More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1546 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  100 
 
 		 113 aa  229  1e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  62.83 
 
 		 113 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  62.83 
 
 		 113 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  63.3 
 
 		 112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  61.47 
 
 		 116 aa  138  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  59.63 
 
 		 112 aa  135  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  60.55 
 
 		 112 aa  134  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  58.72 
 
 		 113 aa  133  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 120 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  55.75 
 
 		 113 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  56.88 
 
 		 124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  53.64 
 
 		 114 aa  127  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  55.96 
 
 		 112 aa  127  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  55.05 
 
 		 178 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0224  LSU ribosomal protein L17P  55.96 
 
 		 113 aa  126  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.65294 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  55.96 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1256  50S ribosomal protein L17  56.48 
 
 		 161 aa  124  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  0.275749 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  54.13 
 
 		 151 aa  124  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  54.13 
 
 		 175 aa  123  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1804  50S ribosomal protein L17  54.62 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  53.21 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  52.29 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  55.96 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  54.13 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0085  50S ribosomal protein L17  53.6 
 
 		 128 aa  120  5e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0996581  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2250  50S ribosomal protein L17  54.62 
 
 		 122 aa  120  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0379029  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2291  50S ribosomal protein L17  54.62 
 
 		 122 aa  120  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  54.13 
 
 		 184 aa  120  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0342  ribosomal protein L17  53.39 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1456  50S ribosomal protein L17  52.03 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714244  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1009  50S ribosomal protein L17  49.54 
 
 		 116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000240801  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  50.46 
 
 		 113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1880  50S ribosomal protein L17  52 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  56.88 
 
 		 117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0222  50S ribosomal protein L17  51.22 
 
 		 127 aa  116  9e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2127  50S ribosomal protein L17P  50.46 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0812324  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0317  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.09582e-21 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  48.62 
 
 		 141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01348  50S ribosomal protein L17 (AFU_orthologue; AFUA_1G09410)  51.33 
 
 		 211 aa  110  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  50.46 
 
 		 140 aa  110  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2038  ribosomal protein L17  50.91 
 
 		 132 aa  110  6e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0128526  hitchhiker  0.000448232 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  54.64 
 
 		 144 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2748  ribosomal protein L17  48.62 
 
 		 138 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.727707  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0792  50S ribosomal protein L17  50.47 
 
 		 179 aa  110  9e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  51.38 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl151  50S ribosomal protein L17  48.74 
 
 		 119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.405073  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  46.79 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_445  ribosomal protein L17  51.38 
 
 		 117 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2682  ribosomal protein L17  46.61 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0293066  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  49.54 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23271  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 116 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  47.71 
 
 		 139 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0503  50S ribosomal protein L17  51.38 
 
 		 117 aa  107  5e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000331122  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  46.79 
 
 		 137 aa  107  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  51.38 
 
 		 131 aa  107  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1738  50S ribosomal protein L17  48.62 
 
 		 133 aa  107  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0480  50S ribosomal protein L17  49.54 
 
 		 117 aa  107  6e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000309842  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  50.46 
 
 		 132 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  50.46 
 
 		 117 aa  107  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  50.46 
 
 		 132 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0716  50S ribosomal protein L17  47.71 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000127542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  47.71 
 
 		 141 aa  105  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  47.22 
 
 		 179 aa  106  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0621  50S ribosomal protein L17P  45.67 
 
 		 131 aa  105  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  45.45 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  49.07 
 
 		 208 aa  105  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  48.62 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  49.54 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  47.71 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2878  ribosomal protein L17  52.73 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2987  50S ribosomal protein L17  50.93 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  50.91 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  44.95 
 
 		 142 aa  104  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  47.71 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  45.37 
 
 		 229 aa  105  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  49.54 
 
 		 131 aa  104  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  45.87 
 
 		 141 aa  104  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1939  50S ribosomal protein L17  47.71 
 
 		 168 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  49.54 
 
 		 131 aa  104  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  45.87 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  46.79 
 
 		 137 aa  103  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0788  50S ribosomal protein L17  38.51 
 
 		 174 aa  104  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00196591  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  45.87 
 
 		 138 aa  104  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0352  50S ribosomal protein L17  50.46 
 
 		 116 aa  104  5e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1317  50S ribosomal protein L17  48.15 
 
 		 116 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362692  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  49.54 
 
 		 132 aa  103  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2230  50S ribosomal protein L17  48.62 
 
 		 162 aa  103  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025919  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  47.71 
 
 		 132 aa  103  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>