More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1939 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1939  50S ribosomal protein L17  100 
 
 
168 aa  328  3e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2046  50S ribosomal protein L17  84.21 
 
 
164 aa  215  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0786511  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1961  50S ribosomal protein L17  88.98 
 
 
158 aa  214  5e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1918  50S ribosomal protein L17  88.14 
 
 
162 aa  212  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  59.83 
 
 
178 aa  143  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  47.77 
 
 
151 aa  143  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  49.68 
 
 
175 aa  142  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  58.2 
 
 
124 aa  141  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0525  50S ribosomal protein L17  54.84 
 
 
124 aa  142  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000217625 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0355  50S ribosomal protein L17  54.84 
 
 
124 aa  142  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  56.45 
 
 
130 aa  141  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  56.45 
 
 
129 aa  140  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  56.45 
 
 
129 aa  140  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  56.45 
 
 
129 aa  140  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  57.63 
 
 
140 aa  140  7e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  56.45 
 
 
129 aa  140  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  54.84 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  54.84 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 
146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  55.65 
 
 
130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  54.69 
 
 
128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  58.12 
 
 
168 aa  139  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  52.31 
 
 
141 aa  137  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  57.26 
 
 
184 aa  136  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  57.38 
 
 
126 aa  136  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4216  ribosomal protein L17  53.03 
 
 
132 aa  136  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719281  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  53.08 
 
 
140 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 
127 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  56.3 
 
 
127 aa  135  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 
127 aa  135  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 
127 aa  135  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  53.72 
 
 
141 aa  136  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 
127 aa  135  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  51.08 
 
 
138 aa  135  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 
155 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  55.93 
 
 
139 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 
127 aa  135  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 
127 aa  135  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  55.08 
 
 
140 aa  135  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  56.3 
 
 
127 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 
127 aa  135  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 
127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  53.39 
 
 
138 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 
127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0431  50S ribosomal protein L17P  52.03 
 
 
129 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 
127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 
127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 
127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  50.72 
 
 
137 aa  134  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  47.83 
 
 
140 aa  134  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  51.54 
 
 
140 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  50.81 
 
 
126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4250  50S ribosomal protein L17  53.66 
 
 
125 aa  134  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00366931  unclonable  0.00000000000172 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  55.08 
 
 
133 aa  134  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  51.69 
 
 
138 aa  134  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  55.93 
 
 
137 aa  133  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  50.76 
 
 
132 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  51.69 
 
 
138 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  53.39 
 
 
134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  53.44 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  50.38 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  50.38 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  49.64 
 
 
138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 
127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0348  ribosomal protein L17  52.38 
 
 
126 aa  131  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  55.08 
 
 
135 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0502  50S ribosomal protein L17  54.1 
 
 
132 aa  132  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  50.85 
 
 
138 aa  132  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3416  50S ribosomal protein L17P  55.93 
 
 
131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  49.23 
 
 
141 aa  131  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  52.67 
 
 
131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  54.62 
 
 
129 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  52.27 
 
 
132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 
128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  53.39 
 
 
138 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  52.27 
 
 
132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0447  50S ribosomal protein L17  52.34 
 
 
127 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  54.62 
 
 
129 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  52.67 
 
 
131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  49.22 
 
 
128 aa  131  5e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  49.63 
 
 
136 aa  131  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  54.24 
 
 
139 aa  131  5e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1325  50S ribosomal protein L17  53.39 
 
 
140 aa  130  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.355864 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2190  50S ribosomal protein L17  47.73 
 
 
136 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.407841  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  53.39 
 
 
132 aa  130  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  49.64 
 
 
141 aa  130  9e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  52.67 
 
 
131 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  52.67 
 
 
131 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  54.47 
 
 
126 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0363  50S ribosomal protein L17  52.85 
 
 
126 aa  130  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  52.67 
 
 
131 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  52.67 
 
 
131 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2143  ribosomal protein L17  50.39 
 
 
131 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  0.318394 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0085  50S ribosomal protein L17  50.78 
 
 
128 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000013942  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0225  50S ribosomal protein L17  55.08 
 
 
131 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000697417  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0220  50S ribosomal protein L17  55.08 
 
 
131 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  52.85 
 
 
126 aa  130  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  55.08 
 
 
131 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  55.08 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0196  50S ribosomal protein L17  55.08 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00364658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>