More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3894 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  100 
 
 
190 aa  381  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  94.74 
 
 
190 aa  362  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  73.98 
 
 
229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  72.93 
 
 
170 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6582  ribosomal protein L17  60.23 
 
 
196 aa  194  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  57.38 
 
 
172 aa  194  7e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  64.14 
 
 
203 aa  189  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  77.97 
 
 
197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  65.96 
 
 
222 aa  186  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2625  ribosomal protein L17  76.27 
 
 
168 aa  184  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  73.73 
 
 
190 aa  184  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  70.73 
 
 
176 aa  184  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04280  LSU ribosomal protein L17P  66.41 
 
 
189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3407  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23520  LSU ribosomal protein L17P  72.88 
 
 
164 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  71.19 
 
 
169 aa  182  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  71.67 
 
 
179 aa  181  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  72.88 
 
 
176 aa  179  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  69.67 
 
 
219 aa  179  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0655  ribosomal protein L17  72.88 
 
 
178 aa  178  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.929452  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  68.64 
 
 
202 aa  177  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0716  ribosomal protein L17  68.64 
 
 
202 aa  173  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0611  50S ribosomal protein L17  73.98 
 
 
206 aa  173  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.595155  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0278  ribosomal protein L17  62.24 
 
 
144 aa  171  5e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  66.95 
 
 
268 aa  171  6.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  64.46 
 
 
195 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  64.46 
 
 
195 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  64.46 
 
 
195 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1734  50S ribosomal protein L17  69.49 
 
 
183 aa  166  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0614  ribosomal protein L17  62.31 
 
 
181 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  64.46 
 
 
180 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  62.81 
 
 
202 aa  162  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3381  ribosomal protein L17  60.48 
 
 
233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6021  50S ribosomal protein L17  74.8 
 
 
195 aa  161  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79372  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16890  LSU ribosomal protein L17P  55.13 
 
 
242 aa  158  4e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29450  LSU ribosomal protein L17P  59.23 
 
 
180 aa  154  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0149004  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2939  50S ribosomal protein L17  70.34 
 
 
196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75004  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2654  50S ribosomal protein L17  70.34 
 
 
190 aa  151  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4969  50S ribosomal protein L17  61.98 
 
 
199 aa  150  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.392078  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  64.36 
 
 
113 aa  139  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  57.52 
 
 
118 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  58.33 
 
 
112 aa  136  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  59.09 
 
 
114 aa  133  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  53.28 
 
 
127 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  50.4 
 
 
175 aa  128  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  56.76 
 
 
113 aa  127  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  56.76 
 
 
113 aa  127  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  60.55 
 
 
117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  52.68 
 
 
155 aa  123  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  50.89 
 
 
178 aa  123  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  53.7 
 
 
112 aa  123  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  50.91 
 
 
208 aa  122  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  46.88 
 
 
141 aa  121  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  48.84 
 
 
184 aa  120  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  48.33 
 
 
124 aa  119  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  48.36 
 
 
140 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  49.55 
 
 
143 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  51.35 
 
 
168 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  49.15 
 
 
126 aa  118  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  54.63 
 
 
112 aa  118  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  51.85 
 
 
112 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  46.72 
 
 
140 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  50.45 
 
 
112 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  51.28 
 
 
117 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  49.55 
 
 
141 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  45.83 
 
 
142 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2036  50S ribosomal protein L17  47.5 
 
 
152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000459546  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  45.83 
 
 
142 aa  116  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  45.83 
 
 
142 aa  116  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01460  ribosomal protein L17  47.06 
 
 
247 aa  115  3e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.186143  normal  0.514697 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  46.85 
 
 
141 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  47.32 
 
 
151 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  50.45 
 
 
140 aa  115  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  51.85 
 
 
113 aa  115  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  48.09 
 
 
138 aa  114  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  53.21 
 
 
113 aa  115  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 
137 aa  114  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  52.78 
 
 
112 aa  114  7.999999999999999e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0687  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 
170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  48.62 
 
 
138 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 
140 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  46.81 
 
 
138 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  49.54 
 
 
135 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2127  50S ribosomal protein L17P  48.31 
 
 
121 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0812324  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0224  LSU ribosomal protein L17P  54.08 
 
 
113 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.65294 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  52.25 
 
 
137 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19700  ribosomal protein L17  44.96 
 
 
169 aa  112  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00763987  normal  0.431624 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  43.66 
 
 
140 aa  112  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1823  50S ribosomal protein L17  39.73 
 
 
154 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0106  50S ribosomal protein L17  45.45 
 
 
133 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.188563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>