More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0174 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0174  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 131 aa  266  5.9999999999999995e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000106796  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0196  50S ribosomal protein L17  98.47 
 
 		 131 aa  263  5.999999999999999e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00364658  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  98.41 
 
 		 130 aa  255  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  94.66 
 
 		 131 aa  255  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  94.66 
 
 		 131 aa  255  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  94.66 
 
 		 131 aa  254  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  94.66 
 
 		 131 aa  254  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  94.66 
 
 		 131 aa  254  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  94.66 
 
 		 131 aa  254  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  92.97 
 
 		 132 aa  247  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  92.19 
 
 		 132 aa  245  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0225  50S ribosomal protein L17  95.8 
 
 		 131 aa  236  8e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000697417  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0220  50S ribosomal protein L17  95.8 
 
 		 131 aa  236  8e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  95.8 
 
 		 131 aa  236  8e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  94.96 
 
 		 130 aa  236  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  92.44 
 
 		 131 aa  229  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  87.3 
 
 		 126 aa  226  8e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0627  50S ribosomal protein L17  81.95 
 
 		 134 aa  221  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  85.48 
 
 		 127 aa  218  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  85.48 
 
 		 127 aa  218  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  85.48 
 
 		 127 aa  218  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  85.48 
 
 		 127 aa  218  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  85.48 
 
 		 127 aa  218  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  85.48 
 
 		 127 aa  218  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  85.48 
 
 		 127 aa  218  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  85.48 
 
 		 127 aa  218  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  85.48 
 
 		 127 aa  218  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  84.68 
 
 		 127 aa  216  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  84.68 
 
 		 127 aa  216  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  84.68 
 
 		 127 aa  216  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  84.68 
 
 		 127 aa  216  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  84.68 
 
 		 127 aa  216  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  83.33 
 
 		 126 aa  215  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  81.68 
 
 		 130 aa  215  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  80.92 
 
 		 130 aa  214  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  80.92 
 
 		 130 aa  214  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  82.44 
 
 		 129 aa  215  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  82.44 
 
 		 129 aa  215  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  82.44 
 
 		 129 aa  215  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  81.68 
 
 		 130 aa  214  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  84.13 
 
 		 128 aa  214  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  81.68 
 
 		 129 aa  214  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0085  50S ribosomal protein L17  79.69 
 
 		 128 aa  212  9.999999999999999e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000013942  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  85.71 
 
 		 128 aa  211  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1015  50S ribosomal protein L17  84.03 
 
 		 133 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000218208  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  82.35 
 
 		 133 aa  210  5.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2615  ribosomal protein L17  79.37 
 
 		 126 aa  207  4e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.718134  normal  0.325344 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3498  ribosomal protein L17  79.37 
 
 		 126 aa  207  4e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110108  hitchhiker  0.0000306031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4250  50S ribosomal protein L17  77.78 
 
 		 125 aa  205  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00366931  unclonable  0.00000000000172 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0447  50S ribosomal protein L17  75.4 
 
 		 127 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  73.44 
 
 		 128 aa  197  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0781  50S ribosomal protein L17  73.6 
 
 		 127 aa  196  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478066  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  70.99 
 
 		 132 aa  196  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04495  50S ribosomal protein L17  72.8 
 
 		 127 aa  193  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  76.47 
 
 		 137 aa  194  5.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  72.31 
 
 		 132 aa  192  9e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  70.99 
 
 		 131 aa  191  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  70.45 
 
 		 134 aa  191  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  74.79 
 
 		 132 aa  191  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0652  ribosomal protein L17  71.76 
 
 		 128 aa  189  9e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0863  50S ribosomal protein L17  71.43 
 
 		 129 aa  188  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09130  50S ribosomal protein L17  71.43 
 
 		 129 aa  188  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5054  50S ribosomal protein L17  70.31 
 
 		 128 aa  187  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088451  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06510  50S ribosomal protein L17  70.99 
 
 		 130 aa  187  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4523  50S ribosomal protein L17  70.99 
 
 		 128 aa  187  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0480  50S ribosomal protein L17  70.23 
 
 		 128 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266808 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0513  50S ribosomal protein L17  70.23 
 
 		 128 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0509  50S ribosomal protein L17  70.23 
 
 		 128 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0085747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4723  50S ribosomal protein L17  70.23 
 
 		 128 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51527  normal  0.268012 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2143  ribosomal protein L17  69.47 
 
 		 131 aa  184  4e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  0.318394 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3883  50S ribosomal protein L17  69.47 
 
 		 128 aa  183  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0346  50S ribosomal protein L17  66.15 
 
 		 132 aa  183  9e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.962629  unclonable  0.0000000436647 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  72.5 
 
 		 131 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  72.5 
 
 		 131 aa  180  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0519  50S ribosomal protein L17  67.2 
 
 		 126 aa  180  7e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0710013  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0354  ribosomal protein L17  67.19 
 
 		 128 aa  179  8.000000000000001e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.194755  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2346  ribosomal protein L17  70.34 
 
 		 119 aa  178  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  72.27 
 
 		 132 aa  178  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0458  50S ribosomal protein L17  66.4 
 
 		 126 aa  178  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00945035  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0832  ribosomal protein L17  68.55 
 
 		 138 aa  177  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  70 
 
 		 132 aa  177  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  71.43 
 
 		 132 aa  177  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0431  50S ribosomal protein L17P  66.67 
 
 		 129 aa  176  5.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  70.59 
 
 		 126 aa  177  5.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0363  50S ribosomal protein L17  69.42 
 
 		 126 aa  177  5.999999999999999e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  69.42 
 
 		 126 aa  177  5.999999999999999e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00755  ribosomal protein L17  81.31 
 
 		 107 aa  176  7e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  66.67 
 
 		 129 aa  176  8e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  66.67 
 
 		 129 aa  176  8e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0515  50S ribosomal protein L17  70.34 
 
 		 119 aa  175  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336065 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0510  50S ribosomal protein L17  70.34 
 
 		 119 aa  175  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.698201  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  66.93 
 
 		 129 aa  174  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0451  50S ribosomal protein L17  70.34 
 
 		 119 aa  174  4e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.701542  normal  0.045023 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0346  50S ribosomal protein L17  63.85 
 
 		 133 aa  174  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.000393302 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0348  ribosomal protein L17  65.87 
 
 		 126 aa  174  5e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3142  50S ribosomal protein L17  64.89 
 
 		 131 aa  173  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1951  50S ribosomal protein L17  64.89 
 
 		 131 aa  173  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3041  50S ribosomal protein L17  64.89 
 
 		 131 aa  173  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3777  50S ribosomal protein L17  64.89 
 
 		 131 aa  173  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3505  50S ribosomal protein L17  64.89 
 
 		 131 aa  173  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>