More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0614 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0614  ribosomal protein L17  100 
 
 		 181 aa  358  2e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29450  LSU ribosomal protein L17P  78.57 
 
 		 180 aa  231  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0149004  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2625  ribosomal protein L17  68.93 
 
 		 168 aa  220  8e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0655  ribosomal protein L17  74.26 
 
 		 178 aa  207  6e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.929452  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0278  ribosomal protein L17  66.67 
 
 		 144 aa  203  1e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  57.21 
 
 		 197 aa  200  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16890  LSU ribosomal protein L17P  63.74 
 
 		 242 aa  197  5e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0716  ribosomal protein L17  58.64 
 
 		 202 aa  194  5.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  65.1 
 
 		 229 aa  189  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  70.15 
 
 		 190 aa  189  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  64.83 
 
 		 268 aa  187  8e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6582  ribosomal protein L17  56.91 
 
 		 196 aa  185  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2939  50S ribosomal protein L17  68.63 
 
 		 196 aa  184  8e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75004  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  66.92 
 
 		 176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  68.18 
 
 		 169 aa  182  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  66.15 
 
 		 202 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  58.52 
 
 		 172 aa  180  8.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04280  LSU ribosomal protein L17P  58.02 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23520  LSU ribosomal protein L17P  66.19 
 
 		 164 aa  179  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1734  50S ribosomal protein L17  66.41 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2654  50S ribosomal protein L17  69.78 
 
 		 190 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  63.08 
 
 		 219 aa  171  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  60.67 
 
 		 222 aa  171  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  51.93 
 
 		 190 aa  170  7.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  58.67 
 
 		 176 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  54.49 
 
 		 190 aa  166  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  64.84 
 
 		 179 aa  164  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  53.59 
 
 		 195 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  53.59 
 
 		 195 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  53.59 
 
 		 195 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  53.99 
 
 		 203 aa  159  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0611  50S ribosomal protein L17  61.38 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.595155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  59.23 
 
 		 180 aa  155  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  58.46 
 
 		 202 aa  155  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3381  ribosomal protein L17  56.2 
 
 		 233 aa  154  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  52.87 
 
 		 170 aa  154  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6021  50S ribosomal protein L17  57.58 
 
 		 195 aa  143  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79372  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4969  50S ribosomal protein L17  56.15 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.392078  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  45.56 
 
 		 175 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  45.14 
 
 		 178 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  46.67 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  48.91 
 
 		 184 aa  123  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  48.06 
 
 		 127 aa  120  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  50.4 
 
 		 118 aa  119  3e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  52.5 
 
 		 120 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  52.5 
 
 		 120 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  52.5 
 
 		 120 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  52.5 
 
 		 120 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  52.5 
 
 		 120 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  52.5 
 
 		 120 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  52.5 
 
 		 120 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  52.5 
 
 		 120 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  52.5 
 
 		 120 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  52.5 
 
 		 120 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  52.5 
 
 		 120 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  49.22 
 
 		 168 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  48.09 
 
 		 143 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  41.57 
 
 		 151 aa  118  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  45.58 
 
 		 126 aa  118  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  48.03 
 
 		 137 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  44.59 
 
 		 140 aa  114  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  45.26 
 
 		 141 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01460  ribosomal protein L17  43.61 
 
 		 247 aa  114  7.999999999999999e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.186143  normal  0.514697 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  47.97 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  46.26 
 
 		 138 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  45.26 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  45 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  44.37 
 
 		 138 aa  112  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2803  ribosomal protein L17  42.34 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000866699  hitchhiker  0.000000348253 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1506  ribosomal protein L17  49.21 
 
 		 136 aa  112  4.0000000000000004e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952918 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  54.17 
 
 		 117 aa  111  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  44.96 
 
 		 141 aa  111  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2127  50S ribosomal protein L17P  45.45 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0812324  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  51.38 
 
 		 144 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  46.09 
 
 		 142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  46.34 
 
 		 112 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  47.5 
 
 		 120 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  44.7 
 
 		 141 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05855  putative 50S ribosomal protein L17  46.88 
 
 		 156 aa  108  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  45 
 
 		 112 aa  108  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  44.88 
 
 		 142 aa  107  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  44.27 
 
 		 140 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  44.88 
 
 		 142 aa  107  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  44.88 
 
 		 142 aa  107  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  45.32 
 
 		 139 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  45.32 
 
 		 139 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  46.67 
 
 		 120 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  43.51 
 
 		 140 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0222  50S ribosomal protein L17  43.44 
 
 		 127 aa  107  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  42.95 
 
 		 140 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  43.08 
 
 		 140 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  47.5 
 
 		 112 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  45.08 
 
 		 114 aa  106  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  46.72 
 
 		 146 aa  106  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  47.5 
 
 		 113 aa  106  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19700  ribosomal protein L17  41.33 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00763987  normal  0.431624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  46.09 
 
 		 117 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  42.96 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  41.61 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  45.08 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>