More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0611 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0611  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 206 aa  409  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.595155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6021  50S ribosomal protein L17  86.25 
 
 		 195 aa  238  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79372  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  81.75 
 
 		 229 aa  234  7e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  60.42 
 
 		 172 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6582  ribosomal protein L17  60.96 
 
 		 196 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0716  ribosomal protein L17  73.48 
 
 		 202 aa  201  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2625  ribosomal protein L17  75.19 
 
 		 168 aa  197  7.999999999999999e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  76.67 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  71.21 
 
 		 176 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  70.45 
 
 		 268 aa  191  5e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  69.92 
 
 		 190 aa  191  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  73.98 
 
 		 190 aa  191  6e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0655  ribosomal protein L17  79.31 
 
 		 178 aa  191  7e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.929452  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  78.45 
 
 		 197 aa  189  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04280  LSU ribosomal protein L17P  67.15 
 
 		 189 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  58.86 
 
 		 203 aa  188  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  73.95 
 
 		 170 aa  187  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  71.32 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  75.86 
 
 		 169 aa  185  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  66.17 
 
 		 195 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  66.17 
 
 		 195 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  66.17 
 
 		 195 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  71.55 
 
 		 202 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  68.57 
 
 		 222 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  75.86 
 
 		 190 aa  182  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  67.77 
 
 		 202 aa  177  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23520  LSU ribosomal protein L17P  69.05 
 
 		 164 aa  177  7e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16890  LSU ribosomal protein L17P  65.65 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  67.77 
 
 		 180 aa  176  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0278  ribosomal protein L17  63.91 
 
 		 144 aa  174  9e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  72.41 
 
 		 176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0614  ribosomal protein L17  62.32 
 
 		 181 aa  171  5.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3381  ribosomal protein L17  50.51 
 
 		 233 aa  170  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1734  50S ribosomal protein L17  70.69 
 
 		 183 aa  169  3e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29450  LSU ribosomal protein L17P  60.14 
 
 		 180 aa  166  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0149004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4969  50S ribosomal protein L17  68.6 
 
 		 199 aa  165  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.392078  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2939  50S ribosomal protein L17  69.17 
 
 		 196 aa  162  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75004  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2654  50S ribosomal protein L17  70.63 
 
 		 190 aa  159  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  54.95 
 
 		 178 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  40.74 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  54.05 
 
 		 155 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  54.87 
 
 		 118 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  53.7 
 
 		 112 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  54.05 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  54.95 
 
 		 141 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  54.95 
 
 		 141 aa  126  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  54.05 
 
 		 168 aa  126  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  55.05 
 
 		 137 aa  122  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  52.25 
 
 		 127 aa  122  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  52.73 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  52.29 
 
 		 142 aa  121  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  48.78 
 
 		 140 aa  121  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  56.57 
 
 		 144 aa  121  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  50.89 
 
 		 140 aa  121  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  51.79 
 
 		 138 aa  121  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  52.25 
 
 		 143 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  52.25 
 
 		 140 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  51.38 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  53.15 
 
 		 112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 124 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  57.43 
 
 		 113 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  52.29 
 
 		 142 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  52.29 
 
 		 142 aa  118  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  52.29 
 
 		 142 aa  118  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  50.46 
 
 		 140 aa  118  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  49.55 
 
 		 141 aa  118  7.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  53.21 
 
 		 138 aa  117  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01460  ribosomal protein L17  45.3 
 
 		 247 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.186143  normal  0.514697 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  54.63 
 
 		 113 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  50.45 
 
 		 141 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  48.18 
 
 		 151 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  42.59 
 
 		 183 aa  115  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  51.2 
 
 		 140 aa  115  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0687  50S ribosomal protein L17  55.45 
 
 		 170 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2509  50S ribosomal protein L17  53.21 
 
 		 139 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.745035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1506  ribosomal protein L17  50.89 
 
 		 136 aa  114  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952918 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  48.65 
 
 		 139 aa  113  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 138 aa  112  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  52.29 
 
 		 139 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  49.54 
 
 		 138 aa  112  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  52.29 
 
 		 139 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  49.55 
 
 		 140 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  49.54 
 
 		 141 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  51.35 
 
 		 113 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  51.35 
 
 		 113 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  50 
 
 		 112 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  48.65 
 
 		 128 aa  111  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  51.38 
 
 		 114 aa  111  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  49.54 
 
 		 113 aa  111  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  46.43 
 
 		 138 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2190  50S ribosomal protein L17  48.21 
 
 		 136 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.407841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  46.43 
 
 		 138 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  48.62 
 
 		 136 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2878  ribosomal protein L17  50 
 
 		 118 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  46.61 
 
 		 126 aa  109  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  49.55 
 
 		 146 aa  109  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  49.55 
 
 		 134 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  51.96 
 
 		 140 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  47.71 
 
 		 138 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05855  putative 50S ribosomal protein L17  49.11 
 
 		 156 aa  108  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>