More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1093 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 184 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  72.04 
 
 		 175 aa  254  5e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  71.35 
 
 		 178 aa  244  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  88.03 
 
 		 168 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  81.36 
 
 		 124 aa  204  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  72.22 
 
 		 127 aa  191  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  84.47 
 
 		 144 aa  185  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  66.42 
 
 		 155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  62.02 
 
 		 141 aa  161  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  52.56 
 
 		 151 aa  160  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  58.73 
 
 		 141 aa  159  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  62.7 
 
 		 141 aa  159  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  59.02 
 
 		 137 aa  154  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  62.07 
 
 		 208 aa  154  9e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  60.47 
 
 		 140 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  59.69 
 
 		 140 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  58.2 
 
 		 141 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  58.14 
 
 		 142 aa  151  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  58.14 
 
 		 142 aa  150  7e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  58.14 
 
 		 142 aa  150  7e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  59.66 
 
 		 143 aa  150  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  59.66 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  56.56 
 
 		 138 aa  148  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  65.14 
 
 		 112 aa  147  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  56.59 
 
 		 138 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  55.74 
 
 		 140 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  61.26 
 
 		 112 aa  146  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  54.1 
 
 		 142 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  57.98 
 
 		 140 aa  145  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  61.67 
 
 		 126 aa  144  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  57.38 
 
 		 138 aa  144  8.000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  52.56 
 
 		 172 aa  144  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  55.04 
 
 		 138 aa  143  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  55.22 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  55.04 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  61.47 
 
 		 112 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  54.26 
 
 		 139 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  54.26 
 
 		 139 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  55 
 
 		 137 aa  142  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  57.38 
 
 		 138 aa  141  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 128 aa  141  5e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  54.1 
 
 		 139 aa  141  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2509  50S ribosomal protein L17  53.49 
 
 		 139 aa  141  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.745035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  53.28 
 
 		 140 aa  140  8e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  56.56 
 
 		 136 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  61.26 
 
 		 112 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  56.56 
 
 		 138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  58.56 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 129 aa  138  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  59.09 
 
 		 113 aa  137  8.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  54.92 
 
 		 137 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  46.63 
 
 		 179 aa  136  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0077  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148079 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  50.82 
 
 		 140 aa  136  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  57.26 
 
 		 120 aa  136  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 		 120 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 		 120 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 		 120 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 		 120 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 		 120 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 		 120 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 		 120 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 		 120 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 		 120 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 		 120 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 		 120 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  57.02 
 
 		 268 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1939  50S ribosomal protein L17  57.26 
 
 		 168 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0525  50S ribosomal protein L17  53.78 
 
 		 124 aa  135  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000217625 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  50.82 
 
 		 138 aa  135  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0355  50S ribosomal protein L17  53.78 
 
 		 124 aa  135  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  50.82 
 
 		 138 aa  135  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  54.1 
 
 		 139 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  57.8 
 
 		 112 aa  134  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  50.82 
 
 		 138 aa  134  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  52.5 
 
 		 126 aa  134  8e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 120 aa  134  8e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 131 aa  134  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1961  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  52.07 
 
 		 130 aa  133  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  52.07 
 
 		 130 aa  133  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  59.46 
 
 		 114 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  52.71 
 
 		 140 aa  134  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  51.94 
 
 		 140 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2046  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0786511  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0431  50S ribosomal protein L17P  52.14 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1918  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  55.74 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 		 131 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 130 aa  132  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  54.7 
 
 		 131 aa  132  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 132 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 129 aa  132  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>