More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_01460 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_01460  ribosomal protein L17  100 
 
 		 247 aa  476  1e-133  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.186143  normal  0.514697 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19700  ribosomal protein L17  82.52 
 
 		 169 aa  232  3e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00763987  normal  0.431624 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2803  ribosomal protein L17  86.29 
 
 		 195 aa  228  8e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000866699  hitchhiker  0.000000348253 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1132  ribosomal protein L17  72.8 
 
 		 161 aa  191  1e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.087473  normal  0.167887 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  50.36 
 
 		 155 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 141 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  40.57 
 
 		 202 aa  128  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  43.53 
 
 		 175 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  47.58 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2625  ribosomal protein L17  48.41 
 
 		 168 aa  126  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  41.57 
 
 		 172 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  48 
 
 		 197 aa  125  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  45.95 
 
 		 203 aa  125  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  51.69 
 
 		 126 aa  123  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2127  50S ribosomal protein L17P  53.72 
 
 		 121 aa  122  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0812324  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  41.99 
 
 		 190 aa  122  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 140 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 140 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  48.46 
 
 		 143 aa  122  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0655  ribosomal protein L17  48.33 
 
 		 178 aa  121  8e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.929452  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0278  ribosomal protein L17  45.9 
 
 		 144 aa  121  9.999999999999999e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 190 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 141 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 169 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  49.61 
 
 		 142 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6582  ribosomal protein L17  38.25 
 
 		 196 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  49.23 
 
 		 142 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  49.23 
 
 		 142 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0106  50S ribosomal protein L17  46.88 
 
 		 133 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.188563 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0716  ribosomal protein L17  44.8 
 
 		 202 aa  119  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  48.25 
 
 		 195 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  48.25 
 
 		 195 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  49.21 
 
 		 141 aa  118  7.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  48.25 
 
 		 195 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  44.9 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  46.28 
 
 		 178 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  45.38 
 
 		 170 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  44.36 
 
 		 184 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  46.77 
 
 		 127 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0614  ribosomal protein L17  43.48 
 
 		 181 aa  115  5e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  45.54 
 
 		 179 aa  115  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  44.2 
 
 		 176 aa  115  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  48.25 
 
 		 180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  44.09 
 
 		 176 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  48.25 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  49.09 
 
 		 112 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23520  LSU ribosomal protein L17P  47.11 
 
 		 164 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  45.9 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1734  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 183 aa  112  5e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  43.61 
 
 		 151 aa  112  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  43.85 
 
 		 140 aa  112  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16890  LSU ribosomal protein L17P  37.86 
 
 		 242 aa  112  8.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2268  50S ribosomal protein L17  43.53 
 
 		 166 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312187 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  50 
 
 		 113 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2939  50S ribosomal protein L17  47.83 
 
 		 196 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75004  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04280  LSU ribosomal protein L17P  39.62 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0687  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 170 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2036  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 152 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000459546  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 140 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 138 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 135 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 139 aa  109  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4969  50S ribosomal protein L17  48.25 
 
 		 199 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.392078  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  45.76 
 
 		 117 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0611  50S ribosomal protein L17  40.4 
 
 		 206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.595155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  45.83 
 
 		 128 aa  109  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  46.77 
 
 		 141 aa  109  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  45.9 
 
 		 137 aa  108  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  45.3 
 
 		 138 aa  108  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3381  ribosomal protein L17  43.65 
 
 		 233 aa  108  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 136 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  44.44 
 
 		 168 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2654  50S ribosomal protein L17  48.76 
 
 		 190 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2230  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 162 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025919  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1839  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 116 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.501315  normal  0.68282 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  43.55 
 
 		 137 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  45.45 
 
 		 112 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  48.18 
 
 		 112 aa  105  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1738  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 133 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0832  ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 138 aa  105  7e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  48.18 
 
 		 112 aa  105  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  45.38 
 
 		 124 aa  105  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  44.78 
 
 		 138 aa  105  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  42.02 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2682  ribosomal protein L17  47.9 
 
 		 121 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0293066  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 138 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29450  LSU ribosomal protein L17P  40.6 
 
 		 180 aa  104  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0149004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1015  50S ribosomal protein L17  43.33 
 
 		 133 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000218208  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 117 aa  105  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 139 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  45.3 
 
 		 138 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  42.54 
 
 		 139 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  45 
 
 		 133 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  42.54 
 
 		 139 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  43.9 
 
 		 130 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  49.09 
 
 		 112 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  44.88 
 
 		 126 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  43.9 
 
 		 130 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>