More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0716 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0716  ribosomal protein L17  100 
 
 
202 aa  400  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  64.1 
 
 
197 aa  221  6e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2625  ribosomal protein L17  76.69 
 
 
168 aa  216  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  75.94 
 
 
268 aa  206  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  75.94 
 
 
229 aa  205  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16890  LSU ribosomal protein L17P  69.34 
 
 
242 aa  202  4e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0655  ribosomal protein L17  76.61 
 
 
178 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.929452  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23520  LSU ribosomal protein L17P  74.8 
 
 
164 aa  197  9e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  62.35 
 
 
172 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  77.12 
 
 
202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0278  ribosomal protein L17  65.94 
 
 
144 aa  191  5e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6582  ribosomal protein L17  59.67 
 
 
196 aa  189  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  62.82 
 
 
203 aa  188  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  75.83 
 
 
190 aa  188  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  75.41 
 
 
169 aa  186  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0614  ribosomal protein L17  65.71 
 
 
181 aa  186  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  73.73 
 
 
219 aa  186  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29450  LSU ribosomal protein L17P  66.43 
 
 
180 aa  184  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0149004  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2939  50S ribosomal protein L17  73.13 
 
 
196 aa  184  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75004  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  63.12 
 
 
179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  65.94 
 
 
195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  65.94 
 
 
195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  65.94 
 
 
195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0611  50S ribosomal protein L17  73.68 
 
 
206 aa  181  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.595155  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2654  50S ribosomal protein L17  74.02 
 
 
190 aa  179  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  59.24 
 
 
190 aa  179  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04280  LSU ribosomal protein L17P  63.19 
 
 
189 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3407  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3381  ribosomal protein L17  54.3 
 
 
233 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  65.47 
 
 
176 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  56.57 
 
 
190 aa  174  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  66.17 
 
 
176 aa  174  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  71.19 
 
 
180 aa  174  8e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  70.34 
 
 
202 aa  174  9e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  66.67 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  66.95 
 
 
170 aa  171  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1734  50S ribosomal protein L17  68.91 
 
 
183 aa  171  6.999999999999999e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4969  50S ribosomal protein L17  49.77 
 
 
199 aa  160  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.392078  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6021  50S ribosomal protein L17  69.92 
 
 
195 aa  153  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79372  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  46.63 
 
 
178 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  51.22 
 
 
184 aa  126  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  53.1 
 
 
118 aa  124  8.000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 
175 aa  122  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2036  50S ribosomal protein L17  54.63 
 
 
152 aa  119  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000459546  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  51.72 
 
 
168 aa  119  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 
127 aa  119  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01460  ribosomal protein L17  45.45 
 
 
247 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.186143  normal  0.514697 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  46.28 
 
 
155 aa  118  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  52.78 
 
 
112 aa  117  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  57.43 
 
 
113 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2803  ribosomal protein L17  46.4 
 
 
195 aa  116  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000866699  hitchhiker  0.000000348253 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 
137 aa  115  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 
142 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  50.91 
 
 
143 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  49.07 
 
 
112 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  49.09 
 
 
208 aa  112  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 
141 aa  112  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2201  50S ribosomal protein L17  51.85 
 
 
151 aa  112  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0373281  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  46.34 
 
 
141 aa  112  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  47.97 
 
 
140 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  52.29 
 
 
140 aa  112  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  55.67 
 
 
144 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19700  ribosomal protein L17  42.86 
 
 
169 aa  112  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00763987  normal  0.431624 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2268  50S ribosomal protein L17  47.97 
 
 
166 aa  112  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0312187 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 
141 aa  111  7.000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  52.73 
 
 
114 aa  111  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  47.15 
 
 
138 aa  111  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  51.75 
 
 
137 aa  111  9e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  46.43 
 
 
151 aa  111  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  48.7 
 
 
140 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  47.46 
 
 
124 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2127  50S ribosomal protein L17P  45.83 
 
 
121 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0812324  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 
140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  49.55 
 
 
112 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0224  LSU ribosomal protein L17P  50.93 
 
 
113 aa  109  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.65294 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  47.15 
 
 
139 aa  109  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 
138 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 
140 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0687  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 
170 aa  109  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  50.93 
 
 
112 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2395  50S ribosomal protein L17  50.93 
 
 
147 aa  109  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.409682  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  47.83 
 
 
142 aa  108  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  47.83 
 
 
142 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  47.83 
 
 
142 aa  108  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0420  50S ribosomal protein L17  48.15 
 
 
127 aa  108  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  50.93 
 
 
138 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  46.34 
 
 
141 aa  108  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0317  50S ribosomal protein L17  49.07 
 
 
152 aa  107  9.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0814309  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
137 aa  107  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  47.01 
 
 
117 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  48.65 
 
 
113 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  48.65 
 
 
113 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1823  50S ribosomal protein L17  47.22 
 
 
154 aa  106  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
140 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  52.48 
 
 
136 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  50.93 
 
 
138 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1506  ribosomal protein L17  47.9 
 
 
136 aa  106  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000952918 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  49.55 
 
 
132 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  46.34 
 
 
138 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  46.67 
 
 
140 aa  105  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>