More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1738 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1738  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 133 aa  268  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0106  50S ribosomal protein L17  82.44 
 
 		 133 aa  216  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.188563 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2230  50S ribosomal protein L17  82.2 
 
 		 162 aa  199  9e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025919  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0687  50S ribosomal protein L17  78.15 
 
 		 170 aa  198  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2748  ribosomal protein L17  65.25 
 
 		 138 aa  161  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.727707  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2038  ribosomal protein L17  58.46 
 
 		 132 aa  160  4.0000000000000004e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0128526  hitchhiker  0.000448232 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 		 155 aa  129  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  53.73 
 
 		 139 aa  128  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  49.64 
 
 		 175 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  50.4 
 
 		 124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  54.89 
 
 		 138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2878  ribosomal protein L17  59.48 
 
 		 118 aa  127  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 168 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  55.17 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  53.54 
 
 		 141 aa  124  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 178 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  53.54 
 
 		 141 aa  123  8.000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 184 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  51.18 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  51.18 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  51.18 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  51.15 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  51.18 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  49.62 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  51.18 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  51.18 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  51.18 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  49.62 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  51.18 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  50.78 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  51.18 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  50.78 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  52.38 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  51.18 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  51.18 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  51.18 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  51.18 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  49.62 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  51.18 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  51.15 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  51.15 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  50.38 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  51.15 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2143  ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  0.318394 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  51.16 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  45.27 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  48.12 
 
 		 132 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0420  50S ribosomal protein L17  47.58 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  50.38 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  49.62 
 
 		 140 aa  120  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0396  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  120  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  50.78 
 
 		 128 aa  120  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  46.56 
 
 		 229 aa  120  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0085  50S ribosomal protein L17  53.17 
 
 		 128 aa  120  6e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000013942  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 140 aa  120  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 		 208 aa  120  8e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0431  50S ribosomal protein L17P  48.12 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  51.11 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  47.73 
 
 		 176 aa  119  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  50.38 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  53.64 
 
 		 112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  52.31 
 
 		 141 aa  118  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  49.23 
 
 		 222 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  48.76 
 
 		 179 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  48.46 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  47.66 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  49.57 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0525  50S ribosomal protein L17  52 
 
 		 124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000217625 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  51.54 
 
 		 137 aa  117  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2127  50S ribosomal protein L17P  50.43 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0812324  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0355  50S ribosomal protein L17  52 
 
 		 124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2509  50S ribosomal protein L17  50.77 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.745035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0627  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 134 aa  117  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 142 aa  117  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0515  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336065 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  47.73 
 
 		 132 aa  117  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 128 aa  117  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0510  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.698201  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 142 aa  117  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0225  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 131 aa  117  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000697417  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0220  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 131 aa  117  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 131 aa  117  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>