More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1716 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 113 aa  228  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  64.22 
 
 		 112 aa  144  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  64.36 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  58.41 
 
 		 113 aa  138  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  58.41 
 
 		 113 aa  138  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  64.36 
 
 		 190 aa  138  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  61.39 
 
 		 170 aa  133  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  58.72 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  61.47 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0224  LSU ribosomal protein L17P  55.96 
 
 		 113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.65294 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  56.88 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  60.4 
 
 		 229 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  56.88 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  54.46 
 
 		 124 aa  126  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  60.4 
 
 		 179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  56.88 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  53.98 
 
 		 113 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  55.96 
 
 		 112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  57.8 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  62.38 
 
 		 203 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  61.39 
 
 		 197 aa  124  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  59.41 
 
 		 172 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  55.05 
 
 		 178 aa  122  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  59.22 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  59.22 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  59.22 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2682  ribosomal protein L17  57.63 
 
 		 121 aa  120  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0293066  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 120 aa  120  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  57.43 
 
 		 202 aa  120  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  55.05 
 
 		 114 aa  120  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  58.42 
 
 		 190 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  51.85 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23520  LSU ribosomal protein L17P  58.42 
 
 		 164 aa  118  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  50.46 
 
 		 113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  53.21 
 
 		 168 aa  118  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  51.38 
 
 		 113 aa  117  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2625  ribosomal protein L17  57.43 
 
 		 168 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  58.42 
 
 		 176 aa  117  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  56.48 
 
 		 180 aa  117  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0716  ribosomal protein L17  57.43 
 
 		 202 aa  117  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  54.13 
 
 		 184 aa  117  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  55.45 
 
 		 268 aa  116  7.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1804  50S ribosomal protein L17  55.46 
 
 		 122 aa  116  7.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23271  50S ribosomal protein L17  52.25 
 
 		 116 aa  116  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  49.54 
 
 		 151 aa  116  9e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  55.45 
 
 		 222 aa  115  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17261  50S ribosomal protein L17  51.4 
 
 		 116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0716  50S ribosomal protein L17  49.11 
 
 		 116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000127542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  58.25 
 
 		 202 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  51.79 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16541  50S ribosomal protein L17  51.85 
 
 		 116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.173204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  52.29 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  55.45 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  50.46 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1456  50S ribosomal protein L17  49.59 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714244  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  52.29 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 132 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2878  ribosomal protein L17  52.63 
 
 		 118 aa  114  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  51.38 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  50.93 
 
 		 208 aa  114  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  52.29 
 
 		 132 aa  114  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0627  50S ribosomal protein L17  53.21 
 
 		 134 aa  114  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  52.29 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  52.29 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0225  50S ribosomal protein L17  52.29 
 
 		 131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000697417  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0220  50S ribosomal protein L17  52.29 
 
 		 131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  52.29 
 
 		 131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  55.45 
 
 		 219 aa  113  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  51.38 
 
 		 132 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2250  50S ribosomal protein L17  53.78 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0379029  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0278  ribosomal protein L17  50.93 
 
 		 144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  57.43 
 
 		 176 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2291  50S ribosomal protein L17  53.78 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17421  50S ribosomal protein L17  50.47 
 
 		 116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0655  ribosomal protein L17  55.45 
 
 		 178 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.929452  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04280  LSU ribosomal protein L17P  53.47 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  52.29 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0352  50S ribosomal protein L17  49.55 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1627  50S ribosomal protein L17  50.47 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  50 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  52.29 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  50.46 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  52.29 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  50.46 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  52.29 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17161  50S ribosomal protein L17  49.53 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1979  50S ribosomal protein L17  49.55 
 
 		 116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.205513  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  48.62 
 
 		 130 aa  110  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1105  50S ribosomal protein L17  46.85 
 
 		 116 aa  110  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19801  50S ribosomal protein L17  46.85 
 
 		 116 aa  110  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  48.62 
 
 		 130 aa  110  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 131 aa  110  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 120 aa  110  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 120 aa  110  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 120 aa  110  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 120 aa  110  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 120 aa  110  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0174  50S ribosomal protein L17  50.46 
 
 		 131 aa  110  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000106796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>