More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1918 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_1918  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 162 aa  317  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2046  50S ribosomal protein L17  98.52 
 
 		 164 aa  246  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0786511  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1961  50S ribosomal protein L17  98.31 
 
 		 158 aa  236  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1939  50S ribosomal protein L17  88.14 
 
 		 168 aa  213  9e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  50.98 
 
 		 151 aa  147  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  57.38 
 
 		 146 aa  147  9e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  51.85 
 
 		 175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0525  50S ribosomal protein L17  58.54 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000217625 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0355  50S ribosomal protein L17  58.54 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  59.83 
 
 		 178 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  57.6 
 
 		 124 aa  142  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  55.91 
 
 		 140 aa  141  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  54.1 
 
 		 141 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  56.56 
 
 		 140 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  55.93 
 
 		 138 aa  137  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  53.12 
 
 		 140 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  52.34 
 
 		 140 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  57.26 
 
 		 168 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  52.27 
 
 		 141 aa  136  8.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  53.54 
 
 		 143 aa  136  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  53.39 
 
 		 138 aa  136  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  53.39 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  57.26 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  48.94 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1325  50S ribosomal protein L17  54.1 
 
 		 140 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.355864 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4216  ribosomal protein L17  54.2 
 
 		 132 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719281  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  55.12 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  55.12 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  55.12 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  55.12 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  55.12 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  55.12 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  55.12 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  55.12 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  56.1 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  55.74 
 
 		 137 aa  134  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  55.12 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  55.08 
 
 		 140 aa  134  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  56.1 
 
 		 129 aa  134  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  56.1 
 
 		 129 aa  134  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  56.1 
 
 		 129 aa  134  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  55.2 
 
 		 130 aa  134  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 184 aa  134  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  54.4 
 
 		 130 aa  134  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  54.4 
 
 		 130 aa  134  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4250  50S ribosomal protein L17  55.2 
 
 		 125 aa  134  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00366931  unclonable  0.00000000000172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  52.54 
 
 		 138 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 133 aa  133  8e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  55.73 
 
 		 126 aa  134  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4523  50S ribosomal protein L17  53.12 
 
 		 128 aa  133  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  52.67 
 
 		 138 aa  133  9e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  53.91 
 
 		 128 aa  133  9e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  54.33 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  54.33 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  54.33 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  54.33 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  54.33 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2143  ribosomal protein L17  51.15 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  0.318394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  55.93 
 
 		 137 aa  133  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0451  50S ribosomal protein L17  55.93 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.701542  normal  0.045023 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  51.11 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  55.08 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0652  ribosomal protein L17  52.34 
 
 		 128 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0431  50S ribosomal protein L17P  53.6 
 
 		 129 aa  132  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  50 
 
 		 128 aa  132  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  54.24 
 
 		 138 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  51.49 
 
 		 134 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  51.15 
 
 		 132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  55.08 
 
 		 138 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  57.76 
 
 		 208 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0348  ribosomal protein L17  52.03 
 
 		 126 aa  131  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  51.97 
 
 		 142 aa  130  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2190  50S ribosomal protein L17  51.69 
 
 		 136 aa  130  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.407841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  54.24 
 
 		 137 aa  130  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0515  50S ribosomal protein L17  55.93 
 
 		 119 aa  130  6e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336065 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0781  50S ribosomal protein L17  52.76 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478066  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0510  50S ribosomal protein L17  55.93 
 
 		 119 aa  130  6e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.698201  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  51.97 
 
 		 142 aa  130  6.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  51.97 
 
 		 142 aa  130  6.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  54.92 
 
 		 131 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  50.39 
 
 		 126 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  54.92 
 
 		 131 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  57.63 
 
 		 128 aa  130  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3883  50S ribosomal protein L17  52.34 
 
 		 128 aa  130  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  52.27 
 
 		 132 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  51.69 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  52.27 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  52.67 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0447  50S ribosomal protein L17  53.91 
 
 		 127 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  57.94 
 
 		 126 aa  130  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  54.92 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  54.24 
 
 		 136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06510  50S ribosomal protein L17  55.08 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04495  50S ribosomal protein L17  53.12 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0832  ribosomal protein L17  54.47 
 
 		 138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09130  50S ribosomal protein L17  55.08 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  54.92 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>