More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2748 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2748  ribosomal protein L17  100 
 
 		 138 aa  280  5.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.727707  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2230  50S ribosomal protein L17  66.12 
 
 		 162 aa  168  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025919  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2038  ribosomal protein L17  58.96 
 
 		 132 aa  167  6e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0128526  hitchhiker  0.000448232 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1738  50S ribosomal protein L17  65.25 
 
 		 133 aa  161  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0106  50S ribosomal protein L17  59.83 
 
 		 133 aa  147  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.188563 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0687  50S ribosomal protein L17  57.02 
 
 		 170 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 		 178 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  52.17 
 
 		 138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 155 aa  127  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  54.7 
 
 		 137 aa  127  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  48.55 
 
 		 175 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05855  putative 50S ribosomal protein L17  48.12 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 140 aa  125  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  49.26 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0348  ribosomal protein L17  52.07 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 141 aa  124  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0420  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 130 aa  123  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0447  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 127 aa  123  8.000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 131 aa  123  9e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0396  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3474  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0303  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2732  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  54.7 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 137 aa  123  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0294  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0354  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341272 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0375  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1951  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3505  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3777  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3719  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2604  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  50.75 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2812  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0476754  normal  0.443503 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3749  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648028  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3041  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490666  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  50.75 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4216  ribosomal protein L17  51.09 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719281  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0363  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 126 aa  121  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0225  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000697417  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0220  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3142  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  56.41 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0276  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0461081 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 126 aa  121  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2346  ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  50.71 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4250  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00366931  unclonable  0.00000000000172 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1015  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 133 aa  121  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000218208  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0515  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 119 aa  121  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336065 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  51.43 
 
 		 139 aa  120  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  51.43 
 
 		 139 aa  120  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0510  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 119 aa  121  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.698201  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 126 aa  120  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0196  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00364658  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0174  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000106796  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 124 aa  120  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 140 aa  120  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  51.18 
 
 		 128 aa  120  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  50.85 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0870  ribosomal protein L17  52.07 
 
 		 226 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1048  ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  51.15 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  50.38 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  48.91 
 
 		 134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  51.15 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0341  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 		 130 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0245552 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  51.15 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0627  50S ribosomal protein L17P  48.51 
 
 		 134 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3617  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 		 130 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201184  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2509  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.745035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  51.15 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  51.15 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  49.62 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  51.64 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  51.64 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  49.62 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>