More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2617 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 172 aa  343  7e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  73.18 
 
 		 179 aa  247  7e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  83.76 
 
 		 229 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6582  ribosomal protein L17  65.43 
 
 		 196 aa  200  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0655  ribosomal protein L17  80.17 
 
 		 178 aa  196  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.929452  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  80.17 
 
 		 197 aa  195  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  58.29 
 
 		 190 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  57.38 
 
 		 190 aa  194  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2625  ribosomal protein L17  80.17 
 
 		 168 aa  194  7e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0716  ribosomal protein L17  78.45 
 
 		 202 aa  193  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  78.63 
 
 		 222 aa  193  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  73.98 
 
 		 190 aa  189  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  50.93 
 
 		 219 aa  189  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0611  50S ribosomal protein L17  81.51 
 
 		 206 aa  188  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.595155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  74.14 
 
 		 202 aa  186  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  74.14 
 
 		 268 aa  186  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  67.94 
 
 		 170 aa  185  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  71.43 
 
 		 176 aa  183  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  67.69 
 
 		 176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  75 
 
 		 169 aa  180  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  72.41 
 
 		 202 aa  179  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  71.55 
 
 		 195 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  71.55 
 
 		 195 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  71.55 
 
 		 195 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04280  LSU ribosomal protein L17P  61.22 
 
 		 189 aa  179  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0614  ribosomal protein L17  67.97 
 
 		 181 aa  176  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  73.28 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16890  LSU ribosomal protein L17P  70.25 
 
 		 242 aa  174  4e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  71.55 
 
 		 180 aa  174  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23520  LSU ribosomal protein L17P  72.41 
 
 		 164 aa  173  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0278  ribosomal protein L17  59.46 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2939  50S ribosomal protein L17  78.45 
 
 		 196 aa  170  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75004  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4969  50S ribosomal protein L17  53 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.392078  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2654  50S ribosomal protein L17  78.45 
 
 		 190 aa  168  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1734  50S ribosomal protein L17  68.97 
 
 		 183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29450  LSU ribosomal protein L17P  63.28 
 
 		 180 aa  164  5.9999999999999996e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0149004  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3381  ribosomal protein L17  66.38 
 
 		 233 aa  162  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6021  50S ribosomal protein L17  64.6 
 
 		 195 aa  157  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79372  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  50.29 
 
 		 175 aa  147  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  61.26 
 
 		 178 aa  142  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  55.15 
 
 		 140 aa  140  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  57.48 
 
 		 184 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  59.26 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  61.26 
 
 		 168 aa  136  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  57.52 
 
 		 118 aa  135  4e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  57.66 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  56.2 
 
 		 141 aa  134  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  56.76 
 
 		 155 aa  134  8e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  58.72 
 
 		 142 aa  134  9e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  58.04 
 
 		 138 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  52.63 
 
 		 140 aa  133  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 124 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  56.76 
 
 		 140 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  57.66 
 
 		 140 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  64.65 
 
 		 144 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  44.24 
 
 		 151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  58.33 
 
 		 112 aa  131  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  55.86 
 
 		 141 aa  130  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  55.86 
 
 		 141 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  55.45 
 
 		 208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  56.76 
 
 		 139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  55.08 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  55.96 
 
 		 137 aa  128  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  56.76 
 
 		 143 aa  129  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  58.56 
 
 		 140 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  50.37 
 
 		 141 aa  128  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  55.05 
 
 		 142 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  55.05 
 
 		 142 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  55.05 
 
 		 142 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  52.1 
 
 		 140 aa  124  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  59.41 
 
 		 113 aa  123  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  54.05 
 
 		 128 aa  123  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  55.96 
 
 		 113 aa  123  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  52.68 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  56.48 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  52.1 
 
 		 136 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01460  ribosomal protein L17  49.11 
 
 		 247 aa  121  4e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.186143  normal  0.514697 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  49.29 
 
 		 134 aa  121  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  55.86 
 
 		 146 aa  120  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  43.87 
 
 		 138 aa  120  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  55.05 
 
 		 138 aa  120  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  43.87 
 
 		 138 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  49.24 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2143  ribosomal protein L17  54.05 
 
 		 131 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  0.318394 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 112 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  55.88 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  54.05 
 
 		 113 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  54.05 
 
 		 113 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2036  50S ribosomal protein L17  46.9 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000459546  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0687  50S ribosomal protein L17  58.18 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  53.21 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  55.96 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  49.6 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 120 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  54.9 
 
 		 138 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  47.69 
 
 		 138 aa  118  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  54.13 
 
 		 131 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  50 
 
 		 131 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2268  50S ribosomal protein L17  42.86 
 
 		 166 aa  117  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312187 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19700  ribosomal protein L17  47.9 
 
 		 169 aa  117  7e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00763987  normal  0.431624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>