More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0687 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0687  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 170 aa  335  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1738  50S ribosomal protein L17  78.15 
 
 		 133 aa  201  6e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0106  50S ribosomal protein L17  68.66 
 
 		 133 aa  191  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.188563 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2230  50S ribosomal protein L17  71.9 
 
 		 162 aa  185  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025919  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2748  ribosomal protein L17  56.45 
 
 		 138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.727707  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2038  ribosomal protein L17  51.52 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0128526  hitchhiker  0.000448232 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  51.09 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0420  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0396  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 139 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  56 
 
 		 132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2878  ribosomal protein L17  58.62 
 
 		 118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  54.96 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  57.76 
 
 		 140 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  56.9 
 
 		 138 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  54.89 
 
 		 134 aa  130  9e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  55.91 
 
 		 127 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  55.91 
 
 		 127 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  55.91 
 
 		 127 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  55.91 
 
 		 127 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  54.2 
 
 		 130 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  55.91 
 
 		 127 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  55.91 
 
 		 127 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  59.09 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  55.91 
 
 		 127 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  55.91 
 
 		 127 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  55.91 
 
 		 127 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  54.2 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  54.2 
 
 		 130 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  56.35 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6582  ribosomal protein L17  49.06 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  56.35 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  56.35 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  57.76 
 
 		 132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  59.09 
 
 		 179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  56.35 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  56.35 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  55.65 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  54.14 
 
 		 203 aa  129  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  58.62 
 
 		 132 aa  129  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  54.84 
 
 		 129 aa  128  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  51.97 
 
 		 128 aa  127  6e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  51.88 
 
 		 132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  51.88 
 
 		 132 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  51.54 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  53.73 
 
 		 138 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  56.03 
 
 		 143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0627  50S ribosomal protein L17P  50.75 
 
 		 134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  51.54 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  54.76 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  56.9 
 
 		 132 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0363  50S ribosomal protein L17  54.76 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2143  ribosomal protein L17  53.17 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  0.318394 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  52.63 
 
 		 222 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  50.77 
 
 		 141 aa  125  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  56.03 
 
 		 131 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  51.54 
 
 		 140 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  50.77 
 
 		 140 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  48.37 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0781  50S ribosomal protein L17  57.76 
 
 		 127 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478066  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  57.76 
 
 		 140 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  56.9 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  55.2 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  55.17 
 
 		 137 aa  124  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4216  ribosomal protein L17  53.38 
 
 		 132 aa  124  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719281  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  56.9 
 
 		 132 aa  124  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  56.03 
 
 		 129 aa  124  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  52.27 
 
 		 131 aa  124  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  52.27 
 
 		 131 aa  124  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  53.6 
 
 		 130 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2127  50S ribosomal protein L17P  54.31 
 
 		 121 aa  124  8.000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0812324  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  56.9 
 
 		 128 aa  124  8.000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  52.27 
 
 		 131 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  52.27 
 
 		 131 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  52.27 
 
 		 131 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  52.27 
 
 		 131 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1048  ribosomal protein L17  56.9 
 
 		 130 aa  124  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 		 141 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0346  50S ribosomal protein L17  54.14 
 
 		 132 aa  123  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.962629  unclonable  0.0000000436647 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  45.73 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 		 131 aa  123  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  56.03 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 		 130 aa  123  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  54.84 
 
 		 131 aa  123  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04495  50S ribosomal protein L17  56.9 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0077  50S ribosomal protein L17  56.03 
 
 		 131 aa  123  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148079 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0627  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 178 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  51.15 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  54.96 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04280  LSU ribosomal protein L17P  50.35 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  56.03 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3749  50S ribosomal protein L17  51.52 
 
 		 131 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648028  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3777  50S ribosomal protein L17  51.52 
 
 		 131 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>