17  72.52 
 
 
128 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000266808 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0509  50S ribosomal protein L17  72.52 
 
 
128 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0085747  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0513  50S ribosomal protein L17  72.52 
 
 
128 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0326997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4723  50S ribosomal protein L17  72.52 
 
 
128 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51527  normal  0.268012 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3883  50S ribosomal protein L17  71.76 
 
 
128 aa  187  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756472  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2143  ribosomal protein L17  71.76 
 
 
131 aa  187  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  0.318394 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0354  ribosomal protein L17  68.75 
 
 
128 aa  185  2e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.194755  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  74.17 
 
 
131 aa  184  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  74.17 
 
 
131 aa  184  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0346  50S ribosomal protein L17  66.15 
 
 
132 aa  184  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.962629  unclonable  0.0000000436647 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0431  50S ribosomal protein L17P  68.99 
 
 
129 aa  181  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  73.11 
 
 
132 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  71.67 
 
 
132 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2346  ribosomal protein L17  71.19 
 
 
119 aa  180  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  73.11 
 
 
126 aa  180  6e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  68.25 
 
 
126 aa  180  6e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0363  50S ribosomal protein L17  68.25 
 
 
126 aa  180  6e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  72.27 
 
 
132 aa  179  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0519  50S ribosomal protein L17  67.2 
 
 
126 aa  179  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0710013  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0832  ribosomal protein L17  68.55 
 
 
138 aa  179  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0515  50S ribosomal protein L17  72.03 
 
 
119 aa  178  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336065 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0510  50S ribosomal protein L17  72.03 
 
 
119 aa  178  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.698201  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0451  50S ribosomal protein L17  72.03 
 
 
119 aa  177  4e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.701542  normal  0.045023 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0458  50S ribosomal protein L17  66.4 
 
 
126 aa  177  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00945035  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  67.72 
 
 
129 aa  177  5.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  66.67 
 
 
131 aa  176  8e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00755  ribosomal protein L17  80.37 
 
 
107 aa  176  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  65.89 
 
 
129 aa  176  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  65.89 
 
 
129 aa  176  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0346  50S ribosomal protein L17  64.62 
 
 
133 aa  175  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.000393302 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0348  ribosomal protein L17  65.87 
 
 
126 aa  175  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3416  50S ribosomal protein L17P  72.03 
 
 
131 aa  174  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3142  50S ribosomal protein L17  64.12 
 
 
131 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3041  50S ribosomal protein L17  64.12 
 
 
131 aa  174  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490666  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3505  50S ribosomal protein L17  64.12 
 
 
131 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>